人为环境变化对动物肠道菌群的影响

人类活动现在公认是当代环境变化的主要驱动力。而人为改变的后果在人口和物种水平都被记录在案,对种间相互作用的影响不太理解。动物宿主之间的相互作用及其相关微生物最近收到越来越多的关注在全球变化的背景下。这种关注是由公认的微生物对宿主健康的重要性,自适应的潜力,以及积累的证据表明,这类微生物群落至少部分由宿主的环境。支持,host-associated微生物最近被证明随几个关键组件等全球变化的栖息地的退化和破碎,城市化、气候变化和污染。然而,研究调查这些影响在自然种群仍然稀缺,我们对过程的理解仍然有限。

本研究课题的目的是汇集一批文章调查是否以及在多大程度上人为环境扰动引起的变化host-associated微生物在野生动物。我们特别鼓励研究,包括主机条件/健身措施为了1)检测主机condition-dependent微生物群落变化和/或2)确定微生物的作用在调节宿主反应环境扰动,通过增加或减少直接对宿主产生不利影响。我们也欢迎研究超越16 s rRNA扩增子测序,通过合并互补的功能分析微生物(基因变体、meta-transcriptomic或代谢组分析),因此方法尤其相关地址诱导微生物变化的影响主机健身和自适应的潜力。

我们恳求原始研究的文章使用观测或实验(或结合)方法,评估各种驱动的全球变化的影响不全面的列表(见下文)host-associated细菌社区(肠道、皮肤、羽毛、腺体、生殖等)不同的动物宿主(脊椎动物和无脊椎动物)物种在自然种群。我们也欢迎评论、评论和观点。

司机的全球变化/人为扰动,可能被认为是:
•改变土地、淡水和海洋使用(农业、城镇化、森林砍伐、水产养殖和海水养殖,富营养化,等等),或者修改栖息地
•气候变化(温度、降雨雪等)。
•空气、土壤和水的污染(气体、颗粒物、农药、肥料、各种化学物质、重金属、抗生素、微nano-plastics,放射性污染,等等)。
•侵入性外来物种/病原体,群落结构和食物资源的人为修改

潜在的主题包括(简单列表):
•结合扰动对host-associated微生物群(添加剂或交互效应)
•比较微生物对宿主身体的扰动在几个部分或两个或两个以上的宿主种类
•影响主机特征/特征的调制的影响,人为改变微生物/理直接环境和间接host-mediated对微生物的影响
•Host-associated微生物结构和多样性作为一种人为的生物学指标和/或环境扰动
•主机表型和代谢的微生物作为中介可塑性,调节宿主适应性地应对环境变化的能力
•角色host-associated修改选择压力和适应过程中微生物在宿主种群和更一般的eco-evolutionary动力学