比较和细胞器基因组进化分析

完整的细胞器基因组测序已经成为一种常见的和强大的方法来生成大量的数据有可能探索基因组进化谱系。细胞器基因组也有用重建系统发育关系,细胞器之间比较的分子进化率,检测基因重组和基因选择压力。考虑到越来越多的出版细胞器基因组在过去几年,现在可以执行大规模使用成百上千的类群进行比较分析,综合分析和提供了一个框架可以检测细胞器之间的差异在系统发育信号。细胞器基因组也可以用于提取常见的条形码区域能够补充数据矩阵包括大量的物种基因组数据。

近年来,成千上万的研究已经发表了描述细胞器基因组从动物、植物、和其他生物使用各种方法来组装、注释和分析。我们的目标在这个特殊的问题是编译研究描述细胞器基因组应用不同的方法和分类尺度学习当前的趋势和总结最常见的和准确的技术进行这些分析。

本研究课题旨在促进出版的研究描述细胞器基因组广泛的进化框架内。可以格式化的原始研究手稿,简短的研究报告,系统评价,迷你评论,意见和观点。提交出版代表了高质量的工作不应该被考虑。手稿从任何有机体可以描述细胞器基因组。提交描述单一细胞器基因组将不考虑发表。研究non-model物种特别受欢迎。主题包括,但不限制,:

•描述多个细胞器代表不同的类群,尤其是non-model物种和类群未包含在分子研究或从研究区域。
•全面分析比较细胞器基因组。
•连接基因组特征和因素促进适应性、表型变化,多元化发展。
•比较评估的基因结构。
•评估系统信号从不同的细胞器之间的一致性。
•检测基因的选择压力。
•建筑的发展史从全基因组或多基因数据集的系统误差。
•系统或人口研究基于整个细胞器基因组。
•新方法或管道的特点和/或分析细胞器基因组。
•评估方法来描述,注释和/或分析细胞器基因组。