编辑:组学的客观诊断和管理免疫介导性风湿性疾病
Tieh-Cheng傅
Yen-Ying龚
Jr-Rung林
Ching-Mao常- 1物理医学与康复,长庚医院,台湾基隆
- 2心脏病学、内科、心脏衰竭研究中心,台湾基隆长庚纪念医院
- 3医学院,医学院桃园、台湾长庚大学
- 4传统医学中心,台北荣民总医院,台北,台湾
- 5医学院,国家杨明交通大学,台北,台湾
- 6传统医学研究所国家杨明交通大学,台北,台湾
- 7临床信息学和医学统计研究中心研究所的临床医疗、桃园、台湾长庚大学
编辑的研究课题
组学的客观诊断和免疫介导的风湿性疾病的管理
自身免疫性风湿病疾病(ARD)如系统性红斑狼疮(SLE),干燥综合征(SS)、类风湿性关节炎(RA)、系统性硬化症、血管炎和慢性炎症机制的问题包括氧化应激、B / T细胞失衡,I型干扰素(IFN) -α,以及一些炎症介质(1,2)。ARDs诊断复杂,部分是由于与其他疾病混淆他们的可能性(高3,4)。他们通常是用糖皮质激素治疗疾病修饰剂如羟氯喹、甲氨蝶呤、柳氮磺胺吡啶,硫唑嘌呤,或生物制剂,如肿瘤坏死因子(TNF)抑制剂(服用依那西普、英夫利昔单抗,adalimumab certolizumab pegol, golimumab)、白介素(IL) 1抑制剂(anakinra)、IL - 6抑制剂(叫和sarilumab) IL-17抑制剂(secukinumab), t细胞抑制剂(abatacept), b细胞抑制剂(利妥昔单抗),或者杰纳斯激酶抑制剂(tofacitinib, baricitinib, upadacitinib) (5)。然而,这些药物功效较低,相对严重的副作用,或者非常昂贵(6- - - - - -8)。
许多最近的研究使用“组学”工具,如基因组学(9)、转录组(10),蛋白质组学(11),代谢组学(12)和microbiomics (13ARD)方法客观地诊断和管理。由于涉及信息的复杂性,multi-omics分析已被推荐为这些疾病提供一个更全面的观点(14- - - - - -18)。通过这种综合multi-omics分析,人们普遍预期,个人将受益于精密医学治疗的新靶点和治疗策略(19- - - - - -21)。
王等。申请肠道microbiomics 19系统性红斑狼疮患者和19岁的健康的家庭成员,与肠道微生物群16 s rRNA和系统性红斑狼疮临床表现。尤其是,他们的研究结果表明降低α多样性和异质性在系统性红斑狼疮组高于对照组,减少前者的Acidobacteria、Gemmatimonadetes Nitrospirae和Planctomycetes在门级,增加链球菌、韦永氏球菌属、梭状芽孢杆菌,罗思氏菌属在属的水平。最重要的是,链球菌非常丰富其中狼疮患者。操作分类单位Lachnospiracea incertae基准和Parasutterella负相关,减少血小板和肺动脉压力,分别。然而,系统性红斑狼疮患者和健康人的样本在这项研究中都是小的,和它的结果应该确认通过大规模的调查。
因为系统性红斑狼疮和SS似乎发病机理相似,理解这些疾病之一,可以帮助我们理解对方。肖等。报道,N6-methyladenosine (m6A) RNA修改与初级党卫军的发病机理,根据一项研究,其中包括44个主要SS患者,50 age-gender-matched健康对照组,患者和11 age-gender-matched non-SS新铸的卢比。具体地说,肖等。测量的mRNA水平m6A元素、ISG15和USP18外周血单核细胞(PBMCs),并发现METTL3的表达,RBM15, ALKBH5, FTO, YTHDF1, YTHDF2, YTHDF3, YTHDC1, YTHDC2主SS患者高于健康对照组。此外,METTL3的表达、RBM15 ALKBH5, FTO, YTHDF1, YTHDF2, YTHDF3, YTHDC1, YTHDC2更高在初级SS患者比non-SS新铸的卢比。因此,它是可能的,FTO YTHDF2, YTHDF3,和/或YTHDC2 ISG15可能目标,并激活类型我在初级党卫军IFN-signaling途径。值得一提的是,USP18也是deubiquitinating蛋白酶的酶家族的一员,并且还可以抑制IFN-α-mediated Jak / STAT信号通路(22,23)。然而,重要的是肖等。仅从PBMCs信使rna提取。检测从唾液腺mRNA水平更直接,因此更适合未来的研究相同的话题。
并不是所有的RA患者出现类风湿因子(RF)和anti-citrullinated蛋白抗体(ACPA),这使RA的临床诊断。Ruiz-Romero et al。使用iTRAQ-based定量蛋白质组学分析80 RA血清样本分为四个游泳池,验证结果与另一个80个这样的样本,用260份更多这样的样本和验证。他们的研究结果表明(1)的血清水平alpha-1-acid糖蛋白1 (A1AG1),结合珠蛋白(HPT)和retinol-binding蛋白4 (RET4)更高的double-seropositive组;和(2)A1AG1水平的增加与RF(射频+ A1AG +),而HPT与ACPA (ACPA + HPT +)。然而,Ruiz-Romero et al。不报告他们的受试者的治疗,疾病持续时间、疾病活动或可能的关节外表现,所有这些可能是RA的重要预测因子。
t细胞large-granular淋巴细胞(T-LGL)白血病与ARDs有关,尤其是RA。Gorodetskiy et al。招收了72名患者ARD绝对T-LGL项< 1.5×109 /l,患者和11 ARD绝对T-LGL计数< 1.5×109 /l。结果表明:突变STAT3被发现在56%的25例单克隆t细胞受体基因重排模式,作者建议患者并没有表现出恶性LGLs血液或骨髓中有“脾变体”T-LGL白血病。然而,这样的结果还应证实了大规模的调查,特别是在患者没有血液或骨髓恶性LGLs的参与。
加速ARDs的客观诊断的目的,这种特殊的主题调查ARDs的组学方面和特定的组学及其组合如何与诊断和治疗。确定基因型和表型之间的联系将帮助研究者和临床医生更准确和有效的诊断;和multi-omics分析角色的分子调节机制和oral-gut微生物群在ARDs有望帮助研究人员和临床医生寻找治疗新靶点。
作者的贡献
T-CF、Y-YK J-RL, C-MC负责研究概念和设计,研究设计的修改,审查和解释数据,导致数据的收集和分析,导致数据的解释和修订后的手稿。T-CF和C-MC负责起草手稿。Y-YK、J-RL C-MC修改研究设计和修订后的手稿。所有作者阅读和批准最终的手稿。
资金
本研究在传统医学中心的支持下,台北荣民总医院,台北,台湾(v108b - 031和v109b - 034)和国家科学技术委员会,台北,台湾(nstc - 111 - 2320 - b - 075 - 006 - my2)。
的利益冲突
作者声明,这项研究是在没有进行任何商业或财务关系可能被视为一个潜在的利益冲突。
出版商的注意
本文表达的所有索赔仅代表作者,不一定代表的附属组织,或出版商、编辑和审稿人。任何产品,可以评估在这篇文章中,或声称,可能是由其制造商,不保证或认可的出版商。
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关键词:基因组学、蛋白质组学、微生物群、转录组、客观诊断和管理
引用:傅温度系数,龚等号左边,林J-R和Chang决定物价(2023)编辑:客观的诊断和管理的组学免疫介导性风湿性疾病。前面。地中海。10:1127430。doi: 10.3389 / fmed.2023.1127430
收到:2022年12月19日;接受:2023年1月02;
发表:2023年1月13日。
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