RNA病毒在时间和空间上的旅程:宿主因素，驱动力和转移适应度

最近出现的严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)突出表明，动物病毒是人类流行病的重要来源。通常，病毒、宿主和环境因素会影响进化和传播动力学。因此，监测导致传染病出现的病毒基因变化至关重要。病毒基因组测序和系统动力学分析在监测引起流行病和具有大流行潜力的动物和人类RNA病毒的循环多样性、进化史、传播动态和基因组流行病学方面具有重要价值。系统动力学允许整合多种因素，包括地理、宿主、免疫和临床观察，这些因素可能有助于观察到的动力学，因此是一种旨在提供更清晰和更全面的潜在病毒机制视角的工具。

免疫功能低下的人和经常与动物接触的人，允许病毒适应和出现传染病的风险增加。但是，对这些关键人口的相对重要性以及儿童或结构上处于不利地位的人口的作用的描述仍然很少。为此，需要采取协调一致的方法来探索疾病出现的基本原则，包括评估导致人畜共患病的动物和人类的环境、病毒和宿主因素，以便为公共卫生政策提供信息，以预防这些新出现的事件和/或在流行病的早期阶段遏制它们。

随着宿主、病毒基因序列数据和相关患者元数据的继续收集，稳健和创新的方法将加强(i)对动物-人双向传播的监测，特别是在高风险接口，(ii)对大型数据集的分析，并利用基因组和流行病学监测的数据流，除了免疫协变量(iii)整合宿主间的变异，以提高导致病原体进化增加的机制的系统发育分辨率，以及(iv)整合临床数据，以揭示影响健康结果的病毒遗传变异，都将继续发展。要深入了解这些方面，可能需要开发新的生物信息学管道和计算模型，以推进RNA病毒疾病的系统动力学研究。

本前沿研究雷竞技rebat课题“RNA病毒在时间和空间中的旅程:宿主因素、驱动力和适应度的变化”旨在从进化史和传播动力学的重建中获得见解，探讨与动物、人类宿主遗传因素有关的不相称的全球传播，以及公共卫生干预措施如何在各种情况下影响RNA病毒的传播。这将有助于拓宽对参与RNA病毒出现、适应和形成的关键宿主、病毒和环境因素的理解，并最终有助于加强全球卫生安全。对该前沿研究主题的响应可能寻求解决以雷竞技rebat下主题的任何或组合:

i)动物和人类RNA病毒的进化史、传播动力学和基因组流行病学;

㈡针对新出现的传染病的“同一个健康”观点;

iii)利用数据流和开发基因组流行病学管道的进展。

关键字: RNA病毒，宿主因素，驱动力，适应度变化，病毒进化史，公共卫生干预

重要提示:所有对本研究主题的贡献必须在其所提交的章节和期刊的范围内，如其使命声明中所定义的那样。雷竞技rebat在同行评审的任何阶段，Frontiers保留将超出范围的稿件引导到更合适的章节或期刊的权利。