最新进展和应用分子模拟在Protein-Ligand和蛋白复合物

分子模拟是一个重要的工具,包括理论和计算方法模型或模拟分子系统的行为。是非常有用的理解结构活性关系的基本概念、各种化学和物理过程,以及帮助阐明药物之间的相互作用机制和目标蛋白质。在一个更广泛的观点,分子模拟可以通过分子力学(毫米)是基于经典力学(CM)和考虑原子核之间的相互作用的分子,也可以是通过量子力学(QM)的使用,使用从头开始方法或半经验方法,帮助解决问题在各个领域如在材料科学、物理、生物学、药学和化学计算。

分子对接和thermodynamic-based分子动力学(MD)模拟在硅药物发现重要的工具箱。分子对接的方法,使用绑定模式的小分子或大分子接触蛋白受体在原子水平。MD模拟技术提供了一个重要的补充与对接。这些方法是有利的在评估protein-ligand的结构特点,蛋白质,protein-nucleic酸和蛋白质肽复合物。分子模拟方法是现在常用调查结构;动力学;表面性能;和热力学的无机、生物和聚合系统。研究了使用的类型的生物活性分子模型包括:蛋白质折叠;酶催化; protein stability; conformational changes associated with biomolecular function; and molecular recognition of proteins, DNA, and membrane complexes.

本研究课题旨在收集最近的报告进展的生物信息学和分子模型对结构与活性关系的理解。我们欢迎原始研究,审查,迷你评论和观点文章调查protein-ligand和蛋白复合物在以下主题:
•新分子的结构和性质预测系统。
•密度泛函理论(DFT)调查的分子。
•共价键和非共价相互作用的分子结构。
通过计算工具•药物设计和交付。