肠道的多样性、阴道、口腔微生物与没有先兆子痫孕妇在南非
- 1医学微生物学、健康科学学院,比勒陀利亚,南非比勒陀利亚大学
- 2微生物生态学中心和基因组学、生物化学、遗传学和微生物学,比勒陀利亚,南非比勒陀利亚大学
- 3妇产科,Rahima穆萨母亲和儿童医院,智慧妇产科临床研究部门,临床医学学院,健康科学学院,南非约翰内斯堡的威特沃特斯兰德大学
- 4医学微生物学、内学术部门,比勒陀利亚,南非国家卫生实验室服务系统
背景:微生物群落的变化是一个已知的特点,各种炎性疾病和与不良妊娠结局,如早产。然而,有一个缺乏信息分类组成和/或先兆子痫的微生物群落多样性。本研究的目的是确定肠道的多样性,阴道和口腔微生物群南非孕妇有无先兆子痫。肠道的多样性、阴道和口腔微生物由目标决定下一代测序(上天)V3和V4地区16 s rRNA基因的Illumina公司MiSeq平台。
结果:在本研究中,先兆子痫明显高于α多样性(有关P= 0.0472;由香农指数表示)阴道微生物伴随着显著减少乳酸菌spp。(P= 0.0275),而血压正常的孕妇。乳酸菌内心被确认为主要物种的阴道微生物组两个组别。高inter-individualα多样性的变化在肠道和口腔微生物群。虽然相对丰度的差异观察细菌的系统发育水平,整体肠道微生物组成的,口腔和阴道微生物组没有显著不同的先兆子痫组相比,血压正常的队列。
结论:总的来说,减少乳酸菌spp和优势l .内心的与先兆子痫孕妇可能意味着一个不稳定的阴道微生物可能会使孕妇先兆子痫。缺乏显著的结构性变化在肠道,口腔和阴道微生物特征并不表明社区发挥作用在先兆子痫,但可以显示一个独特的研究人口特征。目前的研究提供了新颖的信息在肠道的多样性,口腔和阴道微生物在南非有无先兆子痫孕妇。当前的研究为进一步的调查提供了一个基准在先兆子痫微生物群落的潜在作用。
背景
先兆子痫是一种多系统和多因子的紊乱的怀孕,怀孕期间由最近诊断为高血压诊断和一个或多个器官系统损害蛋白尿、溶血、肝酶升高和低血小板计数,神经或视觉症状,异常多普勒超声和胎儿生长受限(1- - - - - -3)。这个障碍进一步的特点是两个亚型称为母亲的亚型,与代谢和免疫介入,缺血性胎盘,胎盘亚型,其特征是紧随其后的是产妇全身炎症(4,5)。子痫前期有一个复杂的病因诊断的生物标志物和批准治疗尚未公布。这种疾病的确切原因仍然未知;然而,它与夸张的系统性炎症和某些风险因素,如糖尿病和肥胖,建议微生物可能在疾病发病机制中发挥作用6- - - - - -8)。孕产妇微生物被认为是一个重要的因素是影响和影响怀孕的生理过程包括免疫、代谢和激素的变化(9)。阴道微生物群在胎盘,远端肠道和口腔之前已经被卷入孕产妇健康也可能在子痫前期的发病机制(10- - - - - -12)。因为Amarasekara et al。(13)描述了胎盘微生物群与先兆子痫孕妇,冲突的存在和潜在作用的信息已报告在先兆子痫胎盘微生物(14- - - - - -18)。然而,共生的微生物的存在来自口腔、肠道和阴道在先兆子痫和高血压妊娠的胎盘已经重新胎盘微生物的作用通过细菌易位(12,13,19)。
肠道微生物的生态失调可能导致高血压的发病机制和影响孕妇的适应包括胎盘功能(20.,21)。的贡献作用破坏肠道微生物在代谢疾病、血压(BP)规定,慢性炎性疾病和复杂怀孕可能指向一个角色在先兆子痫的发展(19,22,23)。一些研究调查了生育年龄妇女的阴道微生物的组成和稳定,简单的怀孕和自发性早产的孕妇(24- - - - - -26)。阴道微生物在简单的怀孕的特征是低的丰富性和多样性与丰度的增加乳酸菌物种,怀孕期间获得稳定和恢复力(27)。然而,上有不确定性成分和早产阴道微生物组的贡献作用。虽然减少乳酸菌物种已被建议作为早产的危险因素,不同的研究结果也被报道(25,26,28- - - - - -30.)。
口腔微生物被称为一个最多样化的微生物在人体产生强烈影响全身健康(31日- - - - - -33)。牙周疾病能导致系统性疾病包括动脉粥样硬化性心血管疾病、风湿性关节炎、糖尿病和不良妊娠结局(34- - - - - -39)。细菌种类与口腔感染有能力把和殖民extra-oral胎盘,等网站,这种现象导致建立口腔感染和系统性不良条件(之间的联系40- - - - - -42)。此外,产妇牙周病曾被发现与早产和先兆子痫的风险增加有关(43- - - - - -45)。
目前下一代测序(上天)技术,包括目标16 s rRNA测序和宏基因组使微生物群落的特征与妊娠和妊娠并发症,如先兆子痫。微生物群落在先兆子痫的描述可能揭示微生物群落结构变化是否与先兆子痫和还可以提供有关指示性生物标记的发展未来的预防和治疗策略。本研究的目的是确定肠道的多样性,阴道和口腔微生物群先兆子痫和血压正常的孕妇。
方法
样品收集
所有的参与者在这个研究是从省级医院招募在约翰内斯堡,南非。十初次分娩的孕妇,≥18年,与孕龄≥28孕周(第三阶段),包含在两个军团之一(N=正常/血压正常的人P=先兆子痫)规则后十(46)。根据研究参与者选择标准后体检是由医疗专业人员或使用医院记录时可用。参与者阴道感染症状包括已知的病毒感染,如人类乳头状瘤病毒(HPV),抗生素的使用在前4周样本集合,以前的流产和胎龄≤28周被排除在研究之外。样本收集之前获得知情同意。
三个样品从每个参与者描述了肠道,阴道和口腔微生物组,分别。直肠拭子代替粪便样本中收集由产科医生插入一个聚集干拭子(FLOQSwabs 552 c,科潘,CA)肛管(±3厘米)肛门边缘之外(47)。midvaginal拭子是收集的干植绒拭子插入阴道阴道分泌物吸收(±2厘米)。唾液是通过使用无菌植绒拭子在一个稳定的位置放在舌头下2分钟。新鲜收集样本标记,保存和运输在冰系的实验室医学微生物学,比勒陀利亚大学比勒陀利亚和储存在−20°C到处理。在这项研究中使用的示例标记指的是网站的集合,即。,R =直肠/肠道,V =阴道,O =口服两组样本。
细菌基因组DNA隔离
提取方法在这项研究是适应使用不同的细菌裂解酶和足够的隔离所有细菌的生物存在于肠道,口腔和阴道24,48,49)。存储干棉签(−20°C;F700-SAEV-TSC;热科学,沃尔瑟姆,MA)在冰上融化了基因组DNA隔离前30分钟。卷2毫升无菌1 x磷酸缓冲盐(PBS)(美国生命技术公司,卡尔斯巴德,CA)被添加到解冻样本。直肠和阴道拭子培养在室温(25°C±5°C) 2 - 3 h和混合在一个vx - 100旋涡混合器(Labnet国际,爱迪生,新泽西)最大速度为5分钟有效暂停所有细胞材料(24)。口腔拭子培养一夜之间在4°C,在混合大力在最大速度为5分钟释放所有细胞材料在PBS溶液(24)。总细菌基因组DNA (gDNA)使用Bioline孤立隔离II基因组DNA工具包(Bioline)遵循制造商的指示(见小修改补充材料)。孤立的浓度gDNA由使用NanoDrop决定Rnd - 1000分光光度计(热科学)和纯度由吸光度的比值决定在260和280海里(260/280)。孤立的DNA是归一化的最终浓度10 ng /μL 25μL的总量。归一化的DNA是用于16 s rRNA扩增和测序。
目标放大16 s rRNA变量的域(V3和V4)
基因组序列生成的V3和V4地区16 s rRNA基因放大使用Illumina公司片剂寡核苷酸(集成DNA技术,珊瑚镇,IA),包括Illumina公司适配器过剩核苷酸序列(50)。聚合酶链反应(PCR)条件和试剂卷是可用的补充信息。消极的控制从每个gDNA隔离步骤包括在放大的步骤来确定遗留污染样品和试剂之间的可能性在这些步骤。使用隔离放大产品纯化二世PCR和凝胶工具包(Bioline)根据制造商的说明进行微调(见补充材料)。
图书馆准备和16 s目标门店
纯化放大产品报弧生物技术平台,Onderstepoort,比勒陀利亚,南非库制备和门店的Illumina公司MiSeq平台。测序库创建根据Illumina公司16 s宏基因组准备网上(见协议补充材料)。16 s rRNA基因测序在MiSeq音序器创建300个基点与V3 paired-end读取600个周期工具包(Illumina公司,圣地亚哥,CA)。生paired-end FASTQ收到文件的每个样本进行后续分析。
序列图和统计分析
使用定量的有针对性的分析了宏基因组序列数据洞察微生物生态学(QIIME)管道,版本9.1 (51)。匹配paired-end序列合并使用fastq-join命令的ea-utils软件包(52)。嵌合序列被确定使用USEARCH从序列合并和删除数据库6.1版(53)。开放的参考方法被用来分配97%的身份(ID)操作序列分类单元(辣子鸡)。分类被分配当代表序列的每个OTU一致反对绿色煤电12 _10数据库,使用基本的局部比对搜索工具(爆炸)计划纳入QIIME软件(54)。
结果unrarefied OTU表和种系发生树中产生QIIME用于多样性和统计分析使用Rstudio版本1.0.136 (55)。使用统计分析和图形的生成ggplots(综合方案phyloseq版本1.19.1和包tidyverse1.1.1版)被用作Rstudio中实现。这些包也被用于生成堆叠柱形图的可视化分类组合在每个样本。只选择序列代表细菌序列代表线粒体,古生菌和叶绿体中OTU Rstudio表和系统发育树。样品中含有少于1021辣子鸡的稀疏深度被α和β多样性分析。由此产生的数据集包括肠道微生物组共有14个样品,10样本在阴道微生物和11在口腔微生物样品。每一个微生物组的数据提取从稀薄OTU表来推断每个单独微生物组的统计分析。由于小样本大小,假设数据不服从正态分布模式。因此,非参数克鲁斯卡尔-沃利斯卡方测试是用来评估差异(排名P值< 0.05)在α多样性和军团之间的分类单元的相对丰度百分比95%置信区间(56)。α多样性Chao1指数测量的一种间接测量的丰富性和香农多样性指数、均匀度的一种间接测量(56)。
β多样性的分析,主坐标分析(PCoA)情节生成加权和未加权的unifrac距离矩阵vizualize军团之间的差异(57)。统计学意义的军团之间的微生物群落的差异计算使用permanova测试,阿多尼斯(分析不同),R包中实现素食主义者2.4版本-3.0 (58)。该方法包括999名排列和加权和未加权的unifrac距离矩阵。
结果
样本来自21个参与者提供知情同意,符合入选标准。十一个参与者招募在对照组和10个参与者招募了研究小组。所有参与者在一个年龄在18到35岁之间与胎龄32至40周。从每个样本DNA提取的量化,其次是放大,然后用于后续分析。序列分析,选择的辣子鸡QIIME导致数据集545677序列和1751年的识别分类单元之间的63个样本。平均9094辣子鸡形成最低73,最高64247 63个样本之间的辣子鸡。稀疏之前允许正常化测序数据统计分析和识别的样本测序数据不足;测序数据不足可能会影响后续分析微生物群落的由于不准确的表示。后稀疏,OTU表包括肠道、阴道和口腔微生物总数由884个类群和35个样本从最初的63个样本(减少)。稀薄的队列由共有14样品(血压正常的人,N= 8;先兆子痫,P= 6)对肠道微生物的分析,10个样本(N= 5;P= 5)阴道微生物和11个样本(N= 5;P口腔微生物的= 6)。所有的35个样本分析进行了来自14个参与者池在最后队列(即。,three and four participants were excluded from the normotensive and pre-eclampsia cohorts, respectively, as none of their samples were included after rarefaction). All participants were of black South African ethnicity except one of the participants who was of white South African ethnicity.
α和β多样性分析
更高的平均α多样性在肠道被发现,口腔和阴道微生物与先兆子痫孕妇相比,血压正常的孕妇(表1)。α多样性的差异观察肠道微生物组之间并没有显著的Chao1指数(P= 0.1213)和香农指数(P= 0.09329)。的差异也不显著Chao1 (P= 1)和香农指数(P在口腔微生物= 0.715)。在阴道微生物组,两组之间未发现显著差异的多样性(P香农指数= 0.0472),但不是Chao1指数(P= 0.3472)(图1)。
主坐标分析基于UniFrac距离使用系统发育信息并没有发现不同的肠道微生物群落的分离,阴道和口腔微生物群(图2一个- - - - - -F)。不同的测试,阿多尼斯指出,肠道微生物在先兆子痫组相比没有显著不同的血压正常的队列使用UniFrac加权(R2= 0.02266;P= 0.987)和未加权的(R2= 0.07072;P= 0.568)距离矩阵。同样,先兆子痫的口腔微生物组也没有显著不同的血压正常的队列使用UniFrac加权(R2= 0.10288,P= 0.354)和未加权的(R2= 0.12881,P= 0.185)距离矩阵。阴道微生物组,一个清晰的分离的先兆子痫和血压正常的群组是可见PCoA情节UniFrac加权距离矩阵;然而,这一发现与加权(没有统计学意义R2= 0.30017,P= 0.05)和未加权的距离矩阵(R2= 0.2344,P= 0.068)(图2 c)。
图2。(f)主坐标分析(PCoA)的肠道,阴道、口腔微生物显示肠道微生物之间的异同的正常血压组相比,先兆子痫组使用加权(A, C, E)和未加权的(B, D, F)UniFrac距离矩阵。每一个点表示每个样本的微生物N=血压正常的队列,P=子痫前症群。
比较之间的肠道微生物群
肠道微生物在不同分类水平分析了两组包括门,属和物种水平。虽然厚壁菌门是最丰富的门,军团之间的相对丰度没有显著差异(厚壁菌门;P= 0.6985,拟杆菌门;P= 0.8973,Fusobacteria;P= 0.08117,变形菌门;P= 0.7026,放线菌;P= 0.9485)。没有发现显著差异的相对丰度在属水平(P军团之间的值> 0.05);然而,几个属的相对丰度的变化被观察到。子痫前期组有较高的相对丰度拟杆菌(6.41%与4.73%),Faecalibacterium(12.35%与10.61%)Blautia(7.61%与3.67%)。相比之下,血压正常的组有较高的相对丰度Anaerococcus(7.56%与3.59%),Clostridioides(5.64%与3.21%),Finegoldia(4.78%与2.9%)普氏菌(15.17%与12.30%)。
在物种水平,更高的相对丰度消化链球菌属anaerobius(平均相对丰富的23.36%)观察子痫前期组与正常血压组(7.8%)相比,虽然差异不显著(P= 0.1824)。Faecalibacterium prausnitzii(平均相对丰度分别为35.79%和42.69)乳酸菌内心(平均相对丰度分别为21.67%和36.49)更丰富的先兆子痫组相比,血压正常的人。
比较之间的阴道微生物群
的厚壁菌门主要的门在阴道微生物平均74.28%和95.2的相对丰度在血压正常的和先兆子痫组,分别。图3表明整个微生物组合在属的水平上。只有属相对丰富的超过30%在每个样本显示在图。属乳酸菌显著降低(P= 0.0275)在先兆子痫组(61.5%)相比,血压正常的人群(92.6%)。属的相对丰度高普氏菌,Peptoniphilus和Anaerococcus和增加Dialister子痫前期组也被观察到。的属Megasphaera Sneathia Parvimonas,梭状芽孢杆菌和消化链球菌属独特的发现仅在先兆子痫组(图3)。
在低水平的丰富,Atopobium种虫害中平等的相对丰度在两组(3.89%和3.93),而一个轻微的增加气球菌属spp。(平均相对丰富的2.94%比1.92%)加德纳菌属spp。(5.84%相比,平均相对丰度4.83%)中检测出血压正常的组织。乳酸菌内心被确定为主要的物种在阴道微生物组的血压正常的人(97.71%)和先兆子痫组(86.14%)。更高的相对丰度Atopobium阴道(平均相对丰富的6.56%至4.51%)观察子痫前症群。的存在普氏菌melaninogenica和消化链球菌属anaerobius也在先兆子痫组群独特的发现。
口腔微生物组之间的比较
口腔微生物的PCoA见图2 e,F表示没有明确分离的口腔微生物群落与先兆子痫孕妇血压正常的和女人之间。然而,这个情节也显示相似度和高群体内变异,这证实了口腔细菌属和物种的相对多度水平。的厚壁菌门主要的门在口腔微生物组在血压正常的人(70.98%)和先兆子痫组(67.76%)。在属的水平上,链球菌是两个组别的主要细菌属其次是减少大量的订单普氏菌嗜血杆菌、奈瑟氏菌属和韦永氏球菌属。更高的相对丰度值链球菌,Granulicatella和Veilonella观察血压正常的组。奈瑟氏菌属(4.27%和4.46)Porphyromonas(2.68%和2.49)在两组中发现类似的相对丰度。普氏菌(4.13%和5.16)嗜血杆菌(13.29%相比8.4%)更丰富的子痫前症群。属等罗思氏菌属、Sneathia梅毒、Parvimonas普氏菌、假单胞菌和Gemella被发现在低丰度。
子痫前期组有更高的平均相对丰富的物种普氏菌melaninogenica(23.57%)和奈瑟氏菌属subflava(6.96%)相比,血压正常的队列(分别为17.84%,3.93%)。奈瑟氏菌属灰质和n Oralis被发现在两个组别。物种的相对多度罗氏菌属dentocariosa高(P= 0.02535)的血压正常的人群相比,先兆子痫组。
讨论
据我们所知,这是第一个研究描述和确定肠道的多样性,阴道和口腔微生物组与先兆子痫孕妇在南非。先兆子痫是高血压的并发症在怀孕的一个主要贡献高母体/胎儿的发病率和死亡率在全球范围内以及在南非(59,60)。研究发现所涉及的复杂病理先兆子痫正在为了发展预防和治疗策略。在当前的研究中,与先兆子痫孕妇显示更大的系统发育多样性的丰富(类群的数量存在)和均匀度(丰富的许多微生物成分)相比,血压正常的孕妇。高inter-individual变化很明显在肠道和口腔微生物的特征和程度较轻的阴道微生物和重要的微生物群落结构变化也不见了。高inter-individual变异在这项研究是观察人类微生物组的项目支持的财团,该报道称,个人不同的特定的微生物和运输inter-individual微生物是特定的变化,功能上相关的、个性化的(61年)。不管inter-individual变异和小样本大小,显著增加α多样性伴随着减少乳酸菌物种被发现在阴道微生物群与先兆子痫孕妇,孕妇血压正常的人相比。
减少肠道微生物的多样性是一个已知的暗示指标微生物与人类疾病相关的不平衡(62年)。与当前研究的结果(19),发现α多样性的减少与先兆子痫孕妇。另一项研究发现之间没有差异的多样性与没有先兆子痫孕妇(63年)。α多样性的分析当前的研究因此不是暗示一个不平衡或破坏肠道微生物组。的霜et al。(62年),α多样性的增加,而导致更大的稳定性和弹性的肠道微生物组。肠道微生物的分类特征揭示了混合微生物物种除了几件样品有一个占主导地位的细菌物种,包括双歧杆菌longum, Moryella indoligenes和乳酸菌内心。多样性和肠道微生物的组成是多才多艺的,受到各种外部和内部因素,如饮食和宿主基因。物种优势可以在特定时间特定个体存在与一种特定的功能(64年)。几个物种等消炎Faecalibacterium prausnitzii发现先兆子痫组,表示一个平衡的肠道微生物组没有显著的结构性变化可能作用在先兆子痫的发展(65年- - - - - -69年)。
与肠道微生物组相似,不同口腔微生物为特征的女性,没有先兆子痫。口腔微生物的多样性被发现在怀孕期间是稳定的,也没有发现口腔疾病的变化(70年)。α多样性的变化因此不是怀疑在先兆子痫扮演一个角色。微生物特性表示的主导地位链球菌spp,据报道在健康口腔微生物组(71年,72年)。其他物种,如罗思氏菌属、嗜血杆菌、奈瑟氏菌属spp,曾被观察到在健康的个体,因此,不知道这些物种可能导致子痫前期在当前的研究中(73年- - - - - -75年)。这些物种的存在表明不同口腔微生物存在于孕妇有无先兆子痫。此外,未发现与牙周炎相关病原物种在当前的研究中假设任何与先兆子痫(76年)。
描述两个组别的阴道微生物提供了更多信息的结构孕妇阴道微生物群的南非。种族差异有很强的对群落结构的影响;例如,气球菌属spp。Peptoniphilusspp。Dialisterspp。Atopobiumspp。Sneathia种虫害和加德纳菌属spp。已发现更多健康的非裔美国和非洲女性(77年,78年)。此外,减少阴道酸性环境中描述的黑人和西班牙裔妇女也可以影响微生物多样性(24)。结果在南非人口同样报告了主导地位l .内心的在南非黑人女性(79年)。乳酸菌内心也被报道与其他BV-related共存的细菌(24,78年,80年- - - - - -83年)。
在子痫前期组群分类观察显示相似BV-associated阴道微生物,特点是高细菌多样性,低丰度的乳酸菌种虫害和更高的丰度Atopobiumspp。Dialisterspp。加德纳菌属spp。普氏菌种虫害和Sneathiaspp。(84年)。低丰度乳酸菌spp。可能有重大的健康后果,如增加阴道炎症和病原感染的易感性(79年)。相对丰度的下降乳酸菌spp。和主导地位l .内心的可能会进一步导致不稳定的女性阴道微生物与先兆子痫。Petricevic et al。(85年)描述了一种阴道微生物主要由一个阴道乳酸菌物种,特别是l .内心的在怀孕头三个月,可能是与早产有关。另一项研究通过点火et al。(86年)确定的优势l .内心的作为早产的危险因素,而优势的l . crispatus高度预测的一个术语。其他的研究发现l .内心的代表一个过渡阶段的阴道微生物之间的健康和dysbiotic州可能促进BV的复发(80年,87年- - - - - -89年)。
不管低样本数量,当前研究的结果与先前的研究一致,发现细菌多样性的增加伴随着减少乳酸菌spp。,在复杂的怀孕(11,86年,90年- - - - - -92年)。多样性分析的加权UniFrac距离矩阵表明,细菌类群的相对多度可能扮演更重要的角色在比较分析两组之间的分类单元的缺失或存在。的共存l .内心的两个组别和厌氧类群可能表明一个不稳定的和过渡在南非孕妇阴道微生物(78年,93年- - - - - -95年)。然而,这些发现同时有显著的减少乳酸菌spp,发现与先兆子痫孕妇可以歧视阴道微生物独特研究人口的阴道微生物可能增加患先兆子痫的风险。
本研究的优点是识别所有微生物类群的系统发育水平,尤其是在物种水平低丰度百分比,这是需要解锁功能微生物在健康和疾病的复杂性。分析在物种水平是至关重要的,不同的物种有不同功能的能力,这是需要链接的变化人类微生物组健康或疾病。在这项研究中使用的示例收集策略占尽可能多的变化包括一个同质组孕妇在怀孕第三阶段,相同的种族,年龄和艾滋病毒状况。其它优势的研究包含正常血压组比较匹配控制队列和同时表征微生物体内三个不同的网站。
本研究的局限性包括小样本大小用于统计分析由于排除样品测序数据不足。为inter-individual可变性控制,样品需要尽可能均匀。然而,通过排除出现感染症状的妇女(阴道和口腔感染),它可能排除了一些物种可能与子痫前期的发病机制。没有无症状BV在两组的参与者没有证实使用实验室方法,应该考虑这一研究报告的结果。限制的研究因此,排除或确诊的BV是没有证实两个组别中参与者之间,因此目前尚不清楚BV有贡献作用先兆子痫的观察阴道微生物群和天气BV可能增加这些妇女发展先兆子痫的风险。另一个限制是捕获的医疗信息的缺乏招募的参与者,如身体质量指数(BMI)、白细胞(WBC)计数和出生的结果。
结论
目前的研究提供了一个多样性的分析肠道,阴道和口腔微生物群南非孕妇有无先兆子痫。孕妇的阴道微生物组显著减少的特征乳酸菌spp和主导地位l .内心的有一个不稳定的阴道微生物,可能会增加患先兆子痫的风险。多样性和成分分析显示有重要数据,否则稀疏的肠道,口腔和阴道微生物与先兆子痫孕妇(主要是非洲黑人)在南非。在未来的研究中,更大的群组研究中进行功能和肠道的纵向分析,阴道和口腔微生物可能显示额外的变化在这些微生物群落与先兆子痫孕妇。
数据可用性声明
在这项研究中提出的数据集可以在网上找到存储库。库的名称/存储库和加入数量(s)可以找到如下:NCBI SRA数据库,加入PRJNA798597数量(BioProjectID)。
道德声明
研究涉及人类受试者的研究伦理委员会审查和批准学院健康科学,比勒陀利亚大学比勒陀利亚,南非(116/2016)和人类研究威特沃特斯兰德大学的伦理委员会,南非约翰内斯堡(M160573)。患者/参与者提供了他们的书面知情同意参与这项研究。
作者的贡献
詹是项目负责人,参与了概念设计、样本采集、实验室工作,数据分析,和写作的手稿。可首席研究员和授予持有人。可,奥,我参与的概念设计研究的回顾以及手稿。霍奇金淋巴瘤是参与的概念设计研究,协助样品收集和向临床方面的研究做出了贡献。直流涉及通过提供对数据分析的支持。所有作者阅读和批准最终的手稿。
资金
科提供的金融支持研究信任。
确认
作者要感谢比勒陀利亚大学和国家卫生实验室服务系统(科)收到的财政援助以及Rahima穆萨母亲和儿童医院样本收集和微生物生态学的中心和基因组学(CMEG)计算机设备在数据分析和帮助。
的利益冲突
作者声明,这项研究是在没有进行任何商业或财务关系可能被视为一个潜在的利益冲突。
出版商的注意
本文表达的所有索赔仅代表作者,不一定代表的附属组织,或出版商、编辑和审稿人。任何产品,可以评估在这篇文章中,或声称,可能是由其制造商,不保证或认可的出版商。
补充材料
本文的补充材料在网上可以找到:https://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fgwh.2022.810673/full补充材料
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关键词:肠道微生物、阴道微生物,口腔微生物,先兆子痫,妊娠,16 s rRNA序列,多样性
引用:Geldenhuys J, Redelinghuys MJ, Lombaard哈,埃勒斯医生MM,考恩D和考克毫米(2022)肠道的多样性,阴道和口腔微生物与没有先兆子痫孕妇在南非。前面。水珠。女性健康3:810673。doi: 10.3389 / fgwh.2022.810673
收到:2021年11月07;接受:2022年7月29日;
发表:2022年9月16日。
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