沿海深海微生物组学见解在不断变化的环境

沿海远洋海域是效率最高的地区之一,有一个关键的角色在地球碳循环。微生物生活在这个生态系统奠定基础,支持不同的栖息地包括河口、珊瑚礁、红树林、海草和岩石海滩。如今,这些微生物包括细菌、古细菌、微藻,病毒已经面临生存和扩散的风险更高。因为沿海水域接收大量的人为输入的营养物质,有限公司₂,塑料微粒污染物如重金属和抗生素,这些结合等全球变化未来沿海水域的海洋变暖和酸化使环境变得更严厉的微生物,造成多个压力(如:温度升高,富营养化,酸化,增加光强,紫外线损伤,和各种污染物)。反过来,他们的代谢反应和反馈的群落结构和交互网络影响沿海生态系统的健康,并最终影响这个系统提供的商品和服务。目前,文化无关的技术,如扩增子测序、宏基因组,metatranscriptomics,宏蛋白质组学有极大地增强了我们对自然的理解微生物群落组成和功能两个层面。这些omics-based原位调查结合实验室实验将提高我们理解全球变化对微生物生态学的影响在沿海深海生态系统。

该研究课题旨在揭示微生物从物种水平社区如何应对或适应不断变化的环境中在沿海深海水域。的话题主要集中在应用组学方法(基因组或宏基因组,转录组/ metatranscriptomic,蛋白质组学/ metaproteomic或代谢组学/ metabonomic)提供短期反应和长期适应实验室培养的物种或原位社区环境压力由于人为活动和/或全球的变化。

原始研究的文章和评论都邀请到造成这一研究课题,其中可能包括但不限于:

•理解在物种水平:沿海浮游微生物新陈代谢调整针对单个或多个环境压力;代谢调整后,这一物种的沿海水域的长期适应环境变化。

•在社区层面理解:提供证据的微生物群落组成和功能的变化作为沿海环境的变化;确定环境驱动程序;预测未来趋势的微生物群落在沿海水域。

•理解微生物连接:记录不同的微生物物种和提供分子之间的相互作用机制;确定环境因素塑造这些关系在当前沿海水域;评估在未来沿海环境改变微生物的相互作用。

关键字:沿海深海生态系统微生物的方法,使分子机制、全球变化、微生物的相互作用

重要提示:所有贡献这个研究课题必须的范围内的部分和期刊提交,作为其使命声明中定义。雷竞技rebat前沿有权指导检查手稿更适合部分或同行评审的期刊在任何阶段。