高度连续的植物基因组组装和转录调控

高度连续的参考基因组序列是基因组学研究和植物物种优化利用的前提。然而，全基因组复制事件和随后的染色体重排和丢失塑造了植物基因组的复杂特征和广泛的多样性，并阻碍了它们高度连续的组装。随着单分子长读测序技术的出现，如PacBio高保真(HiFi)和Oxford Nanopore technologies (ONT)，以及Bionano基因组学和高通量染色质构象捕获(Hi-C)，许多高度复杂的染色体水平基因组已经被揭示，甚至是分期单倍型。这些先进的测序技术，加上组装方法的改进，极大地提高了组装基因组的质量。
转录组学和代谢组学在遗传变异和功能基因的研究中发挥着越来越重要的作用，并使其与其他组学研究相结合。例如，在植物抗逆性研究中，应用转录组学和代谢组学技术，可以全面、动态地检测植物基因/代谢物表达在胁迫下的时空变化，“挖掘”功能基因，分析胁迫响应背后的调控机制，为育种抗逆性品种提供分子遗传学基础。

本课题主要研究基因组序列分析领域的最新进展。我们特别鼓励以下领域的研究:(1)基于高度连续的基因组组装的植物协同进化、适应性进化和基因功能;(2)基于新的共表达网络算法的植物胁迫耐受性和形态发育。

我们欢迎提交植物基因组组装和共表达网络算法的原创研究文章、方法、综述和小型综述。本主题涵盖但不限于以下主题:
•高度连续的基因组组装，为植物进化和适应提供了新的见解。
•新植物基因组组合揭示的功能基因和调控网络的进化。
•多组学研究，调查植物对非生物胁迫(如干旱、极端温度和盐胁迫)反应的分子机制。
•共表达网络算法，研究调节植物重要性状形态发生的关键基因。