作物改良的新一代测序的时代

来养活不断增长的世界人口,全球粮食生产必须大幅增加。这正变得越来越有挑战性,即将到来的全球气候变化的威胁,尤其是非生物压力的事件,如干旱、热量和盐度预计增加很快。全球气候变化也会影响plant-biotic交互。此外,现代化不发达和发展中国家预计将减少可用土地农业用途。因此,要实现农业的可持续发展,必须生产更多的食物而不使用额外的土地和其他有价值的资源,其中包括水。这些需要应该开发新颖的、快速的和健壮的作物改良方法,补充传统的植物育种方法。

作物改良策略来应对未来的挑战需要说明潜在的基因和基因调控网络。下一代测序成本的减少和新颖的测序方法的出现,如读测序技术(例如,PacBio,牛津纳米孔,和其他人)正在以前所未有的速度转变农业研究在涡轮增压开设大量的机会作物改良计划。最近新一代测序技术的进步将继续在未来的作物改良工作中发挥关键作用。然而,基因技术的进步并没有穿制服的全球。因此,现在有关编译一组最近进步领域的结构,功能,和比较基因组学和作物改良的相关性,所以传播到更广泛的受众。

本研究主题欢迎原始研究的文章,本文的文章,长篇评论文章、观点、意见、论文方法,假设,理论论文。我们欢迎提交相关的文章结构的各个方面,功能,和比较植物基因组学,包括以下(但不限于)研究主题:

——新一代测序方法阐明基因表达的规定(包括转录、转录后,平移,翻译后,监管和表观遗传水平)与不同的发育和生理过程(包括非生物和生物胁迫的响应)在不同作物(如粮食作物、蔬菜、水果、根作物、饲料作物、特色作物,和其他人)。

——使用比较基因组学支撑植物进化的分子基础流程,快速有效地识别进化保守的基因主要发育和生理过程的调节。

——使用读测序技术挖掘非生物和生物胁迫的响应的分子基础。

——新颖的生物信息学工具和数据库的开发援助结构,功能,比较植物基因组学研究。

——作物改良使用genomics-enabled植物育种方法(包括但不限于重测序,GWAS QTLseq, eQTL, metabolite-level协会研究,和其他人)。