慢性乙型肝炎病毒感染者错配修复基因(MMR)多态性的综合研究
- 1中国河北医科大学公共卫生学院
- 2中国河北医科大学
- 3.河北医科大学公共卫生学院流行病学与统计学系
背景与目的:本研究重点研究了MMR基因单核苷酸多态性与HBV感染发生发展的关系。
材料与方法:3128名受试者被分为阴性对照组(NeC)、自发清除组(SC)、慢性乙型肝炎组(CHB)、肝硬化组(LC)和肝细胞癌组(HCC) 5组,CHB、LC和HCC构成HLD。我们进行了3项病例对照研究:NeC(840例)vs HLD(1792例),SC(486例)vs HLD(1792例),CHB+LC(1371例)vs HCC(421例)。利用Sequenom MassArray对MLH1、MLH3、MSH5、PMS1和PMS2的11个多态性位点进行基因分型。SNPStats进行Hardy-Weinberg平衡试验。连锁不平衡模式使用Haploview4.2进行可视化。采用GMDR (v0.9)进行广义多因素降维分析。通过SPSS21.0软件进行相关分析、乘性相互作用分析和加性相互作用分析。矩阵和编程excel也参与了加性相互作用的计算。
结果:NeC组与HLD组中,MSH5-rs1150793(G)是HBV易感性的危险基础(名义P=0.002, OR=1.346)。我们发现MLH1-rs1540354(AA+AT)和PMS1-rs1233255(AA)之间存在乘法相互作用(名义P=0.024, OR=1.240)。PMS1-rs1233255(AA)和PMS1-rs256554(CA+CC)之间存在加性互作。SC组与HLD组MLH1-rs1540354(TT)为危险基因型(名义P<0.05, OR>1)。通过单倍型分析,我们在MLH1中发现了3个位点的LD。GMDR结果显示了HBV自发清除的最优五基因座模型。在CHB+LC组与HCC组中,PMS2-rs12112229(A)与肝脏癌变相关。
结论:我们发现rs1150793(G)、rs1540354(T)和rs12112229(A)分别与HBV易感性、HBV自发清除和感染后癌变显著相关。
关键词:HBV, MMR, snps,单倍型,相互作用
收到:2022年10月22日;接受:2023年1月13日。
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*通信:
张晓林博士,河北医科大学公共卫生学院,河北石家庄050017
Mx。河北医科大学公共卫生学院,河北石家庄050017