3 d基因组学:下一代基因组变异解释利用结构和系统生物学

解释如何一个人的基因组通知卫生保健决策或导致疾病仍然是最引人注目的承诺后基因时代。随着基因组测序,粗略的人类遗传变异的数量正在迅速增加。大多数基因变异太罕见的机制研究和缺乏证据。临床解释这些变体是具有挑战性和主要结果在不确定的结论。新方法的能力的机械化造型基因变异在种群规模是必要的。3 d基因组学是一个新的学科,它结合了传统基因组学基础和转化科学、生物化学、生物物理学、生物学、网络,以满足这一需要。3 d基因组学关注组织基因组、蛋白质结构和功能基因组学使用数学、统计、分子模拟、机器学习和人工智能生成信息,提高传统基因组学和改善预测模型。

几乎所有的计算工具开发解释基因组变异依赖基因组线性表示。然而,蛋白质三维动态分子与功能和监管性质,目前不可以预测的序列。同样,改变基因调控基因变异可以调节基因表达,复杂的生物效应。为了揭开这种级别的复杂性,系统生物学方法模仿细胞反应基因变异。进一步推进这一领域,3 d基因组超越的线性研究基因组变异和遗传变异的3 d和4 d模型集成在蛋白质和其他不同的生物分子结构与现有的学科。这样跨学科方法将提高我们理解如何组织和身体系统整合每一层的信息,导致生理和病理变化失调。这个研究课题的目标是探索方法和方法通知3 d基因组学领域的机械的和系统性的解释遗传变异。

这个研究课题收集出版物关注新兴转型方法结合传统的生物信息学和计算生物物理和生物化学。目的将不仅更好的分类变量也将机械的信息基因变异的解释,目前临床工作流缺席。
各级研究集中在模拟人类基因组的决议(如原子、分子、域、通路,核,细胞,组织,器官,组织,社区)范围内。考虑最近的实验和计算方法的进步,这个研究课题的重点是互补的分子建模和系统生物学的方法作为驱动力,继续塑造下一代基因组学解释。
具体包括,但不限于,主题是:
•利用方法和应用:
o蛋白质结构来解释基因变异
o核结构或染色质重塑来解释基因变异
o集成多个生物尺度和数据类型
•知识聚合和管理方法来理解基因功能
•Multi-tissue遗传变异的影响
•大规模功能基因组学
•预测基因组学建模

关键字:基因组学、功能基因组学、表观基因组学、精密医学、分子模拟、系统生物学、蛋白质科学、基因数据解释

重要提示:所有贡献这个研究课题必须的范围内的部分和期刊提交,作为其使命声明中定义。雷竞技rebat前沿有权指导检查手稿更适合部分或同行评审的期刊在任何阶段。