机遇和挑战在重用公共基因组数据

基因组学数据积累在公共存储库以不断增加的速度。大财团和个人实验室都在继续调查动物和植物组织和细胞文化,生成大量的数据建立和使用新技术。

在这个系列中,我们将引起该领域的研究人员的观点和视角重用公共基因组数据的机遇和挑战。我们的贡献者将独特的定位评论成功地将公共数据集成到研究项目和突出活跃的领域研究,使这项工作成为可能。

无限的机会存在基因组数据的使用和重用。全球研究人员筛选和大型数据集出版小说研究,以测试假说和再分析数据使用创新的方法。一些专注于策划小但类似的数据集来增加他们的分析的力量。结合一些数据类型相同的模型,同时研究其生物学的不同方面。其他工作使大量的数据可用性和可访问。这并不是说没有与这些工作相关的挑战。需要管理、处理和可访问性只是几个例子的许多挑战。

这个主题强烈欢迎,但不仅限于,提交意见和观点的文章。我们欢迎关注的文章,但不限于,以下主题:

•数据我们有兴趣?
例如:大型财团的数据集,策划出版的研究数据,数据集优化的重用和共享

•公共数据集使用怎么样?
例如:测试小说思想,应用不同的方法,来建立数据来提高分析能力,结合超过一种类型的数据,提供数据访问和在不同的格式

•有助于重用公共数据集的努力谁?
例如:人牧师数据从数据存储库来构建模型,让他们可以在数据库和应用程序;人处理大型数据集,使输出供他人轻松访问;人管理数据和注释中心补充数据存储库;提出了数据访问现成的格式;编写软件,连接到数据存储库的人通过“R”等工具改善;提倡和鼓励研究的人使用公共数据和工作强调成功的应用程序