观点文章

前面。性研究。,23December 2022
秒。病毒多样化和演化
卷2 - 2022 | https://doi.org/10.3389/fviro.2022.1077155

新的全球威胁的小说SARS-CoV-2变异的XBB BF.7, BQ.1, BA.2.75, BA.4.6”:一个讨论

野生动物k Mohapatra ^{1 * __},

艾哈迈德·马哈尔 ^{2、3 *},

LV Simhachalam Kutikuppala ⁴,

Madhumita朋友⁵,

Venkataramana Kandi ^{6 *},

阿施施k Sarangi ⁷,

艾哈迈德·j·Obaidullah ⁸和

Snehasish Mishra ⁹

¹化学系、政府工程学院帕,Odisha、印度
²医学生物化学分析、卫生技术学院Cihan University-Erbil,埃尔比勒,伊拉克的库尔德斯坦地区
³广州HC制药有限公司,广州,中国
⁴普通外科学系博士正常健康科学大学关系维杰亚瓦达,印度安得拉邦
⁵电气工程系、政府工程学院帕,Odisha、印度
⁶微生物学系Prathima医学科学研究所,Karimnagar Telangana、印度
⁷应用科学学院化学系,百夫长技术和管理大学Odisha,印度
⁸药品化学、药学院、沙特国王大学,利雅得,沙特阿拉伯
⁹生物技术学院KIIT Deemed-to-be-University,布巴内斯瓦尔,印度Odisha

介绍

尽管大量的预防和治疗措施在时尚最近的爆发流行,这部小说SARS-CoV-2(严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2)持续发展更为重要和传染性变异(1,2)。归因于促进传播的原因包括,其中,低的疫苗接种率,过度拥挤无视社会距离,遵守个人卫生差屏蔽和手,和增加免疫缺陷和易感人群。这种情况下有利于病毒复制和突变导致风险增加小说的出现变异(3)。据称ο突变体主要有改变峰值蛋白质,促进逃税的先天免疫功能从而n个人包括接种疫苗的渲染ο及其个亚系更多的传染性(4,5)。当前使用的疫苗不一定限制感染,因此可能不会限制传输,从而必然导致变异的出现(6)。ο变体目前最主要SARS-CoV-2变体完全取代所有之前的变体,其中,α,β,γ和δ。独特的突变ο变体在受体结合域(RBD)增强病毒的传播性以及它的免疫逃避机制。变异的突起蛋白能提供抵抗疫苗接种和单克隆抗体(mAb)治疗(7)。大多数可用马伯治疗目标SARS-CoV-2早些时候的突起蛋白变体。最新ο变异和无数个亚系明显有显著改变峰值蛋白质突变,疫苗和马伯的功效是有问题的。USFDA推荐使用Bebtelovimab / Etesevimab对最近的证明效力ο个亚系包括BA.1.1 BA.2, BA.4 BA.5。然而,Bebtelovimab不可用在美国之外,还有其功效对XBB BQ.1及其后代仍有待确认(8)。

小说SARS-CoV-2变体

XBB (BA.2.10应变),一个οsubvariant,检测到8月同时在国家像新加坡、澳大利亚、丹麦、孟加拉国、印度、美国和日本。尽管上升的情况下,在新加坡,目前没有证据表明subvariant导致严重的影响。与世界卫生组织识别ο担忧的变体,第二代ο变异和他们的后代被类似的在前面的情况下。的百分比οsubvariant (XBB)应变情况下已在过去一个月在新加坡。多达54%的当地XBB病例10月3日至9日,2022年,是目前最普遍subvariant在新加坡。然而,这不是比之前更致命的变种虽然极其传染。根据新加坡卫生当局,当前COVID-19波浪峰到11月中旬在immunity-evasive XBB应变(越来越多的关注https://www.bloomberg.com/news/articles/2022-10-13/xbb-bf-7-ba-5-1-7-new-covid-variants-renew-threats-to-the-world?leadSource=uverify%20wall)。到目前为止,XBB变体已经报告了印度在9个国家有超过500例。数字并不代表实际情况自SARS-CoV-2 COVID-19诊断和测序在大多数健康中心在印度是有限的。根据印度SARS-CoV-2财团基因组的数据(INSACOG) XBB sub-lineage占超过50%的印度最近测序样品(https://weather.com/en-IN/india/coronavirus/news/2022-11-01-covid-19-faqs-xbb-variant-infiltrates-9-indian-states)。印度正在进行的庆祝活动,严格保持警惕特别是对变异像BF.7 BQ.1在印度。BQ.1ο变体的一个分支,与BA.5有关。BF.7和容忍BQ.1次级变体都是变异使其传染性,逃避免疫。此外,临床医生可能断定它由于在该地区流行的流感发病的冬天。最近的可用数据暗示XBB和BQ.1变异的主导地位在印度和新加坡。BQ.1是目前负责大多数情况下在英国,南非,德国、美国、澳大利亚和韩国,XBB变异可能蔓延到超过15个国家,可能会导致增加情况下,在美国,澳大利亚和韩国。分析最近的趋势,很快BQ.1变体取代由XBB全世界大多数国家的预测。

独特的突变

最近在新加坡感染上升表明,大多数情况下是由于XBB (BA.2.10)应变(超过50%),其次是BA.2.75(24%)和BA.5 (21%) (https://health.economictimes.indiatimes.com/news/industry/singapore-monitoring-xbb-covid-strain-very-closely-health-minister/94804128)。根据世界卫生组织(9),XBB是混合/重组变异可能来自BA.2 (BA.2.10.1和BA.2.75)个亚系,即。BJ1 BM.1.1.1,休息在S1和独特的突变BA.2 + (V83A,年代:Y144,年代:Q183E,年代:H146Q,年代:V213E,年代:G252V,年代:R346T,年代:G339H,年代:L368I,年代:G446S,年代:V445P,年代:N460K,年代:F486S,年代:F490S),这显然会成为下一个占主导地位的变体。当前循环ο血统,包括BA.2.3.20 BA.2.75.2, BM.1.1.1, BR.2, CA.1, BN.1 BQ.1.1, BU.1和XBB展示独特的突变(R346、K444 N450, L452, V445, G446, N460, F490, F486和R493)的RBD加强immunity-escape机制,提高传播能力。XBB和BQ.1.1表现出最强的抗马伯,目标RBD和ACE2-binding亲和力增加(10)。

疫苗和马伯疗法

S基因分析表明,有显著差异的不同变体之间的密码子代表关注(11)。SARS-CoV-2的S基因变体如α,β,γ和δ不同ο变体。ο变体出现的初期阶段大流行期间,其余的仍未被发现,直到后来发现在南非也提出(11)。鉴于独特的发生突变的飙升和RBD SARS-CoV-2ο及其血统,当前马伯疫苗和疗法的疗效是不确定的(12)。峰值蛋白质的一种二价疫苗,包括原始SARS-CoV-2,和οBA.4 BA.5制造的现代化和Pfizer-BioNTech最近通过了USFDA (13)。当前可用的疫苗和马伯治疗SARS-CoV-2变体中列出表1。因此,这种变异可能会导致增加的传播感染,进而可能影响国家和他们的经济。应谨慎地评估目前的疫苗,提高疫苗接种战略应对变体和它的血统。IgG抗体合成,可以阻止cell-virus融合区域,COVID19-SF5 (24)。6个酶的免疫球蛋白抗体交叉作用促进突起蛋白网站。当务之急是抗体用于治疗阻止感染,限制病毒复制和变异最小化。

表1

表1目前可用的疫苗和马伯疗法对SARS-CoV-2变体。

很明显,最近的变种已经证明了S地区重要的突变归因于选择性病毒的生存压力对有效的免疫反应和疫苗。未来的干预必须一定目标这样的变化,增加了病毒的抵抗和传染性(25)。了解其发展和预测未来病毒变异是非常重要的在公共卫生视角。热力学增加病毒进化的理解提出(26,27)。绑定关联的吉布斯能量融合和病毒在宿主细胞,和吉布斯能量的增长与宿主的病毒复制。热力学结果表明当前SARS-CoV-2病毒可能继续发展和开发更多的致病性和传染性变体相比,本地同行更传染性虽然不致病。迫切需要合作开发广谱SARS-CoV-2疫苗和马伯药物是感觉到的。

公共卫生措施

在印度健康专家建议不要让卫兵在对抗流感大流行在面对新的变种,通过市场预期更快地传播和节日的时刻。人采取预防措施包括以下这款疫苗接种时间表和COVID-appropriate行为在公众建议。政府和政府应该确保感染预防措施使用面具,和限制公众集会,以减少传播。特别注意可能扩展到妥协的共病人口免疫力和流感样症状。XBB和BQ.1变体具有突变,使他们逃避与疫苗相关的免疫和加速传播,人们可能会进一步被容易再感染(10,28)。

对于监测和准备应对ο变异,人工智能方法似乎符合物联网(物联网)可以提供牙齿开车。基于人工智能的机器学习方法应当为一个有效的方法来找到解决这样一个新兴的全球威胁,因为它依赖于大量的依赖和相互依赖的因素和系统性问题,可以超越人类理解(29日)。越来越需要应用机器学习技术来准确预测的感受。没有明确设定,机器学习可以提高人工智能中机器获得知识与经验。大流行相关的数据可以分析通过各种机器学习分类器(图1)。数据集是使用机器学习分类器训练和分析基于培训。医疗体系迟早会欣赏这种策略和采用它的共同利益。

图1

图1人工智能(AI)的体系结构系统(复制29日)。

作者的贡献

RM:概念化、更新和编辑。路,AO,问:联手在初稿。VK,如:更新了手稿。SM:联手在起草和编辑。所有作者都极度进行审核和批准最终的草案。

确认

作者感谢各自机构提供必要的制度设施和鼓励。

的利益冲突

作者是受雇于广州HC制药有限公司,有限公司

其余作者声明,这项研究是在没有进行任何商业或财务关系可能被视为一个潜在的利益冲突。

出版商的注意

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引用

1。Verma Mohapatra RK, Kandi V,年代,Dhama k的挑战ο(B.1.1.529)及其变体血统:全球视角。ChemBioChem。(2022)23:e202200059。doi: 10.1002 / cbic.202200059