年龄和草场类型对耐四环素和大环内酯物的浓度和流行肠球菌物种在牛肉cow-calf生产系统
Getahun大肠Agga
猎人o·洛韦2 __和- 1食品动物环境系统研究单位,农业研究服务,美国农业部,博林格林,肯塔基州,美国
- 2农业部和食品科学,西肯塔基大学的草地保龄球场,肯塔基州,美国
Enterococci是人类和动物的胃肠道正常菌群。Enterococci也可能导致危及生命的院内感染。Antimicrobial-resistant肠球菌物种已报告在饲养场和奶牛生产肉类和奶制品,暗示他们的食源性的重要性。Cow-calf业务代表一个重要的部分在牛肉生产系统生产断奶小牛。断奶小腿被带入饲养场完成对肉类,牛肉和扑杀牛也屠杀,主要对牛肉产品。感染动力学在cow-calf操作有助于肉类污染。本研究评估了年龄和小麦放牧对浓度的影响和大环内脂类抗菌素红霉素(非常流行r)和四环素(春节r)耐药enterococci相关抗性基因和物种分布cow-calf生产系统。在2017年和2018年,32岁的安格斯品种cow-calf双被随机分配到以高羊茅或小麦牧场在两个独立的田间试验。放牧实验中2 - 3周,每周收集粪便样本的枚举,隔离并标识非常r,春节r,通用enterococci,使用媒体补充与红霉素、四环素或non-supplemented媒体分别。两个主要的物种经常与人类疾病有关,肠球菌都有效和粪大肠cow-calf组广泛分布。通用的,春节r——enterococci普遍流行(96 - 100%)和丰富的(3.2 - -4.9日志10在人口cow-calf CFU / g);然而,非常renterococci被直接电镀可列举的只是从一个牛尽管被检测到至少40%的浓缩后的粪便样本,显示低丰度。春节,ERY-resistance主要是授予春节(M)和嗯分别(B)。小麦放牧降低春节的浓度renterococci和修改肠球菌的物种和耐药基因的分布。因此,有必要进一步研究小麦放牧cow-calf生产作为一个潜在的策略来减轻抗菌素耐药性。
介绍
Enterococci共生的细菌殖民胃肠道(GIT)人类和动物的健康,不会引起肠道问题。(美国农业部,2012;Lebreton et al ., 2014;艾哈迈德·巴普蒂斯特,2018年)Enterococci也会导致威胁生命extraintestinal感染。(阿里亚斯和穆雷,2012;Lebreton et al ., 2014;艾哈迈德·巴普蒂斯特,2018年)因此,抗生素耐药enterococci院内感染的主要原因是在美国。(阿里亚斯和穆雷,2012;Lebreton et al ., 2014)粪肠球菌和大肠都有效是主要的物种通常与人类感染有关。(阿里亚斯和穆雷,2012;Lebreton et al ., 2014;艾哈迈德·巴普蒂斯特,2018年)Enterococci无处不在;(Lebreton et al ., 2014)人殖民暴露在从人类和动物废水污染环境(Agga et al ., 2015)、污染饮用和休闲水源。(Lebreton et al ., 2014;曹et al ., 2020;Agga et al ., 2022 a;Kaiser et al ., 2022)此外,enterococci已报告从零售牛肉(泰森et al ., 2018)、零售牛肉肉(泰特et al ., 2021)、牛肉(Vikram et al ., 2018;施密特et al ., 2021)表明他们的食源性的影响。抗菌素耐药性牛饲养场(enterococci被广泛研究的Vikram et al ., 2017;Davedow et al ., 2020;穆雷et al ., 2022)、奶牛(西普和迪克森,2012年;被刺et al ., 2021),并在较小程度上宰杀牛。(潘伟迪et al ., 2021),然而,这样的研究是罕见的在牛肉cow-calf (Agga et al ., 2016)和后台处理操作(Agga et al ., 2019)。
牛肉牛来自cow-calf操作和卖牛肉生产类似于屠宰奶牛大多数用于牛肉的牛肉生产。虽然有些女性小腿被选中作为种畜替代品,多数的小腿断奶后进入饲养场为牛肉生产完成。确定抗菌素耐药细菌的水平(ARB)断奶小牛之前进入饲养场是很重要的。抗菌素耐药细菌如enterococci可以污染牛肉屠宰过程中尸体和构成重大的公共卫生风险。建立一个基线ARB包括enterococci成人患病率牛肉牛和牛肉响棒是至关重要的。以前的研究报道减少抗菌素耐药性的流行趋势粪便细菌,主要是大肠杆菌动物年龄的增长。(霍伊尔et al ., 2004;Gaire et al ., 2021)然而,研究评估年龄对革兰氏阳性细菌的影响如enterococci稀缺。因此,进一步了解不同年龄效应将有用目标的成年母牛和小牛抗菌素耐药性的缓解。
覆盖作物的家畜放牧使生产商获得直接的经济效益,同时减少投入成本。覆盖作物提供更高质量的家畜的饲料相比,典型的原生草地牧场。(Franzluebbers 2007;Poffenbarger 2010)在南部大平原,是典型的冬季放牧麦田给食用牛优质饲料。(Winterholler et al ., 2008)放牧的冬小麦品种,直到联合阶段报道比non-grazed冬小麦籽粒产量增加。(Redmon et al ., 1995)然而,没有研究调查的影响小麦放牧在牛肉cow-calf ARB的发生在南部平原生产系统。两用小麦放牧对粮食产量的影响和动物生长性能在先前发表的研究报告。(Netthisinghe et al ., 2020)在本文中,小麦的影响放牧的浓度和流行四环素(春节r),红霉素(非常r)-抗enterococci与高羊茅放牧cow-calf生产系统。
本研究的具体目标是调查的影响放牧草场类型(小麦对高羊茅)和年龄(小腿和牛)牛肉cow-calf生产系统在春节的浓度和流行r和r肠球菌的物种,在耐药菌株耐药基因分布。另外一个目标是确定基线的抗菌素耐药enterococci断奶小牛之前进入饲养场,和传播耐药细菌的繁殖奶牛牛肉小腿或扑杀和用于牛肉生产。Enterococci已经作为指示生物的革兰氏阳性细菌抗生素耐药性(AMR)监控系统涉及食品动物生产和动物产品(卡普et al ., 2017)。
四环素抗性被选中,因为它丰富和广泛的出现在各种细菌物种和环境(罗伯茨和施瓦兹,2016年),这可能归因于其最高水平的销售用于食品生产的动物。(泰森et al ., 2018;Agga et al ., 2022 a)红霉素是一种大环内酯物,一直在调查关于抗菌素耐药enterococci肉牛生产(弗莱和杰克逊,2013年)和零售牛肉。(泰森et al ., 2018)根据世界卫生组织(世卫组织)分类抗菌素、四环素、大环内酯类分为非常重要和最高优先级对人类健康至关重要的抗菌类,分别。(斯科特et al ., 2019)春节r在enterococci发展主要通过核糖体保护或抗生素的流出。春节(M)和春节(L)是最常见的四环素耐药(春节)基因编码核糖体保护和射流在enterococci蛋白质,分别。(弗莱和杰克逊,2013年;Agga et al ., 2022 c大环内酯类)最常见的获得性耐药机制是目标修改通过红霉素耐药性甲基化酶(嗯)基因,主要是嗯(B) (弗莱和杰克逊,2013年)。
材料和方法
实验设计和样本收集
随机组成的现场试验进行了两个实验在西肯塔基大学农业研究和教育在草地保龄球场复杂,肯塔基州在2017年和2018年。这项协议是西肯塔基大学的机构批准的动物保健和使用委员会(IACUC # 17-09)。研究动物组成的牛肉牛,小牛接近断奶年龄被西肯塔基大学拥有和管理。小牛收到梭菌的疫苗骗子,病毒性呼吸道疫苗和流行性感冒疫苗。没有其他抗生素给奶牛或小腿。cow-calf实验以前发表的详细描述(Netthisinghe et al ., 2020)。
短暂,在两个独立的实验中16安格斯品种cow-calf双同样随机,阻止体重的小腿,高羊茅或小麦牧场上放牧在2017年和2018年。cow-calf对放牧三个星期从3月21日到2017年4月12日,或者两个星期从3月14日到2018年3月28日。为2017年的实验中,粪便抓住或粪便收集棉签直肠给药3月21日(星期0),3月28日(第一周),04年4月(周2)和2017年4月11日(周3)。2018年实验,收集粪便样本3月14日(周0),3月21日(第一周),3月28日(星期2)。样本保存在冰和运送到实验室,直到加工冷藏。
枚举和通用检测——春节r,非常r-enterococci
样本处理和培养。(Agga et al ., 2015;Agga et al ., 2016;Agga et al ., 2022 c)。简单地说,10 g的粪便抓住悬浮在90毫升的缓冲蛋白胨水(BPW;Becton,迪克森和公司(BD),富兰克林湖,美国新泽西)和均质在实验室搅拌器。粪便拭子被离心悬浮在5毫升BPW和均质。枚举的整除拍摄后,其余BPW悬挂在25°C 2 h孵化,然后在42°C 6 h和次生富集在4°C。
通用的,非常r- - -春节r——enterococci枚举Slanetz和Bartley介质(座)琼脂(热费希尔科学、沃尔瑟姆,MA),座板补充8 mg / L红霉素(座+红霉素),和座板补充16 mg / L四环素(座+春节),分别。确定患病率,二级充实是由转移0.5毫升BPW预富集到2.5毫升enterococcosel肉汤(央行;BD),欧洲央行补充16 mg / L四环素(ECB +春节)和欧洲央行补充8 mg / L红霉素(ECB +红霉素)。孵化后37°C 18到24 h,央行文化被飞跑到座,座+春节和座+红霉素盘子和孵化一夜之间在37°C。
抗生素用于选择性分离的耐药菌株获得微孔σ(圣路易斯,密苏里州)和临床实验室标准协会(CLSI)电阻断点浓度(CLSI 2020)使用。
PCR证实、物种形成和抗性基因的检测
对于所有类型的板,两个假定菌落接种到大豆胰蛋白酶的肉汤(TSB;BD)和孵化一夜之间在37°C。新鲜整除的DNA提取后,剩余的肉汤培养中添加15%的甘油后储存在-20°C之间。一夜之间文化的DNA提取从10 ml伯灵顿裂解方法后,制造商的指令(杜邦Qualicon, Inc .威尔明顿DE)。DNA溶解产物被用于PCR属的确认肠球菌、物种形成和检测相关的抗性基因。
假定enterococci隔离经属特定PCR (Deasy et al ., 2000),肠球菌物种是由复合PCR鉴定(杰克逊et al ., 2004),使用引物和出版协议(补充表1)。表型耐药菌株被PCR检测的抗性基因的识别。春节r肠球菌隔离是四环素耐药性测试(春节)基因(补充表2)。非常r肠球菌物种对大环内酯物进行测试,lincosamides和streptogramins(美国职业足球大联盟B)抗性基因(补充表3)。PCR产品被使用QIAxcel毛细管凝胶电泳分析快速分析系统(试剂盒,瓦伦西亚,CA)。本研究中使用的所有引物获得DNA技术集成,Inc . (IDT;珊瑚镇,IA)。代表从毛细管电泳凝胶图像enterococci属确认和物种识别、检测四环素抗性基因,和大环内酯物抗性基因中描述补充图1- - - - - -3,分别。
数据分析
枚举数据比较动物年龄(小腿比牛)和治疗组(小麦、高羊茅)使用负二项回归,和边际产出了日志10集落形成单位。细菌和抗性基因的流行被动物相比年龄和草场类型使用逻辑回归。对于回归分析,奶牛和高羊茅作为参照组。两两对比被Bonferroni调整后获得多个比较方法。数据分析在占据16 (StataCorp、大学城、德克萨斯州);P< 0.05被认为是具有统计学意义。
结果
描述性分析
收集的224份粪便样本,128在2017年和96年收集在2018年,通过动物年龄均匀分布(小腿和牛)和草地类型(高羊茅和小麦)。然而,一些粪便样本不能满足加工;这反映个别菌株的基础上,提出了在表。除了小腿和高羊茅集团春节的浓度r肠球菌种虫害与总enterococci人口(通用)。同样,春节r肠球菌种虫害发病率也高(≥96%)密切关注通用的人口。另一方面,非常r肠球菌种虫害可量化的只是从一个动物虽然普遍超过40% (表1)。
表1浓度和流行通用的抗生素耐药,以年龄和治疗组enterococci cow-calf生产系统。
年龄和草场的影响浓度和流行的通用型,非常r- - -春节r- - - - - -肠球菌物种
通用enterococci浓度没有显著(P> 0.05)不同年龄或草地类型(图1一个)。春节的浓度r- - - - - -肠球菌种虫害明显(P =0.005)较低的比牛,小牛更大年龄效应观察小麦组比高羊茅由于显著(P= 0.008)年龄草场类型交互(图1 b)。非常r肠球菌种虫害在2.7日志从一个可量化的牛羊茅组在2018年。通用的患病率,春节r和非常r——肠球菌种虫害不显著(P> 0.05)不同年龄或草地类型(图2)。
图1粪便的浓度一般(一)和四环素耐药,(B)肠球菌物种cow-calf生产系统中。当显示,不同字母图形显示在统计上有显著差异P< 0.05。酒吧图表给出了平均浓度及其95%置信区间。
图2粪便流行通用的-(一)四环素耐药,(B)红霉素耐药,(C)肠球菌物种cow-calf生产系统中。酒吧图表给出了意味着普遍的价值观和他们的95%置信区间。
普遍存在的肠球菌物种中发现
两个隔离从每个积极样品PCR检测物种鉴定。在通用enterococci隔离、7个肠球菌种虫害是占主导地位的确定e·杜兰(38%),紧随其后的是大肠mundtii(22.5%)和大肠都有效(21.5%),占超过80%的通用enterococci隔离人口。但在年龄和治疗组,有变异的主要spp。六隔离无法确定的方法(表2)。的比例大肠都有效分离获得小麦牧场上放牧的奶牛显著(P= 0.005)低于牛放牧在高羊茅,小牛没有显著差异。的比例大肠mundtii隔离来自母牛和小牛都显著(P< 0.001)低的小麦比高羊茅的牧场。的比例e·杜兰隔离从母牛和小牛获得放牧对小麦是两倍比获得高羊茅(P< 0.001)。的大肠casseliflavus隔离都从小牛获得(确切概率法P= 0.009)。
表2普遍存在的肠球菌物种从cow-calf enterococci隔离标识人群,媒体类型。
春节renterococci隔离被确定为五种虫害大肠都有效代表超过一半(53%)的人口,紧随其后大肠hirae(25%)和e·杜兰(17%);三种虫害一起占超过95%的春节renterococci人口。三个春节renterococci隔离无法鉴定到种虫害的方法(表2)。草地类型(即有年龄依赖性的影响。、交互)的患病率e·杜兰:患病率显著(P= 0.001)小麦组比高羊茅组的牛。普遍存在的另一种虫害是不受年龄和治疗组(表2)。
非常renterococci被确定为七个spp。;14分离鉴定方法。前三种虫害是粪大肠(22.5%),大肠都有效(21.6%)和大肠casseliflavus(19.8%)占大约64%的人口(表2)。草场类型有显著(P= 0.002)年龄依赖影响的流行粪大肠;普遍存在的粪大肠是高羊茅上放牧的小腿比其余的组。同样,牛放牧在高羊茅明显(P= 0.008)更大的患病率大肠都有效比牛放牧在小麦。普遍存在的大肠casseliflavus隔离显著(P= 0.027)高羊茅的奶牛比小麦小腿;没有检测到从高羊茅小牛表现出显著的年龄效应(P= 0.003)和无显著牧场效果(P= 0.939)。大肠hirae,e .鸟结核和大肠asini只发现在小麦集团(表2)。
年龄和草场类型影响抗性基因的分布
百分之七十的春节renterococci隔离是积极的春节(M);春节(左)和春节(O)表示剩下的30% (表3)。一个春节r肠球菌隔离是负数的11春节基因测试。隔离的比例春节(M)显著(P= 0.001)更大的小腿之间的隔离,不管草场类型,比隔离来自牛放牧在高羊茅。然而,小麦放牧年龄效应增加的比例稀释分离春节(M)在小麦上放牧牛,虽然两个牧场上的牛放牧的区别不是统计不同类型(表3)。小腿春节renterococci隔离几乎是三倍(优势比= 2.8;95%置信区间:1.5—-5.3)更容易携带春节(M)相比,牧场的奶牛隔离调整类型和交互。的患病率春节(L)显著(P< 0.001)在牛羊茅组大于小麦群体;另一方面,春节(O)显著(P= 0.034)在小麦上的奶牛群高于小腿高羊茅组(表3)。
表3年龄和草场类型对四环素的患病率(%)和大环内酯物抗性基因在耐四环素,红霉素enterococci cow-calf粪便的生产系统。
绝大多数(84%)的很r隔离了嗯(B)的患病率嗯(B)显著(P在小麦隔离= 0.047)高于羊茅组。另一方面,的患病率msr(C)显著(P= 0.006)高羊茅隔离比小麦隔离。而mef(一)只在奶牛放牧的小麦基因检测,嗯(Q)在放牧的牛只发现高羊茅(表3)。两个非常r隔离并没有积极的目标基因。
抗性基因的分布肠球菌物种
在春节renterococci隔离,超过50%(范围:50 - 95%)的隔离所有物种大肠hirae进行春节然而,(M)。85%的大肠hirae隔离了要么春节(L)或春节(O)这两个春节(S)积极的隔离大肠casseliflavus(表4)。尽管所有小肠球菌种虫害存在嗯(B)的10%粪大肠,39%的大肠都有效分离株为阳性msr(C) (表4)。
表4患病率(%)四环素和大环内酯物抵抗基因,表型四环素,红霉素耐药之间的分别肠球菌物种从粪便的牛肉cow-calf获得生产。
讨论
在成年人的牛肉牛,春节的浓度和流行renterococci通用enterococci密切相似的人口普遍发生和丰富的春节renterococci人口牛肉牛。另一方面,非常的流行renterococci是42%。红霉素耐药enterococci可列举的只是从一个动物表明非常renterococci发生在没有或低的低浓度抗生素选择压力下广泛的动物生产cow-calf等操作。这种现象的低丰度(可列举的只有五个动物),但高患病率(69%)曾报道从牛肉牛人口。(Agga et al ., 2016)与奶牛生产与奶牛cow-calf操作小牛comingle直到断奶,成年牛可以传输ARB小腿,如图所示在当下研究类似的流行的春节r,非常renterococci小腿和牛(表1)。
一旦在饲养场,抗药性细菌的水平会增加(叫et al ., 2008),随后尸体污染;非常r——enterococci发现88%的结肠癌粪便样本的肉牛屠宰。(Vikram et al ., 2017当扑杀牛和加工销售,牛肉会发生污染。非常r——enterococci发现从38%和48%的有机和常规零售牛肉声称,分别。(施密特et al ., 2021)一个大回顾纵向分析牛肉来自在美国零售市场显示,92.7%肠球菌的污染(泰森et al ., 2018)。
虽然春节的患病率r,非常r——enterococci没有显著不同,春节的浓度renterococci明显高于牛比的小牛。几项研究表明,ARB的水平随年龄的动物。(叫et al ., 2008;Gaire et al ., 2021)的年龄效应需要一个纵向研究评估后的小腿。因为我们的研究是横断面研究无法评估年龄效应军团内的小牛。相反,本研究比较了水平之间的ARB小腿和牛数量保持在一起。ARB的状态监测牛肉小腿和周期性的饲养奶牛粪便取样和测试将有助于回答年龄效应和定义的基线水平小牛之前进入饲养场。此外,以往的研究报道年龄效应进行了大肠杆菌。因此,我们的研究可以用作基线等革兰氏阳性细菌enterococci人口肉牛生产。
小麦放牧在断奶会减少春节的浓度renterococci小牛相比牛放牧在小麦。机制和福利小牛放牧对小麦需要探索AMR的缓解,特别是因为小牛去饲养场牛肉生产、食品安全的含义。然而,我们之前报道来自同一cow-calf人口小麦放牧对春节的患病率和浓度没有影响r大肠杆菌(Agga et al ., 2022 b)表明小麦放牧的微分效应革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌。
排名前三肠球菌物种鉴定的通用- (e . drans大肠mundtii大肠都有效),非常r- (粪大肠,大肠都有效,大肠casseliflavus)和春节r- (大肠都有效,大肠hirae和e·杜兰)隔离(表2)是最常发现物种GIT的人类和动物(Aarestrup et al ., 2002;2019年12月et al .,)。这些前六种(大肠都有效这三个媒体类型之间共享;e·杜兰是通用和春节之间共享r隔离)是最经常发现零售肉分离(泰森et al ., 2018),标志着他们的食源性的重要性(穆雷et al ., 2022)。牛肉中隔离,红霉素(2.4%粪大肠,7.5%的大肠都有效隔离)和春节- (23%粪大肠,25%的大肠都有效隔离)观察电阻相对较少而其他零售肉类型(泰森et al ., 2018)。顶部物种隔绝cow-calf人口也在物种牲畜粪便和饲养场环境隔绝,和cow-calf操作。(美国农业部,2012;查希尔et al ., 2020)此外,春节和大环内酯物电阻是最普遍的表型大肠hirae,粪大肠,大肠都有效隔离从饲养场牛。(查希尔et al ., 2020目前的研究指出,春节r——隔离不同比通用的,非常少r隔离,用更少的物种鉴定和由三个物种的数量占总数的95%春节r隔离(表2)。
尽管年龄修改小麦放牧对物种分布的影响,大肠casseliflavus是唯一的物种被发现在小牛的患病率明显高于比牛。这个物种差异背后的原因是未知的,但是大肠casseliflavus是最常见的孤立的物种之一,一起吗粪大肠和大肠都有效(Aarestrup et al ., 2002),从昆虫帮助肠球菌的物种的传播(马科维Zurek和2006)。当前的研究的另一个重要发现是小麦的潜力放牧修改肠道微生物群。小麦放牧显著降低一般,非常的流行r——大肠都有效(牛),通用大肠mundtii(母牛和小牛),非常r粪大肠(小牛)。另一方面,小麦放牧显著增加的流行通用——小麦组(翻倍),春节r- - - - - -e·杜兰;非常r- - - - - -大肠hirae,e .鸟结核,大肠asini发现只从小麦群体。研究结果表明,小麦放牧修改肠道的微生物群,通过增加或减少特定的细菌种类的比例。小麦的这种效应和潜在机制适应放牧来缓解主要enterococci物种,大肠都有效和粪大肠在牛肉小腿生产需要进一步调查。
四环素和大环内酯物的电阻enterococci隔离从cow-calf获得人口被授予独家春节(M),春节(左)和春节(O)和嗯(B)和msr(C),分别在文献中报道。(弗莱和杰克逊,2013年;Agga et al ., 2022 c然而,)分布的三个春节基因是牛比小牛更多样化,春节(M)占了主导地位。的年龄依赖性春节(M)在提供春节抵抗enterococci表示的独特作用春节(M)在小腿中扮演对抗抗生素选择压力需要抗生素治疗比饲养的牛肉牛断奶年龄之前由于细菌感染。牛肉牛另一方面更容易感染由于少生理需求以及感染密度,而不是奶牛,因此不需要抗生素治疗,和大规模的治疗并不常见(叫et al ., 2008;美国农业部,2012)。就像物种分布、小麦放牧的分布的影响春节和美国职业足球大联盟B通过增加基因(春节(O),嗯(B))或减少(春节(左),msr(C)]他们的患病率。小麦放牧对耐药基因分布在春节也有类似的影响r和第三代头孢菌素耐药大肠杆菌隔离来自同一个cow-calf人口特征(Agga et al ., 2022 b)。这些发现表明,小麦放牧显著影响细菌的耐药基因分布通过支持扩张人口携带某些基因,而抑制细菌人口携带其他基因尽管赋予相同的表型耐药。
结论
研究发现红霉素,大环内脂类抗菌素归类为高优先级医疗用至关重要、耐药肠球菌种重大公共卫生重要性2/5的粪便样本来自cow-calf生产系统。四环素耐药肠球菌cow-calf种群物种丰富和广泛。小麦草的研究报告,单独或通过与动物的年龄的互动,影响了大量的春节renterococci,肠球菌的物种和耐药基因的分布。小腿有显著降低大量的耐四环素enterococci,和春节(M)过程中起着重要作用赋予四环素抗性在小腿隔离,更多样化的四环素抗性基因被发现在奶牛。研究表明,AMR可以坚持食品动物生产体系以更少的抗生素选择压力如cow-calf生产。还需要进一步的研究来利用小麦放牧提高牛肉的双重好处小腿增长表现,作为一个潜在的缓解策略修改致病性和抗菌素耐药细菌致病性等人类enterococci饲养场之前操作。
数据可用性声明
最初的贡献提出了研究中都包含在这篇文章/补充材料。进一步询问可以针对相应的作者。
道德声明
动物研究回顾和批准西肯塔基大学动物保健和使用委员会制度(IACUC # 17-09)。
作者的贡献
GA概念化的研究,获得了资金,领导的调查,分析了数据和写的手稿。HG参与概念化、资金收购动物管理和监督。一个参与概念化,资金收购和野外研究。所有作者的文章和批准提交的版本。
资金
这项研究是由美国农业部农业研究服务(项目编号5040 - 12630 - 006 - 00 - d)和通过USDA-WKU合作协议(项目编号:5040 - 12630 - 006 - 30)。
确认
我们感谢Rohan帕克尔的技术支持。提到的贸易名称或商业产品在这个刊物的目的仅仅是为了提供特定的信息,并不意味着美国农业部推荐或认可。美国农业部是一个平等机会提供者和雇主。
的利益冲突
作者声明,这项研究是在没有进行任何商业或财务关系可能被视为一个潜在的利益冲突。
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补充材料
本文的补充材料在网上可以找到:https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/frabi.2022.1052316/full补充材料
补充图1 |代表从毛细管电泳凝胶图像enterococci属确认和物种识别从cow-calf生产系统。分子大小近似碱基对(bp)。属=属特定的基因标记;FL =粪大肠;调频=大肠都有效;DU =e·杜兰;CA =大肠casseliflavus;GA =大肠gallinarum;μ=大肠mundtii;AV =e .鸟结核;你好=大肠hirae;是=大肠asini。
补充图2 |代表从毛细管电泳凝胶图像四环素抗性基因从enterococci孤立cow-calf生产系统。分子大小近似碱基对(bp)。
补充图3 |代表从毛细管电泳凝胶图像为大环内酯物抗性基因从enterococci孤立cow-calf生产系统。分子大小近似碱基对(bp)。
补充表1 |用于PCR引物的物种形成enterococci隔离来自牛的粪便和pre-weaned小牛在cow-calf牛群(杰克逊et al ., 2004)。
补充表2 |引物用于PCR检测四环素耐药性(春节)四环素耐药基因表型肠球菌物种从奶牛的粪便和分离pre-weaned小牛cow-calf牛群。
补充表3 |引物用于PCR检测大环内酯物抗性基因的表型红霉素耐药肠球菌物种从奶牛的粪便和分离pre-weaned小牛cow-calf牛群。
引用
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关键词:抗菌素耐药性,大环内酯物抵抗,四环素耐药性,肠球菌、cow-calf肉牛
引用:Agga通用电气、Galloway HO和Netthisinghe AMP(2022)年龄和草场类型对耐四环素和大环内酯物的浓度和流行肠球菌物种在牛肉cow-calf生产系统。前面。Antibiot。1:1052316。doi: 10.3389 / frabi.2022.1052316
收到:2022年9月23日;接受:2022年10月20日;
发表:2022年11月03。
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