映射和发展秋收之前的那次KASP标记为数量性状萌芽在中国河南小麦品种的抗性
程的冠
ChaoJun彭
海滨大道东2、3、4
- 1西农大学学院农学咸阳,中国
- 2作物分子育种研究所、河南农业科学院,郑州,河南,中国
- 3河南省重点实验室的小麦种质资源创新和改进,郑州,河南,中国
- 4神农实验室,郑州,河南,中国
作品简介:Pre-harvest发芽(小灵通)严重影响小麦品质和产量。然而,到目前为止已经有有限的报道。十分重要的紧迫性品种抗性品种通过定量特征核苷酸(本考察团)或小灵通耐药性基因white-grained小麦。
方法:629中国小麦品种,其中包括373名当地小麦品种从70年前和256年改良小麦品种穗发芽的表型(SS)在两个环境和基因分型的小麦660 k芯片。这些表型与314548个SNP标记用于识别本考察团对小灵通电阻使用几个多位点全基因组关联研究(GWAS)方法。他们的候选基因被RNA-seq验证,验证候选基因在小麦育种进一步利用。
结果:因此,变异系数50%和47%的小灵通629年小麦品种,分别在2020 - 2021和2021 - 2022表示大表型变异,特别是,38个白色粮食品种出现至少中阻力,如Baipimai Fengchan 3, Jimai 20。在GWAS, 22个重要本考察团,大小的0.06% ~ 38.11%,为小灵通阻力稳定由多个多位点识别方法在两个环境中,例如,ax - 95124645 (chr3D: 571.35 mb),用36.390%和45.850%的大小在2020 - 2021和2021 - 2022年,分别由几个多位点检测方法在两个环境中。与先前的研究相比,ax - 95124645是用于开发Kompetitive Allele-Specific PCR标记工作频率。TAF9-3D (chr3D: 569.17 mb ~ 573.55 mb)第一次,特别是,它有白色颗粒的小麦品种。在这轨迹,九个明显差异表达的基因,其中两个(TraesCS3D01G466100和TraesCS3D01G468500)被发现通过去注释与小灵通阻力和确定候选基因。
讨论:本考察团和两个新的候选基因与小灵通电阻被确定在本研究中。本考察团可以用来有效地识别小灵通电阻材料,尤其是white-grained品种与工作频率。TAF9-3D-TT单体型抗穗发芽。因此,这项研究提供了候选基因,为小麦育种材料,和方法论依据小灵通阻力在未来。
1介绍
全球小麦是主要的粮食作物,中国是世界上最大的小麦生产国和消费国。2022年,中国小麦收割面积是22911。2千公顷,总收率达到了1.3576亿吨。河南,小麦收割面积和产量在中国占24.8%和28.1%,分别是中国最大的主要小麦产地。小麦品种的遗传改良中发挥了重要作用的持续改进小麦生产能力。
Pre-harvest发芽(小灵通)是指种子发芽,发芽的现象在雨天或潮湿条件下的小麦收成。这是一个世界性的自然灾害,据报道在中国(周et al ., 2017),日本(Kashiwakura et al ., 2016),美国(Nonogaki et al ., 2014)、加拿大(卡布拉尔et al ., 2014)、欧洲(Rakoczy-Trojanowska et al ., 2017)、南非(2018年西德汉姆和巴纳德),澳大利亚(Barrero et al ., 2010)。在中国,频繁和严重的小灵通飙升危害发生在长江中下游的冬小麦区,冬小麦区,西南和东北春小麦区(金,1996;Zhang et al ., 2010)。在这些区域,小灵通阻力取决于休眠基因与红色种皮。然而,在中国北方,如河南white-grained小麦品种在生产、使用和整体推广的小麦机械化收获,应该完全成熟后收获小麦和脱水。小灵通易感性的品种穗发芽的概率增加由于降雨成熟收获时期。因此,品种抗性品种的紧迫性通过小灵通电阻的数量性状基因核苷酸(本考察团)或white-grained小麦。
小麦小灵通阻力是一个复杂的数量性状由多个基因控制(Imtiaz et al ., 2008)。因此,它是非常重要和必要的识别这些抗病位点和开发分子标记在作物育种。在以前的连锁分析,涉及一系列的qtl对小灵通阻力位于所有的小麦染色体(21日Mohan et al ., 2009;卡布拉尔et al ., 2014;曹et al ., 2016;Fakthongphan et al ., 2016),反复和稳定法被发现3号染色体上(加藤et al ., 2001;阻塞性睡眠呼吸暂停综合症et al ., 2003;Kulwal et al ., 2004;Mori et al ., 2005;刘和白,2010年)。目前,red-grained小麦品种一般表现出更高的小灵通阻力,因为小灵通抗性基因在染色体3 a, 3 b和3 d被认为是与红色种皮密切相关,这是由R控制显性等位基因(Himi et al ., 2011)。最近,全基因组关联研究(GWAS)已被用于识别法和候选基因小麦的粒重和株高(Zanke et al ., 2014;陈et al ., 2016;王et al ., 2017),特别是,朱镕基et al。(2019)发现一些经济价值和开发分子标记在小麦染色体1,3 bs,小灵通阻力和6提单,林et al。(2017)确定了两个候选基因的小灵通抵抗80年小麦品种。然而,研究小麦小灵通阻力相对有限。
中国小麦地方品种显示小灵通阻力高于改良品种(王et al ., 2011;刘et al ., 2014),它提供了宝贵的基因资源挖掘阻力小灵通的位点。在这项研究中,629个小麦品种测量小灵通的阻力在2020 - 2021和2021 - 2022年,其中包括373年小麦地方品种在70年前和256年小麦改良品种在过去的70年在河南省,中国。为小灵通抵抗我的一些有价值的本考察团,这些表型被用来与SNP标记在上面的629个小麦品种使用几种多位点GWAS方法。结果验证了RNA-seq小灵通品种的抗性和易感性之间的数据集,一个证实本考察团是用于开发Kompetitive Allele-Specific PCR (KASP)标记,和KASP标记进一步证实与小灵通电阻有关。因此,这项研究提供了一个宝贵的轨迹和white-grained小麦小灵通电阻材料,可在主要生产区域。
2材料和方法
2.1材料
在协会映射人口,有629中国小麦品种,包括373名当地小麦品种从70年前,256年改良小麦品种(行)。在2020年和2021年的秋天,这些品种种植在实验领域的河南现代农业研发基地(东经:113.707°,北纬:35.011°)。提供的冬小麦品种作物分子育种研究所河南农业科学院。
2.2在629年小麦品种小灵通电阻测量
根据中华人民共和国农业行业标准的中国,NY / T 1939 - 2009,即“标准”以下,我们收获了品种在面团阶段依次和20干线每个品种的峰值在-20°C存储在冰箱里。所有的品种都收获后,我们测量了小灵通所有品种的表型在人工气候室温度22°C±1°C和相对湿度95%±5%。样本从人工气候室96小时后,计数和干60°C,穗发芽(SS)的公式计算x = (n / n) * 100%,
在哪里n穗发芽谷物的数量,N是总穗粒数。相对党卫军指数”我“每个品种的测试计算从我= x1和x2。
在哪里x1每个不同的学生进行测试,然后呢x2控制不同的党卫军,Zhoumai 18或本地品种与类似的小灵通表型Zhoumai 18。基于阻力小灵通的标准补充表S1秋收之前的那次,发芽年级每个品种的决心。
629年2.3多位点GWAS小麦小灵通电阻品种
按照引用(杜et al ., 2021),所有的629个品种被小麦660 k微阵列基因分型,和高品质的314548个SNP标记的基因型是基于获得四个筛选标准:等位基因= 2,较小的等位基因频率(加)≥0.01,失踪≤10%,杂合性≤10%。最佳线性无偏预测(BLUP)值在2020 - 2021和2021 - 2022年计算R语言包(R 4.2.1)准备。这些标记基因型是用来把性状表型或BLUP值在629年小麦品种使用IIIVmrMLM (李et al ., 2022 a;李et al ., 2022 b)和mrMLM (Zhang et al ., 2020)软件包,后者包括mrMLM (王et al ., 2016),FASTmrMLM (Tamba, 2018张),FASTmrEMMA (温家宝et al ., 2017),pLARmEB (Zhang et al ., 2017),伊希斯EM-BLASSO (Tamba et al ., 2017)和pKWmEB (任et al ., 2018)方法。人口结构是决定使用admixture_linux-1.3.0软件。子组(K)的数量从2到5扫描使用掺合料软件和两个决定。使用mrMLM亲属关系矩阵计算软件。重要的关键LOD分数法是LOD = 3.0,相当于假定值= 2的军医。曼哈顿的土地使用mrMLM软件。LD衰减距离计算使用vcftools v0.1.13, plink-v1.07, PopLDdecay 3.41软件。2.192 Mb地区被视为重要的QTL的上游和下游。
2.4设计和分析小灵通抗病位点的分子标记
0.2 - -0.3 g新鲜的叶子被从每629个小麦品种,pre-cooled液氮,碾碎,放入1.5毫升离心管,小麦基因组DNA提取是基于Gawel和Jarret (1991)。
2.4.1 KASP设计小灵通抗性位点的分子标记
正向和反向引物(英国《金融时报》:5“-ATCAATTATCAGCTCTGGAT-3”;舰队指挥官:5“-ATCAATTATCAGCTCTGGAC-3”;R: 5“-AATCTTGACCTGTGTCCCGA - 3”)的KASP分子标记设计上游20基点和下游155基点根据轨迹显著相关的物理位置信息在引用中国春天小麦全基因组序列信息网站(http://202.194.139.32/jbrowse-1.12.3-release/?data=Chinese_Spring1.0)。十六进制(红色,5 -GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3)添加到5 '末端的英国《金融时报》的引物序列和家人(蓝色,5 -GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3)添加到5 '端FC的引物序列,分别。这些引物合成了Sangon生物科技(上海)有限公司,有限公司进行了PCR反应在一个3μl Hydrocycler-thermal循环的总量,包括1.5μl KASP 2×大师混合(LGC技术(上海)有限公司),80 ng的模板DNA, 0.06μl KASP测定混合(primer-FC 100嗯primer-FT向前,向前,反向primer-R和ddH2O混合12:12:30:46体积比)。PCR扩增94°C,持续15分钟,10周期94°C的20年代,61°C-55°C的60年代每周期降低0.6°C,和最后一个扩展是29日周期94°C的20年代,60年代55°C。
2.4.2 KASP标记放大产品的序列分析
KASP分子标记反应的产物Zhoumai 18和Shengsimai 1%琼脂糖凝胶电泳分离,回收和纯化目标片段,这是克隆pMDTM19-T向量(豆类生物医学科技(北京)有限公司),和测序Sangon生物科技(上海)有限公司,有限公司至少为每个品种10克隆测序。DNAMAN软件被用来分析的等位变异放大产品的KASP标记引物序列,然后爆炸(基本局部比对搜索工具)在EnsemblPlants数据库(http://plants.ensembl.org/index.html)。
2.5 RNA-seq样本选择和差异基因表达分析做准备
2.5.1 RNA-seq样本选择准备
根据识别结果穗发芽的人口协会,高度耐red-grained Shengsimai, white-grained品种Baipimai,高度易感white-grained品种Zhoumai 18被选为RNA-seq样本。样品处理方法根据标准进行。wax-ripening阶段,所有这三个样本从15厘米以下,9峰值被从每个材料,它被分成3部分,每个峰值是一个生物复制。然后,浸泡4小时后,3份之一是液体
0点控制的氮和冷冻RNA-seq (0 h)。剩下的两个部分是小灵通识别进一步测试。总共有96个小时所需的小灵通识别。采集标本,在液态氮冷冻(48小时)48小时和96小时(96 h)。随后的RNA提取库制备、测序和分析结果提供的RNA-seq是北京生物技术有限公司有限公司
2.5.2 RNA-seq微分的基因表达分析
微分RNA-seq样本的基因表达分析的网站上执行北京生物技术有限公司有限公司http://www.biomarker.com.cn/)。罗斯福< 0.05作为标准筛选差异表达基因,根据小灵通和不同的团体阻力和敏感性,和不同的种皮颜色的小灵通电阻,如图所示补充表S2。使用微分基因表达数据集,假定值的计算是通过注释浓缩工具北京生物技术(https://international.biocloud.net/)。
3的结果
3.1对小灵通抵抗629年小麦品种表型分析
穗发芽的方法被用来识别629个小麦品种的表型(补充表S3),包括333 red-grained和296 white-grained品种。其中,red-grained品种的数量和white-grained品种抗穗发芽的两年293和38岁的分别。Red-grained品种通常比white-grained抗性品种。在373个地方品种,305年red-grained品种,68人white-grained品种,298抗穗发芽的两年。在256年的改良品种,28 red-grained品种,228年white-grained品种,和33抗穗发芽的两年(图1)。这表明河南省粮食小麦品种的颜色从本地品种在1950年之前,已经有了很大的改变之后,改良品种,和red-grained品种逐渐改为白色粒度的品种。在过去的二十年里,所有的品种开发white-grained品种。
图1频率小灵通阻力。(两者):频率的小灵通阻力在2020 - 2021年629个品种,2021 - 2022,和他们的BLUP值,分别;1 - 5:高阻力,阻力,阻力,敏感性,分别和高度敏感性。
在阻力小灵通的识别,萌芽率飙升的范围在2020 - 2021和2021 - 2022年分别为0.51% ~ 99.22%(平均±标准差:35.38%±0.29%)和0.00% ~ 97.47%(平均±标准差:33.63%±0.25%),分别表示在两种环境中丰富的表型变异。方差分析表明,穗发芽率显著的基因型、环境及其相互作用,遗传是0.88 (P值≤0.001;补充表S4),这表明小麦小灵通阻力主要是由基因型决定和修改环境。
3.2 GWAS小灵通阻力指数629年小麦品种
小灵通的表型阻力指数在629年小麦品种在两年内被用来与所有使用六个多位点SNP标记GWAS的方法。因此,总共有22本考察团稳定检测到多个方法或环境及其比例总表型变异的解释为每个本考察团(R2)从0.00001%到38.1121% (表1)。在这些位点,两个位点,ax - 95124645 3 d染色体上和ax - 109028892 5 d染色体上,被发现了周et al。(2017),而其他位点被首次发现,尤其是ax - 111020384 3号染色体上和ax - 95124645 3 d染色体上所有的七个方法被确定的两个软件包在两个环境中,和他们的R2值分别为12.8%和38.1%,(图2),表明主要本考察团ax - 95124645小麦小灵通阻力。全基因组关联结果与小灵通阻力在272年由Wheat660当地品种的基因SNP标记(周et al ., 2017),ax - 95124645的抗性等位基因被发现只有red-grained品种有关周et al。(2017)和red-grained和white-grained品种在这项研究。在连锁不平衡分析中,协会的LD衰减距离映射人口被发现2.192 mb。这意味着2.192 Mb上游和下游地区的重要的QTL,工作频率。TAF9-3D (chr3D: 569.167 mb ~ 573.551 mb),可用于我的候选基因。
表1重大本考察团小灵通阻力指数由多个多位点检测GWAS方法在两个环境中。
图2(两者)曼哈顿情节的小灵通阻力指数629年小麦品种。如果LOD评分≥10,获得的LOD分数转换为LOD ' = 10 + 10 (LOD) / 5。
3.3 KASP QSS.TAF9-3D的标志
使用KASP标记主要本考察团ax - 95124645左右,两个单中发现的629个小麦品种(图3),即工作频率。TAF9-3D-TT and QSS.TAF9-3D-CC, which is completely consistent with the results of marker AX-95124645 obtained from 629 wheat varieties scanned by 660K chip. We also used T-A cloning and sequencing of the amplified products of Zhoumai18 (QSS.TAF9-3D-CC) and Shengsimai (QSS.TAF9-3D-TT), which there was only a T/C allele mutation at 26 bp in the amplified products of Zhoumai 18 and Shengmai. Using EnsemblPlants database (http://plants.ensembl.org/index.html),发现上面的T / C等位基因在放大产品完全符合这些物理位置的标记ax - 95124645 (图3)。工作频率。TAF9-3D-TT and QSS.TAF9-3D-CC haplotypes could be distinguished by KASP molecular marker, having 261 QSS.TAF9-3D-TT haplotypes and 368 QSS.TAF9-3D-CC haplotypes in 629 wheat varieties.
图3序列比对的KASP QSS.TAF9-3D标记放大产品重要的轨迹。(一)放大产品的序列比对Shengsimai Zhoumai18;(B)从数据库EnsemblPlants Shengsimai放大产品的序列比对;(C)从数据库EnsemblPlants Zhoumai18放大产品的序列比对;(D)红色和蓝色:品种与工作频率。TAF9-3D-TT和工作频率。TAF9-3D-CC haplotypes, respectively. Horizontal and vertical coordinates represent the fluorescence signal values of FAM and HEX, respectively.
KASP标记被用来进行单体型分析629年小麦品种。中列出的结果补充表S5。结果表明,工作频率。TAF9-3D-TT haplotype had significantly higher PHS resistance than QSS.TAF9-3D-CC haplotype. TAF9-3D-TT/CC markers accounted for 36.390% and 45.850% of phenotypic variation in SS_2021 and SS_2022, respectively. The QSS.TAF9-3D-TT haplotype was negatively correlated with the PHS resistance index, indicating that the QSS.TAF9-3D-TT haplotype was mainly distributed in varieties with high PHS resistance. Among 261 varieties with QSS.TAF9-3D-TT haplotype, 253 and 252 were resistant to spike sprouting in 2020-2021 and 2021-2022, respectively. Among the 38 white-grained resistant PHS varieties, 11 white grained varieties with QSS.TAF9-3D-TT showed PHS resistance (补充表S6)。我们认为小灵通在剩下的27个品种抗性依赖于其他相关基因或经济价值。
3.4 RNA-seq分析
3.4.1 RNA-seq GWAS的验证结果
在工作频率(度)的差异表达基因。TAF9-3D地区上市表2。结果表明微分表达式的存在之间的小灵通抗性品种(Baipimai和Shengsimai)和小灵通敏感性品种(Zhoumai18),表明协会的工作频率。与小灵通TAF9-3D阻力。随着治疗时间的增加,两个抗病品种和一个易感品种之间的度显著增加。度的数量的两个抗性品种Baipimai Shengsimai与不同的种皮颜色增加,然后降低随着治疗时间的增加,表明协会的种皮颜色与小灵通阻力。
表2不。工作频率的差异表达基因。TAF9-3D地区。
4.1在QSS.TAF9-3D候选基因
在该地区的QTL工作频率。TAF9-3D, there were 56 genes. Using the RNA-seq datasets, 9 genes were found to be differentially expressed, as shown in图4。其中,TraesCS3D01G466100去注释表明编码泛素蛋白转移酶,与NCBI守恒的域分析表明,它编码环形E3泛素连接酶。近年来,大量的研究表明,环E3广泛参与非生物胁迫过程(曹et al ., 2017)。TraesCS3D01G468500基因编码起始转录因子TAF9。目前,TAF9已经报道的功能在人类和酵母(Frontini et al, 2005年;诺尔et al, 2020年)。然而,TAF9有限研究植物。因此,这两个基因被认为是本研究的新候选基因。
图4工作频率的差异表达基因。TAF9-3D转录组。(一)热(度)之间的差异表达基因地图小灵通抗性和敏感。(B)度的分子功能和生物过程。
4讨论
全基因组关联研究小麦小灵通阻力在629年河南省地方和改良品种(行),中国提供新的视角和品种育种遗传基础的重要特征。在以前的研究中,其中大部分集中在小灵通电阻在中国西南部和南部小麦区,例如,周et al。(2017)发现长白猪在中国小麦区降水表现出强烈的小灵通高阻力在717年中国小麦一起,但也有一些研究在小麦区北部小灵通阻力少雨。在这项研究中,373名当地品种改良品种在1950年和256年河南省1950年之后被包括在内。发现基因对小麦小灵通阻力逐渐失去了选择和育种过程中产量、质量、和其他重要的繁殖特征。主要原因是大多数位点或基因对小麦小灵通阻力发现与红色种皮,虽然大多数改良品种是白色的粒度,导致普遍降低了小灵通现代改良品种的抗性。在这项研究中,38个白耐粮食品种观察,本研究为育种家提供了物质基础,为小灵通选择white-grained抗病品种。
周et al。(2017)发现三大3小灵通涉及抗性qtl在染色体,3 d、5 d,标记的ax - 95124645位于杆3 d。在这项研究中,ax - 95124645位点确定了几种多位点的方法在两个环境中与小灵通阻力,尤其是其R2值为38%。然而,这项研究提供了三个新的结果与先前的研究相比。首先,抗性和敏感的小灵通品种用来进行RNA-seq分析,发现和9度的2.192 Mb上游和下游的间隔ax - 95124645,和两个候选基因预测。然后,KASP标记工作频率。TAF9-3D-TT/CC was developed based on the AX-95124645 locus. The results showed that QSS.TAF9-3D-TT/CC haplotypes with only one T/C base allele variation could completely distinguish all the PHS resistant and susceptible varieties. Finally, all the QSS.TAF9-3D-TT haplotypes were found in 11 white-grained varieties to be resistant for PHS.
应该指出,KASP标记工作频率。TAF9-3D开发的这项研究是有价值的。首先,KASP标记是用来选择11 white-grained抗性品种的单体型工作频率。TAF9-3D-TT, indicating its possibility of marker-assisted selection in white-grained varieties for PHS resistance. But among 629 varieties, the numbers of white-grained varieties resistant to spike germination in the two years was 38. Because Wheat PHS resistance controlled by multiple genes (Imtiaz et al ., 2008),所以我们认为剩下的27个白色的穗发芽抗性粮食品种是由其他基因或经济价值。第二,这个标志使用高通量基因分型结果KASP技术。特别是KASP是基于常规PCR和荧光检测,可以满足的要求低,中,高通量基因分型的基础上,普通实验室操作(Semagn et al ., 2014),表明它是灵活的,廉价的,高通量、自动化、和准确。正如我们所知,KASP, TaqMan作为替代,在原则上类似TaqMan(也基于终端荧光阅读),但它不同于TaqMan技术在以下方面。它使用一个通用探针,可以使用各种不同的gene-specific引物,而不需要探针合成为每个特定的站点,这大大减少了实验的试剂成本(马吉德et al ., 2018)。总之,工作频率。TAF9-3D-TT/CC markers can be used for higher throughput and more accurate screening of PHS resistance varieties, especially in white-grained varieties, which provides a strong theoretical basis for molecular mark-assisted breeding.
Myb10是一个很重要的调节基因通路的色素合成。最早MYB-type转录因子识别玉米无色1 (Paz-Ares et al ., 1987)。在小麦、Tamyb10种子休眠基因被认为是相关的,因为它可能会影响小麦胚ABA的敏感性。朗et al。(2021)发现,myb10-DPHS-3D基因作为候选基因,不仅调节类黄酮化合物的合成,但也会增加在发展中种子ABA浓度,从而抑制小麦小灵通。在这项研究中,候选基因TraesCS3D01G468400被发现是一致的Tamyb10-D61个基因的注释信息的工作频率。TAF9-3D地区。虽然Himi et al。(2011)设计了Tamyb10-D标记屏幕小灵通电阻材料,Tamyb10-D是一个很重要的调节基因参与了色素合成小麦种子的外套,这样相应的分子标记主要用于屏幕red-grained小麦品种的耐小灵通,指示其困难white-grained品种的应用。我们确定了两个差异表达基因TraesCS3D01G466100和TraesCS3D01G468500工作频率。使用RNA-seq TAF9-3D地区。TraesCS3D01G466100去注释表明编码C3HC4-RING fifinger E3泛素连接酶。杨et al。(2016)确认AtAIRP4在拟南芥中,由ABA诱导治疗和其他压力。AtAIRP4编码细胞蛋白质与C3HC4-RING手指域的c端方面,已在体外E3连接酶的活动。大量的研究表明,小麦种子的休眠周期与小灵通程度负相关(Flintham et al ., 2000;Biddulph et al ., 2008;蜀et al ., 2016)、ABA起着至关重要的作用在促进种子休眠和抑制种子萌发(Martinez-Andujar et al ., 2011)。因此,它是可能的TraesCS3D01G466100影响小灵通阻力通过调节种子ABA水平。TraesCS3D01G468500基因编码的起始转录因子TAF9。杨(2015)克隆一个基因CpTAF9在木本观赏植物Chimonanthus melanoides。盐胁迫、高温或ABA应用推广的表达CpTAF9基因在树叶。ABA是一个重要的激素调节种子dormanness。TraesCS3D01G468500由间接调节基因可能影响小麦的穗发芽种子ABA含量。我们选择这两个基因的新小灵通抗性候选基因。
5的结论
我们首先确定38 white-grained品种与小灵通阻力在629年小麦品种(线)来自河南,中国稳定识别主要本考察团ax - 95124645 3 d染色体上,并开发其KASP QSS.TAF9-3D-TT / CC标志。这个标记单体型可以有效地检测到小灵通电阻材料,尤其是white-grained品种与工作频率。TAF9-3D-TT haplotype are resistant to spike sprouting, which can be used for molecular mark-assisted breeding of spike sprouting resistance in white-grained varieties. This study provides material and methodological basis for breeding wheat PHS resistance in the future.
数据可用性声明
测序数据已经成功提交GEO数据库和申请公开披露。加入地理数字GSE222342, BioProject加入号码是PRJNA919175。
作者的贡献
W-GX构想和管理研究和修订后的手稿。CK和C-JP分析数据集。CK测定的表型特征。LH和H-BD提供研究资料和工具。CK草案写道。所有作者的文章和批准提交的版本。
资金
这项工作是国家重点支持的研究和发展项目(2021 yfd1200601-03),中国的优秀青年科技基础河南农业科学院(2022 yq17),财政部的中国农业研究体系和马拉(CARS-03-7),和河南农业科学院自主创新专项基金(2022 zc73)基础。
确认
摘要教授我们感激张河南农业科学院和华中农业大学修改这个手稿。
的利益冲突
作者声明,这项研究是在没有进行任何商业或财务关系可能被视为一个潜在的利益冲突。
出版商的注意
本文表达的所有索赔仅代表作者,不一定代表的附属组织,或出版商、编辑和审稿人。任何产品,可以评估在这篇文章中,或声称,可能是由其制造商,不保证或认可的出版商。
补充材料
本文的补充材料在网上可以找到:https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2023.1118777/full补充材料
引用
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关键词:秋收之前的那次小麦的发芽,全基因组关联研究,RNA-seq, KASP mrMLM
引用:胡董彭口C, C, H, L和徐W(2023)映射秋收之前的那次和发展KASP标记为数量性状的萌芽在中国河南小麦品种的抗性。前面。植物科学。14:1118777。doi: 10.3389 / fpls.2023.1118777
收到:08年12月2022;接受:2023年1月02;
发表:2023年2月02。
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