全基因组的识别洋麻纤维WRKY基因家族和镉胁迫下的表达分析

• ¹韧皮纤维作物研究所、中国农业科学院、中国
• ²生命与环境科学学院、湖南大学艺术与科学,中国湖南常德

镉(Cd)污染农田危及粮食安全。洋麻可以用来纠正Cd-contaminated农田。探索机制木槿cannabinus Cd(洋麻)反应压力,我们确定了洋麻纤维WRKY基因家族使用HMMER和爆炸的软件,搜索本地参考蛋白质数据库,检查了WRKY守恒的域。ExPasy网站被用来获取基本信息确认HcWRKY基因,然后映射到使用TBTOOLS软件洋麻纤维染色体。结果表明,33 HcWRKY家族基因不均匀地分散在12染色体(对应1、2、3、4、5,6,7,8,9,10,17日和18)。物理和化学性质,如氨基酸,分子量,和理论等电点,每个基因家族的成员,不同。系统发育分析表明,33 HcWRKY蛋白质被分为四组:第四组II和组只包含洋麻纤维WRKY;和组我和III包含HcWRKY和AtWRKY蛋白质。HcWRKY基因的表达特征进行了分析使用定量实时PCR(存在)。结果表明,探测HcWRKY家庭成员都是既定的表达和显示不同的Cd应力下的表达谱。 Among them, 23 HcWRKY genes exerted a positive regulatory effect on kenaf response to Cd stress, with only one HcWRKY gene exerting a negative regulatory effect. This is an important factor that contributes to the strong tolerance shown by kenaf plants under Cd stress. This study provides valuable information about the mechanism during kenaf responding to Cd stress and provides a solid foundation for further exploration of the biological function of HcWRKY proteins in kenaf.