乌干达鸡遗传资源:一、表型和生产特点gydF4y2Ba
Illyass所gydF4y2Ba
1gydF4y2Ba*,gydF4y2Ba
唐纳德Rugira KugonzagydF4y2Ba
1gydF4y2Ba,gydF4y2Ba
马里恩威尔弗雷德OkotgydF4y2Ba
2gydF4y2Ba,gydF4y2Ba
和平奥利弗AmugegydF4y2Ba
3gydF4y2Ba,gydF4y2Ba
罗莎·科斯塔gydF4y2Ba
4gydF4y2Ba和gydF4y2Ba
Filomena Dos AnjosgydF4y2Ba
5gydF4y2Ba
- 1gydF4y2Ba农业和环境科学学院坎帕拉乌干达Makerere大学gydF4y2Ba
- 2gydF4y2Ba农业和环境的教员,古卢大学古卢,乌干达gydF4y2Ba
- 3gydF4y2Ba乌干达首都坎帕拉乌干达妇女网络gydF4y2Ba
- 4gydF4y2BaKyeema基金会,莫桑比克马普托gydF4y2Ba
- 5gydF4y2Ba爱德华多Mondlane大学兽医学院,莫桑比克马普托gydF4y2Ba
多样性的程度在乌干达的土著鸡品种是育种项目评估的潜在的利用率。共有293个村庄indigenous-chicken-keeping家庭在35区四个区域形成12个次区域的随机抽样586成熟男女的鸡。只有20.8%的家庭是由女性,40.6%的土著鸡饲养员是女性。生产目标主要集中在鸡的销售收入和家庭的食物来源。鸡主要是托管在一个清除(94.2%)喂养系统主要(96.9%)混合农畜系统。鸡群的平均尺寸为19.80±1.21,3.83±0.29蛋鸡,每个生产平均13.41±0.20鸡蛋/离合器和40.3±0.6鸡蛋/年5.20±0.03月鸡蛋生产时代。Normal-feather菌株成为主流(> 90%),与分散发生率赤裸裸的脖子,卷曲,polydactyl, ptilopody两性的特质。黑色(49.0%母鸡;母鸡公鸡43.8%)和白人(38.3%;42.4%旋塞)的皮肤颜色最常见的是在鸡相比,黄色的皮肤。 However, yellow-coloured shanks were proportionally the most observed (41% cock; 29% hen). Orange and brown iris (eye) colours were the most common in both sexes. The hens commonly had small round earlobes with varying colours, while cocks had large oval-shaped, mainly red (70%) earlobes. The single-comb type was dominant in both sexes, with wattles almost universally present. Frizzle and polydactyl allele frequencies were significantly lower (p
介绍gydF4y2Ba
国内自由放养的/清除本地鸡维持小农自给自足的经济体的数以百万计的人们的生计(gydF4y2Ba2018年粮农组织、gydF4y2Ba)。他们最重要的畜牧物种之间,构成最受欢迎的驯养动物的肉在乌干达提供常规来源(65000吨)和鸡蛋的一大部分人口(gydF4y2Ba2019年粮农组织、gydF4y2Ba)。超过85%的国家乌干达主要地方品种鸡群人口(gydF4y2Ba2019年粮农组织、gydF4y2Ba;gydF4y2BaNEMA 2019gydF4y2Ba),传统上由小农后院家禽下农民自由放养的系统(gydF4y2BaMAAIF & UBOS, 2009gydF4y2Ba;gydF4y2BaVernooij et al ., 2018gydF4y2Ba;gydF4y2Ba粮农组织、2019 bgydF4y2Ba;gydF4y2BaMAAIF 2019gydF4y2Ba)。加上牛肉、鸡肉已经针对2015/16-2019/20乌干达农业部门的战略计划,优先发展商品(gydF4y2Ba粮农组织、2018 bgydF4y2Ba)。热带生产环境挑战,大多数农民提高国内本土没有最小输入条件下鸡。弹性选择压力,因此,让鸡仍主要在许多村庄,与广泛的表型变化(gydF4y2BaDessie et al ., 2011gydF4y2Ba;gydF4y2Ba粮农组织2015gydF4y2Ba;gydF4y2BaMpenda et al ., 2018gydF4y2Ba;gydF4y2Ba粮农组织2010gydF4y2Ba)。这表明一个巨大的遗传多样性要求全面的描述,总结,和监控不同区域农业生态的可持续利用和保护的现行生产系统。此外,随着气候变化的影响已经开始对非洲更强烈和频繁的气候压力预计将增加,尤其是在东非,到2050年(gydF4y2BaWaithaka et al ., 2013gydF4y2Ba;gydF4y2BaGirvetz et al ., 2019gydF4y2Ba)。减少的速度自适应措施制定将确保我们可以在该地区应对气候变化,特别是在异国品种的正在进行的基因渗入到土著居民改善他们的表现。这些基因渗入的例子包括农业和动物生产Serere研究所(群)外来鸡杂交项目(gydF4y2BaSsewannyana et al ., 2019gydF4y2Ba),国家动物遗传资源中心和数据银行(NAGRC & DB) Kuroiler杂交项目(gydF4y2Ba2017年美国国际开发署gydF4y2Ba),gydF4y2BaRakaigydF4y2Ba(区)地方鸡改进Bovans白雄(gydF4y2BaRoothaert et al ., 2011gydF4y2Ba),以及gydF4y2BaNamasagaligydF4y2Ba(当地的母鸡Namasagali Kamuli区镇东部乌干达)和Kuroiler雄亲杂交项目由国家畜牧业资源研究所(NaLIRRI) -Gulu-Makerere大学(gydF4y2BaKayitesi 2015gydF4y2Ba;gydF4y2BaRUFORUM 2016gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
因此,定义之间的基因属性土著鸡遗传资源和确定他们的多样性是很有用的一个有效的国家育种计划。这将包括一个系统识别、库存、生产环境的监控,和描述设置入口点这些动物遗传资源的可持续利用和保护(动物遗传资源)(gydF4y2Ba粮农组织2012gydF4y2Ba;gydF4y2BaAU-IBAR 2019gydF4y2Ba)。因此,我们的研究旨在评估生产特点、表型多样性,发生,和性能的大鸡鸡的基因型/株土著人口乌干达传统饲养条件下。我们的研究结果将提供初步的地理范围信息的表型特征土著鸡在乌干达和描述他们的生产系统中,因此,设定一个基础广泛的遗传多样性研究识别有价值的鸡遗传资源的选择和改进育种项目,以减轻气候变化不可避免的。gydF4y2Ba
材料和方法gydF4y2Ba
研究区域和研究期间gydF4y2Ba
这项研究中,覆盖293 indigenous-chicken-keeping家园35区四个区域集群,形成12个次区域的跨越不同农业生产/生态区域(AEZs)乌干达(gydF4y2Ba图1gydF4y2Ba和gydF4y2Ba补充表S1gydF4y2Ba),是2020年1月至3月进行的。全球定位系统(GPS)的研究地图位置在乌干达可用谷歌地图(gydF4y2Ba在这里gydF4y2Ba)。乌干达是内陆国家,刚果民主共和国接壤(博士)、肯尼亚、卢旺达、南苏丹、坦桑尼亚。边境的湖岸,位于横跨赤道(纬度之间4gydF4y2Ba°gydF4y2Ba北和1gydF4y2Ba°gydF4y2Ba南部和经度30gydF4y2Ba°gydF4y2Ba东和35gydF4y2Ba°gydF4y2Ba东)。调查地区的海拔范围从614到2261,平均高于平均海平面1184米。乌干达的总面积达到241550公里gydF4y2Ba2gydF4y2Ba其中约197065 .91点公里gydF4y2Ba2gydF4y2Ba土地面积7620点公里吗gydF4y2Ba2gydF4y2Ba沼泽和内陆水质量。虽然一般赤道,气候并不统一,因为高度修改气候条件和植被类型。因此,10 AEZ存在,由相似的生态环境和社会经济特点,农业系统和实践(gydF4y2BaMAAIF 2010gydF4y2Ba)。一个独特的AEZ常见的作物和牲畜类型而区域跨越地区(gydF4y2BaKraybill Kidoido, 2009gydF4y2Ba)。AEZs的描述所示gydF4y2Ba补充表S2gydF4y2Ba。东北旱地AEZ排除在这项研究中,因为区域游牧牧民居住的半干旱带人从牛保持和获得他们的生计所以很难保持鸡。此外,次区域(卡拉莫贾地区)是由于偷牛容易缺乏安全感。gydF4y2Ba
图1gydF4y2Ba。研究地图的位置在乌干达土著鸡。293随机选择的样本分布家庭从村庄(> 5公里)从电网获取细胞约。50公里gydF4y2Ba2gydF4y2Ba在乌干达的AEZs确保景观数据的收集。gydF4y2Ba
研究设计和数据收集gydF4y2Ba
鸡是采样主要来自农村家庭基于网格细胞50公里gydF4y2Ba2gydF4y2Ba在乌干达景观图(gydF4y2Ba图1gydF4y2Ba)。宽景观抽样保证不同agro-climates,通过自适应散度对遗传多样性的影响。基因,抽样多样化人口最大化通过随机选择至少三个村庄隔开至少5公里grid-cell-identified地区。然后,借助地方兽医官员(DVOs),侦察调查进行了样本一个土著养鸡家庭研究从每个村庄。数据共有293户农户与生产历史和羊群配置文件是通过访谈(他们理解的语言)使用非洲Union-InterAfrican动物资源局(AU-IBAR)统一标准的问卷,在AnGR-CIM工具ENFR v2.1(部署在ODK收集v1.29.5 Android设备申请)。动物遗传资源指南后表型描述(gydF4y2Ba粮农组织2012gydF4y2Ba),两个成熟无关的鸡(一只母鸡和公鸡)被用于每个农户的表型研究,总计586(299只母鸡:287旋塞)鸟类在网站。绘画领域指南(gydF4y2BaAU-IBAR, 2015gydF4y2Ba)辅助定性表型特征的描述关于体况评分,身体颜色(皮肤、柄、眼睛、耳垂和喙);羽毛,羽毛特性(羽毛结构、羽毛分布和身体羽毛模式);头特性(耳垂大小、耳垂形状、梳型、金合欢、和波峰和喙形状);和骨骼方差(体型/构象、框架、刺激大小和尾巴长度)。身体的重量(克)使用一个标准的电子体重秤测量(WH-A08;清廉公斤)的线性三围住鸡(gydF4y2Ba图2gydF4y2Ba)被使用裁缝卷尺。每个样本的GPS定位宅基地和数码照片研究鸡被抓获的集成AnGR-Photo工具(ENFR v2.1)。鸡的年龄从农民的记录或估计(记录用时)召回的所有者或视觉评价来判断动物遗传资源指南表型描述(gydF4y2Ba粮农组织2012gydF4y2Ba)和描述gydF4y2BaBirteeb et al。(2016)gydF4y2Ba。的身体条件最成熟的公鸡和母鸡得分憔悴,瘦,好,或脂肪,在1、2、3和4分别。gydF4y2Ba
图2gydF4y2Ba。线性测量(cm)的土著鸡在乌干达,所描述的gydF4y2BaAU-IBAR (2015 b)gydF4y2Ba。gydF4y2Ba
估计的有效种群大小(Ne)随机交配土著家庭羊群在每个地区的鸡的数量及其相应的近亲繁殖率(∆F)所描述的被处死gydF4y2Ba驯鹰人,麦基(1989)gydF4y2Ba使用方程:gydF4y2Ba
有效的人口;gydF4y2Ba
近亲繁殖率;gydF4y2Ba
其中NgydF4y2BaegydF4y2Ba是实际的净人口规模,NgydF4y2Ba米gydF4y2Ba是繁殖旋塞在羊群的数量,NgydF4y2BafgydF4y2Ba的种鸡群的数量,和ΔF是每一代近亲繁殖的速度。gydF4y2Ba
记录土著鸡菌株显示等主要特征的基因型自适应值已知的基因的等位基因爆花(F / F), ptilopody (Pti / Pti),植绒的波峰(Cr / Cr),玫瑰梳(R / R)和Polydactyl (P / P)被用来估计其等位基因频率。表型数量计算的比例为:gydF4y2Ba
卡方拟合优度分析观察到的鸡品种的比例与预期的孟德尔比例(分别为25%和75%,发病率和缺失基因型)进行使用gydF4y2Bachisq.testgydF4y2Ba方法在R软件。等位基因频率的估计使用哈迪温伯格原则(gydF4y2Ba驯鹰人麦凯,1989gydF4y2Ba)是基于以下模型:gydF4y2Ba
q是隐性等位基因的频率,m是土著鸡表达隐性表型的观察值考虑,t是鸡采样的总数,p是鸡不表达的显性等位基因频率显示的主要特征。gydF4y2Ba
统计分析gydF4y2Ba
与样品的位置(地理区域)和鸡肉性类别安装固定的独立变量,因变量受到descriptive-analytical程序在IBM SPSS统计为Windows, 20.0.0.0版本。肯德尔和谐系数gydF4y2BaWgydF4y2Ba测试用于测试和等级之间的协议农民对他们的评价家庭鸡生产目标在5%的显著性水平。方差分析(方差分析)进行了使用IBM SPSS统计的一般线性模型窗口,20.0.0.0版本。的最小二乘方法显著差异比较使用矫正人员的调整占每类别样本大小不均。的模型的形态学特征(身体重量和线性身体测量),排除相互影响,因为他们非重要,把形式:gydF4y2Ba
结果gydF4y2Ba
人口统计资料的土著chicken-rearing家庭在乌干达gydF4y2Ba
原住民的人口分析养鸡家庭在乌干达,呈现gydF4y2Ba表1gydF4y2Ba显示,相对类似比例的男性和女性被农民(gydF4y2Bap >gydF4y2Ba0.05)在整个地区。而男性受访者普遍走高(gydF4y2BapgydF4y2Ba< 0.001)北部(64.9%)、西方(56.0%),和东部乌干达(66.3%),乌干达中部的情况则正好相反,女性受访者(55.1%)观察到的地方。反应主要是(gydF4y2BapgydF4y2Ba< 001)从家庭获得正面(60.1%),其次是配偶的家庭(28.0%),只有少数来自其他家庭成员在类似的(gydF4y2Bap >gydF4y2Ba0.05)比例在整个地区。大多数家庭(gydF4y2Bap
表1gydF4y2Ba。在乌干达人口分析土著鸡的农民。gydF4y2Ba
群描述、所有权和生产目标的土著鸡在乌干达gydF4y2Ba
鸡的数量和比例不同的年龄和性别分类的结构在一群描述羊群。中给出的结果gydF4y2Ba表2gydF4y2Ba和gydF4y2Ba补充图S1A-DgydF4y2Ba显示所有家庭保持本土鸡不同群的组成和所有权的特征。羊群的构成变化(gydF4y2BapgydF4y2Ba< 0.01)地区和最低的羊群数量每类别在乌干达中部和西部同时观察在乌干达北部和东部最高。总体平均19.80±1.21鸡在indigenous-chicken-keeping家庭举行。类似地,每个鸡群大小类别显著不同(gydF4y2Bap
表2gydF4y2Ba。在乌干达土著鸡群组成的家庭。gydF4y2Ba
鸡群退出显示不同形式在本土肉鸡生产家庭在乌干达。虽然大多数家庭允许公鸡在羊群停留1年(41%)或更长时间(44%),只有15%的家庭让他们的公鸡了几个月(gydF4y2Ba补充图S4gydF4y2Ba)。三分之一(29%)的农民交换他们的鸡收购其他牲畜物种(gydF4y2Ba补充图S5gydF4y2Ba),通常(25.0%)山羊也偶尔猪(1.4%)、鸡具有独特的特征(1.45%)、牛羊(1.0%)(0.3%)。gydF4y2Ba
土著家庭中鸡的生产目标在乌干达明显(gydF4y2Bap
表3gydF4y2Ba。原因/目的让鸡。gydF4y2Ba
土著鸡生产/管理系统和他们的性能在乌干达gydF4y2Ba
饲料资源,管理实践喂食喂水gydF4y2Ba
生产系统和饲养管理实行类似的跨区域(gydF4y2BapgydF4y2Ba> 0.05)。混合农畜系统,农民保持一些畜牧业与种植业,是主要的(96.9%)在大多数农户农业生产系统(gydF4y2Ba表4gydF4y2Ba)。然而,agro-pastoral系统(1.8%)相结合的农业作物和牲畜生产的田园和只禽类物种清除管理(1.3%)形成孤立的情况下生产系统的家庭在北部,中部和西部地区。整个区域,清除(自由放养的)饲养管理主要是在大多数indigenous-chicken-keeping家庭(94.2%)练习,不论季节,紧随其后的是限制性scavenge-feeding(1.3%),在羊群只有剩菜,麸或谷物有限区域内;或scavenging-supplementation(2.2%),群提供补充饲料为他们清除饲料和家园附近(gydF4y2Ba补充图S6gydF4y2Ba)。几乎没有制定饲料(0.4%)平衡提供了所有必需的营养的鸡在大多数家庭除了一种情况分别来自北部,西部和东部地区。gydF4y2Ba
表4gydF4y2Ba。在乌干达土著鸡生产和管理实践。gydF4y2Ba
三大饲料资源可用于鸡群在农舍附近的牧场(31.6%)或鸡饲料,其次是农业副产品如谷物从啤酒厂,残留物和麸谷物磨坊(28.0%),和厨房垃圾/剩菜(27.8%)。只有一小部分的家庭(11.7%)提供粮食集中补充他们的羊群scavengeable饲料资源,在罕见的情况下的家庭(1.0%)提供生产或制定营养全价配合饲料鸡。西部地区在大多数家庭(57.1%)和很多在中部地区(49.0%),鸡不提供水喝;相反,搜查鸡或者走到水源在清除范围。然而,大多数家庭在北方(88.4%)(93.2%)和东部地区提供饮用水的羊群。扫群的半径内的水源是好的在大多数(75.1%)的家庭除了在乌干达中部和西部的三分之一,水源的泥泞。gydF4y2Ba
住房系统的本地鸡在乌干达gydF4y2Ba
大多数家庭鸡提供了某种形式的住房庇护老少鸟(gydF4y2Bap >gydF4y2Ba0.05)。主要在家庭住所对面的住房建造的主屋(43.9%年轻;成人的46.9%)和棚屋(43.4%年轻;37.2%的成年人)家园。其他一些家庭庇护他们的鸡在人类住所(10.2%,年轻人和成年人)),园外栖息/厨房/树(2.0%年轻;4.6%的成年人),摊位(0.5%年轻;1%的成年人)(gydF4y2Ba补充数据S7A S8gydF4y2Ba)。房屋结构的地区差异观察鸡(gydF4y2BapgydF4y2Ba< 0.001)。棚屋是更受欢迎的北部和东部地区在避难所建在主屋的主导中西部地区(gydF4y2Ba补充图S7B S8gydF4y2Ba)。然而,在人类居住的家庭保持鸡的比例单位跨地区相似。gydF4y2Ba
鸡医疗服务和疾病控制gydF4y2Ba
疾病的发病率和治疗动力学明显不同的鸡群(gydF4y2Bap
家禽健康服务提供给鸡不同(gydF4y2BapgydF4y2Ba跨地区< 0.001),治疗治疗最常见(49.5%),其次是疫苗接种(45.3%)在北部高(48.5%)(36.2%)和东部地区(gydF4y2Ba补充表S3gydF4y2Ba和gydF4y2Ba补充图S9AgydF4y2Ba)。Antihelminthic驱虫药和皮肤控制最低,分别为6.3%和1.0%。大多数农民(87%)依靠ethnoveterinary混合物来治疗病态鸡相比,少数(13%)使用传统药物(gydF4y2BapgydF4y2Ba< 0.001)。主要ethno-materials中有植物叶(68%),茎、种子、水果,叫,和木灰也有时用(gydF4y2Ba补充图S9BgydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
农民显示显著(gydF4y2Bap
图3gydF4y2Ba。患病率在乌干达的土著鸡所描述的家庭。W =肯德尔和谐系数。xgydF4y2Ba2gydF4y2Ba=卡方。gydF4y2Ba* *gydF4y2BapgydF4y2Ba< 0.001。gydF4y2Ba
大多数(38.4%)的农民医疗服务管理羊群自己或通过邻居没有任何专业建议,而22.0%寻求专业建议(gydF4y2Ba补充图S10gydF4y2Ba)。农民接触动物健康服务提供商和政府兽医分别是17.3%和17.0%,4.3%访问处理从兽医供应商店在他们的社区。访问社区接种只有少数(0.9%)土著鸡的农民。gydF4y2Ba
鸡和血统信息识别gydF4y2Ba
关于鸡识别和背景信息,95%的indigenous-chicken-keeping农民几乎没有任何形式的书面记录在他们的生产(gydF4y2Ba补充图S11gydF4y2Ba)。尽管如此,90%的人声称他们可以认识到自己单独鸡,尽管计划大纲的命名或识别他们的鸡群中个别成员是不存在的在大多数(95%)的家庭。gydF4y2Ba
生产性能和销售本地鸡群在乌干达gydF4y2Ba
表5gydF4y2Ba表明,大多数家庭(87.8%)通常平均3.83±0.29蛋鸡群;然而,跨地区的家庭(这个数的分布存在显著差异gydF4y2Bap
表5gydF4y2Ba。在乌干达土著鸡鸡蛋生产和销售。gydF4y2Ba
大部分(80.2%)的农民在整个地区(gydF4y2Bap
成熟的鸡身体重量(gydF4y2Ba图4gydF4y2Ba两性之间)的市场不同,公鸡重(gydF4y2Bap
图4gydF4y2Ba。成熟的体重(均值和SE)的土著鸡在乌干达。gydF4y2Baa、bgydF4y2Ba在within-factor意味着酒吧显著差异(gydF4y2BapgydF4y2Ba< 0.05)。xgydF4y2Ba2gydF4y2Ba=卡方。gydF4y2Ba
土著鸡在乌干达的表型特征gydF4y2Ba
共有586个自主繁殖鸡表型相似的描述研究采样(gydF4y2Bap >gydF4y2Ba与整体可比性(0.05)性类别,gydF4y2Bap >gydF4y2Ba0.05)地区的比例(gydF4y2Ba补充表S1gydF4y2Ba和gydF4y2Ba图1gydF4y2Ba)。大多数家庭饲养鸡的羊群,采集标本通常是在良好的身体条件与适度发达凹乳房肌肉和不太突出龙骨(gydF4y2Bap >gydF4y2Ba0.05)在家庭。gydF4y2Ba
羽毛的形态、分布和羽毛的模式gydF4y2Ba
鸡的羽毛结构和分布明显不同(gydF4y2Bap
图5gydF4y2Ba。羽毛鸡土著人口分布和结构在乌干达。gydF4y2Ba(Al A2)gydF4y2Ba正常的羽毛分布。gydF4y2Ba(提单、B2)gydF4y2BaNaked-neck。gydF4y2Ba(Cl C2)gydF4y2BaPtilopody(羽毛小腿/睑板)。gydF4y2Ba(Dl D2)gydF4y2Ba卷发羽毛结构。gydF4y2Ba(E)gydF4y2Ba羽毛光滑/整洁的飞机。gydF4y2Ba(F)gydF4y2Ba丝和gydF4y2Ba(G)gydF4y2Ba表面上柔滑的羽毛结构。gydF4y2Ba
多样化的显示的鸡羽毛模式(gydF4y2Ba补充表S4gydF4y2Ba和gydF4y2Ba补充图S12gydF4y2Ba)男女双方在地区(gydF4y2Bap
身体的颜色在乌干达土著鸡gydF4y2Ba
鸡的皮肤颜色不同(gydF4y2Bap
图6gydF4y2Ba。柄(大数)的颜色。gydF4y2Ba(一)gydF4y2Ba白色的。gydF4y2Ba(B)gydF4y2Ba灰色/蓝。gydF4y2Ba(C)gydF4y2Ba黑色/深灰色。gydF4y2Ba(D)gydF4y2Ba黄色的。gydF4y2Ba(E)gydF4y2Ba橙色。gydF4y2Ba(F)gydF4y2Ba棕色的。gydF4y2Ba(G)gydF4y2Ba绿色的。gydF4y2Ba(H)gydF4y2Ba粉红色的。gydF4y2Ba
的位置和性别影响鸡的发病率耳垂和鸡喙的颜色数量(gydF4y2Bap
在乌干达土著鸡的头部特征gydF4y2Ba
所有的描述性特性(gydF4y2Ba表6gydF4y2Ba和gydF4y2Ba补充图S15gydF4y2Ba)明显(gydF4y2Bap
表6gydF4y2Ba。本土的描述性的头部特征的变化在乌干达的鸡。gydF4y2Ba
土著鸡骨架之间的方差的乌干达gydF4y2Ba
骨鸡人口方差(gydF4y2Ba补充表S6gydF4y2Ba)是显著相关的区域(gydF4y2Bap
图7gydF4y2Ba。骨骼方差。gydF4y2Ba(一)gydF4y2Ba无尾的。gydF4y2Ba(B)gydF4y2Ba矮。gydF4y2Ba(C)gydF4y2BaPolydactyl。gydF4y2Ba(D)gydF4y2Ba正常的骨骼结构。gydF4y2Ba
等位基因和表型频率的土著菌株在乌干达鸡gydF4y2Ba
土著鸡菌株的分布和等位基因频率分别为0.13,0.20,0.29,0.14,0.17,卷曲,ptilopody,簇绒波峰,polydactyl和玫瑰梳鸡(gydF4y2Ba表7gydF4y2Ba)。一般来说,鸡的出现表现出的基因型特征主要特征相对较低。然而,簇绒,这是最常见的(50;8.53%)基因型、等位基因频率为0.29,这是统计(gydF4y2Bap >gydF4y2Ba0.05)类似于预期的孟德尔比例为0.25。同样,ptilopody和玫瑰梳有类似的等位基因频率(gydF4y2Bap >gydF4y2Ba0.25 0.05)估计的孟德尔比例。然而,爆花polydactyl等位基因频率,分别为0.13和0.14;显著降低(gydF4y2Bap
表7gydF4y2Ba。发生的罕见的主要基因型和等位基因频率土著人口鸡。gydF4y2Ba
的形态学特征的主要品种(基因型)在乌干达土著鸡gydF4y2Ba
体重和线性测量周长的胸腔和小腿;大腿的长度、铁芯、梳子和金合欢树;和梳子身高没有显著(gydF4y2Bap >gydF4y2Ba0.05)与基因型(菌株主要等位基因)在性(gydF4y2Ba表8gydF4y2Ba)。然而,光脖子的公鸡明显(gydF4y2Bap
表8gydF4y2Ba。最小二乘方法(LSM±东南部)的菌株的形态学测量的土著人口在乌干达鸡。gydF4y2Ba
在乌干达土著鸡菌株的形态学特征之间的相关性gydF4y2Ba
之间的皮尔逊相关性土著鸡菌株的形态学特征在乌干达公鸡和母鸡所示gydF4y2Ba补充表S7gydF4y2Ba。相关系数通常不同于零(gydF4y2BapgydF4y2Ba< 0.05),除了梳子高度(CH)和柄周长(SC)、CH和柄长度(SL),梳子长度(CL)和SL,西城和TL母鸡。所有对的形态学测量的相关系数在公鸡比母鸡更强,只有LW TC和CH TC可比。gydF4y2Ba
讨论gydF4y2Ba
本研究试图执行广泛的、全面的全国调查描述土著鸡鸡的生产动态和表型和形态分化在乌干达的风景。如此大规模描述报告是稀缺的,因此本研究最重要的在这个国家。这些结果表明,羊群描述、生产动态,性能,和表型特征的土著鸡类似报道在欧洲大陆其他地方(gydF4y2BaNjenga 2005gydF4y2Ba;gydF4y2BaAdomako 2009gydF4y2Ba;gydF4y2Ba丹娜,2011gydF4y2Ba;gydF4y2BaDessie et al ., 2011gydF4y2Ba;gydF4y2BaMarwa et al ., 2016gydF4y2Ba;gydF4y2BaMahoro et al ., 2017gydF4y2Ba;gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba;gydF4y2BaOtecko et al ., 2019gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
人口统计资料的土著chicken-rearing家庭在乌干达gydF4y2Ba
的描述人口的土著家庭养鸡是决定家庭社会经济特征的关键,这是必要的持续改进项目的实施。在研究家庭在乌干达,更高比例的男性观察鸡的农民,除了中央区域,显示更高数量的女鸡饲养员。对于这样一个社会更可能是由一个男人,让女人在鸡饲养支持赞同的认为声称家庭养鸡有时是唯一的畜牧物种的控制下女性(gydF4y2BaKyarisiima et al ., 2004gydF4y2Ba;gydF4y2Ba丹娜,2011gydF4y2Ba;gydF4y2BaMahoro et al ., 2017gydF4y2Ba)。传统性别角色的设置在乌干达北部和能力控制家庭收入鸡生产,特别是女性户主家庭,影响妇女参与鸡价值链(gydF4y2BaAkite et al ., 2018gydF4y2Ba)。的反应这一研究获得的主要是成年人(≥22岁)人家庭,配偶或其他家庭成员。因此,他们被认为可靠推断在乌干达土著鸡的生产特点。此外,年龄31 - 60年的大多数农民在乌干达与早期的发现是一致的(gydF4y2BaKugonza et al ., 2008gydF4y2Ba;gydF4y2BaKayitesi 2015gydF4y2Ba邻国卢旺达)和本地鸡管理员(gydF4y2BaMahoro et al ., 2017gydF4y2Ba;gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba)。类似的平均距离一个农民的宅基地全天候公路(33.3公里)和市场(5.6公里)的地区表示代表样本的使用,包括那些来自穷乡僻壤。这进一步确保抽样相关的鸡是可以避免的。7.6的普通中等农业家庭大小观察整个地区家庭高于农村居民的平均五(gydF4y2BaUBOS 2021gydF4y2Ba)。家庭生计主要来自出售作物和牲畜和牲畜产品。一些家庭牲畜和牲畜产品交易,参与非农活动。大约330万户家庭在乌干达生活在仅能维持生存的经济,这是定义为包括62%口中家庭从事农业主要用于家庭消费和销售/易货根据gydF4y2BaUBOS (2021)gydF4y2Ba。这强调家庭畜牧业和土著的角色的重要性低投入下鸡养殖管理在乌干达人民的生计。gydF4y2Ba
在乌干达所有权和家庭鸡群描述gydF4y2Ba
羊群规模平均19.80±1.21鸡跨地区本研究在乌干达东部与早期的发现是一致的(gydF4y2BaKugonza et al ., 2008gydF4y2Ba),还有不断增加的趋势,小群。低数量的公鸡母鸡羊群但更高的数字,种植者,小鸡也与先前的报告相一致(gydF4y2BaKyarisiima et al ., 2004gydF4y2Ba;gydF4y2BaSsewannyana et al ., 2008gydF4y2Ba;gydF4y2BaNakkazi et al ., 2014gydF4y2Ba)。群的大小由女性小(1 - 10只鸡)的男性相比。事实正好相反,53.6%的男性保持16到20只鸡。非洲牲畜期货(gydF4y2Ba埃雷罗et al ., 2014gydF4y2Ba)描述女性的小大小的鸡群中作为一种特殊的政策问题通常来自他们的低流动性由于国内工作。因此,女性只能管理小羊群连同他们的家务。因此,女性更有可能失去公共补贴等政策寻求缓解大规模企业,可以提高他们的市场和相应的收入。他们那些什么好处等小农动物卫生服务,当缺医少药也导致不成比例的损失。因此,女性通常不能够发展他们的羊群的大小。成熟的公鸡,紧随其后的是成熟的母鸡或者其他鸡类通常是第一个退出群。大多数农民通常保持旋塞,或1年多前出售。鸡的交换收购其他牲畜物种符合收购牛羊的报告通过易货交易或使用现金收益鸡生产(gydF4y2BaIisa 2003gydF4y2Ba;gydF4y2BaKugonza et al ., 2008gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
土著鸡在乌干达农民共享类似的生产目标。销售收入的生成和鸡肉和鸡蛋的消费被认为是最重要的,与先前的报道在乌干达一致(gydF4y2BaKugonza et al ., 2008gydF4y2Ba;gydF4y2BaNatukunda et al ., 2011gydF4y2Ba)。小生产目标开门的好处来自副产品包括鸡粪便作为有机肥,社会经济/声望和文化遗产,给游客,和/或易货交易获得其他牲畜种类和休闲的目的。gydF4y2Ba
土著鸡生产、管理系统和性能在乌干达gydF4y2Ba
混合农畜系统属于畜牧生产系统的广泛的分类之一,在非洲,主要是降雨和较高的地区作物生产潜力(gydF4y2BaAU-IBAR 2019gydF4y2Ba)。这就能解释在乌干达混合农畜业的优势,此前报道(gydF4y2BaKugonza 2008gydF4y2Ba)。清除饲养管理在本土养鸡家庭在乌干达,只有少数家庭提供补充,在乌干达与先前的报告是一致的(gydF4y2BaKugonza et al ., 2008gydF4y2Ba;gydF4y2BaNatukunda et al ., 2011gydF4y2Ba;gydF4y2BaMAAIF 2019gydF4y2Ba)和发现其他地方(gydF4y2BaMoreda et al ., 2013gydF4y2Ba;gydF4y2BaMahoro et al ., 2017gydF4y2Ba;gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba)。清除鸡生产中很受欢迎,在大多数发展中国家农村社区提供基建样板获得生计(gydF4y2BaMelesse 2014gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
可用的饲料资源自主鸡主要是牧场,从他们的草地上觅食,种子,郁郁葱葱的树叶,和其他附近的植物资源和家园。其他回收厨房垃圾或agro-by-products饲料资源,粮食集中。gydF4y2BaSsewannyana et al。(2008)gydF4y2Ba发现土著鸡在乌干达估值的能力清除。控制交配正是清除饲喂系统,限制了当地的生产鸡由于近亲繁殖。集中美联储土著鸡比保持在半觅食的条件下执行(gydF4y2BaMagala et al ., 2012gydF4y2Ba;gydF4y2BaNakkazi et al ., 2015gydF4y2Ba)。有趣的是,水并不是有意识地提供给鸡。因此,鸡必须寻找水和家园周围附近的清除,因为大多数家庭有很好的清除半径内的清水资源群。gydF4y2Ba
住房对于成年人和年轻的鸡从主要定制不同围场构造的主屋,棚屋和人类居住单位不太常见的避难所像地上栖息/厨房和摊位(gydF4y2Ba补充图S7-S9gydF4y2Ba)。类似的情况发生在卢旺达,大多数农民房子羊群在附件(gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba)。偶尔的观察鸡群坐落在人类居住的单位和摊位在一些家庭的报道是一致的鸡没有提供具体的住房在乌干达(gydF4y2BaKyarisiima et al ., 2004gydF4y2Ba;gydF4y2BaNatukunda et al ., 2011gydF4y2Ba)。像在许多非洲国家,住房是专门为本地鸡捏造或鸡寻求庇护下的自然环境的净化管理(gydF4y2Ba粮农组织2008gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
目前研究的结果通常显示不同的疾病发作挑战本土地区鸡群。大多数人偶尔疾病挑战随机发生,每年/季节性发作。羊群在疾病发作是罕见的,尤其是在乌干达西部,可能是由于自适应生存的鸡agro-ecologic条件,影响疾病的发病率和严重程度。宿主基因也以不同的方式影响电阻(gydF4y2BaKhobondo et al ., 2015gydF4y2Ba;gydF4y2Ba理查森,2016gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba伯格霍夫别墅et al。(2019)gydF4y2Ba提出不同的免疫和抗病增长因为个体的差异。因此,鸡的体重偏差从西部地区可能赋予弹性涌在某种程度上。在乌干达大多数土著农民家庭治疗他们的病鸡,而只有四分之一离开他们的病鸡自行恢复或死亡没有任何治疗在疾病发作。与此同时,一小部分农民在羊群乌干达很少有疾病的情况下,他们用使用phyto-prophylactic相关补救措施。鸡新城疫,重大疾病挑战本土鸡养殖在乌干达在这项研究中,证实了乌干达(先前的报告gydF4y2BaKugonza et al ., 2008gydF4y2Ba;gydF4y2BaNatukunda et al ., 2011gydF4y2Ba),显著轻微的疾病,包括球虫病,和许多其他人。相反在乌干达,球虫病是最重要的疾病挑战卢旺达土著鸡生产,而纽卡斯尔疾病构成第三重大疾病(gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba)。医疗保健服务本土鸡主要是治疗治疗疾病发病率,而接种疫苗也管理。总共13.2%的鸡饲养员不提供任何医疗服务他们的羊群。除寄生虫和皮肤控制练习的情况并不常见。同样,医疗服务提供者的土著鸡生产是有限的,因为大多数农民采取自助有或没有专业建议。使用本地或草药治疗对鸡疾病已经被大多数的主要实践自主鸡的农民在乌干达(gydF4y2BaKyarisiima et al ., 2004gydF4y2Ba;gydF4y2BaNatukunda et al ., 2011gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
记录,与农场相关评估关键决策中大多数土著鸡的农民,是不存在的。识别的鸡,因此,主要是基于视觉线索如羽毛的颜色或模式和类型区分鸡群鸡。gydF4y2Ba
关于鸡的生产性能,大多数农民在乌干达平均3.83±0.29蛋鸡,这是高于估计西部地区。第一次产蛋的平均年龄为5.20±0.03个月介于5.1和7.0之间几个月,在报道范围内的20-21weeks母鸡下管理一个广泛的系统(gydF4y2Ba粮农组织2003gydF4y2Ba),在乌干达东部的报道(gydF4y2BaKugonza et al ., 2008gydF4y2Ba)。平均13.41±0.20鸡蛋/鸡/离合器生产,导致40.22±0.60鸡蛋/鸡/年。这些发现与之前报道的(gydF4y2BaMogesse 2007gydF4y2Ba;gydF4y2BaMahoro et al ., 2017gydF4y2Ba;gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba)。然而,估计每年低于50 - 60鸡蛋的报道范围10 - 12鸡蛋/离合器在家畜多样性信息系统(gydF4y2Badad - is, 2022gydF4y2Ba)。土著鸡,鸡蛋生产潜力评价gydF4y2BaPadhi (2016)gydF4y2Ba低两用品种或商业铺设鸡相比,本土的产生大约6倍鸡(gydF4y2BaFarooq et al ., 2002gydF4y2Ba)。低蛋在本土生产鸡与就巢性有关,其中包括孵化鸡蛋孵化胚胎,以及照顾他们的幼仔。这一时期伴随着频繁的嵌套,减少饲料和水的摄入量,增加体温,,最终,停止躺在满是血污的时期。然而,管理干预措施排除就巢性增加铺满是血污的母鸡的能力(gydF4y2BaKugonza et al ., 2008gydF4y2Ba;gydF4y2BaHossen 2010gydF4y2Ba;gydF4y2Ba江et al ., 2010gydF4y2Ba)。此外,鸡的平均成熟生活身体重量出售1.535±0.025公斤和2.256±0.026公斤母鸡和公鸡的范围内分别-2.86 1.03 -2.05公斤和1.25公斤报道母鸡和公鸡在乌干达gydF4y2BaKyarisiima et al ., 2004gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
在乌干达土著鸡的表型特征gydF4y2Ba
家畜繁殖特征的描述是必要的指导决策和战略发展和育种项目是有价值的(gydF4y2Ba粮农组织2007gydF4y2Ba)。良好的身体条件的一般观察大多数饲养鸡的家庭肯定了自主的能力鸡繁荣盛行的低投入的条件下(gydF4y2BaDessie et al ., 2011gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
在乌干达土著鸡的羽毛形态gydF4y2Ba
羽毛形态通常用于组鸡群体到群体由于它的重要性在进化生物学和经济学基础的农民。这个特质影响偏好特定类型的鸡,这整个家庭调查确定其重要性。大多数农民在乌干达一直鸡羽毛smooth-neat平面结构而卷曲,柔滑的,肤浅的羽毛的鸡不太常见。因此,大多数男女正常的土著鸡羽毛分布。特殊表型(株),包括裸体的脖子,feathered-shanks (ptilopody),和卷曲的鸡,出席低比例同样在两种性别中,确凿的报告normal-feathered鸡鸡的遗传资源的优势在卢旺达(gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba)、埃塞俄比亚(gydF4y2BaFistum 2016gydF4y2Ba)、加纳(gydF4y2Ba蒙沙,2016年gydF4y2Ba;gydF4y2Ba布朗et al ., 2017gydF4y2Ba)、尼日利亚(gydF4y2Ba雅库布,2010gydF4y2Ba),和阿尔及利亚(gydF4y2BaDahloum et al ., 2016gydF4y2Ba)。低比例的赤裸裸的脖子,feathered-shank (ptilopody)和卷曲特征,尽管他们有利的影响生产和热带适应(gydF4y2BaAdomako 2009gydF4y2Ba;gydF4y2Ba蒙沙,2016年gydF4y2Ba),与社会文化/宗教原因(gydF4y2BaNjenga 2005gydF4y2Ba;gydF4y2Ba比伊·德斯塔,2020gydF4y2Ba)。裸体的脖子和frizzle-feathered表型是消极的选择,因为他们不获取溢价市场价格以不良的审美价值(gydF4y2Ba雅库布,2010gydF4y2Ba;gydF4y2Ba比伊·德斯塔et al ., 2013gydF4y2Ba)。此外,坊间报告和个人与农民的互动研究中表明,这种鸡株通常为家庭消费和祭祀仪式,其他地方报道(gydF4y2BaNjenga 2005gydF4y2Ba;gydF4y2Ba比伊·德斯塔et al ., 2013gydF4y2Ba);因此,认为是迷信。此外,据报道卷曲基因在不利的环境条件不利其纯合状态,导致内脏器官异常(gydF4y2BaFathi et al ., 2013gydF4y2Ba),这表明他们非常低的频率。我们观察到整个地区高羽毛图案的变化。乌干达东部的大部分的母鸡没有羽毛的模式定义。然而,母鸡和模式可以被描述相似的频率,用铅笔写的(在西部和中部地区),和统一的白色的(北方地区)的模式,和黑色羽毛的颜色。公鸡经常显示一个鹧鸪模式,其次是桦木的模式,与其他未定义的模式。类似的观察是由gydF4y2BaSsewannyana et al。(2008)gydF4y2Ba他形容大多数土著鸡的羽毛在乌干达没有明确的模式。一些羽毛的低频模式,和颜色,也许是因为这种鸡的偏好专门为社会文化/宗教仪式实践(gydF4y2Ba比伊·德斯塔,2020gydF4y2Ba)和缺乏特定的消费者对特定的羽毛模式的需求,因此导致人口下降的遗传结构。而主要扇母鸡羽毛也许是由于农民理解多个羽毛颜色的伪装对空中捕食者(gydF4y2BaBesbes et al ., 2007gydF4y2Ba的一部分)和母鸡母性能力(gydF4y2BaKyarisiima et al ., 2004gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
身体的颜色在乌干达土著鸡gydF4y2Ba
深色皮肤的比例(棕紫色/黑色)和白皮肤的鸡是相似的,而黄色的皮肤颜色是观察到的皮肤表型中最低。这是微妙的与先前的报告(1%)黑肤色表型在乌干达土著鸡(gydF4y2BaSsewannyana et al ., 2008gydF4y2Ba)和黄皮肤的主导地位(69%)在卢旺达地方品种鸡(gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba),埃塞俄比亚鸡群(gydF4y2Ba比伊·德斯塔et al ., 2013gydF4y2Ba;gydF4y2BaNegassa et al ., 2014gydF4y2Ba)。肤色变化影响的组合影响黑色素的色素基因和修饰符和类胡萝卜素沉积在皮肤上,除了环境因素如饮食和生理状态(gydF4y2Ba金et al ., 2016gydF4y2Ba)。黑肤色与黑色素的色素沉着,由于缺乏伴性的真皮melanin-inhibiting突变(gydF4y2BaIdgydF4y2Ba)和一些羽毛colour-influencing基因扩展(gydF4y2BaEgydF4y2Ba)位点的等位基因。此外,fibromelanosis (gydF4y2Ba调频gydF4y2Ba)位点基因与皮肤黑色素gydF4y2BaidgydF4y2Ba+gydF4y2Ba导致皮肤和结缔组织(melanised颜料gydF4y2Ba雅各,2022gydF4y2Ba)。白肤色,然而,与常染色体显性白(gydF4y2BaWgydF4y2Ba)位点等位基因和并没有延展的黑色(gydF4y2BaegydF4y2Ba)等位基因的组合gydF4y2Ba调频gydF4y2Ba基因和gydF4y2BaIdgydF4y2Ba突变,导致没有可见的皮肤色(gydF4y2Ba金et al ., 2016gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
白色皮肤基因据说起源于红原鸡(被认为是古代祖先的家鸡),而从灰色原鸡黄皮肤基因(gydF4y2Ba埃里克森et al ., 2008gydF4y2Ba),这意味着双重的特征。隐性的黄色皮肤(gydF4y2BawgydF4y2Ba)等位基因与类胡萝卜素色素(gydF4y2Ba金et al ., 2016gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
关于柄/睑板的颜色,黄色的主导(初级)表型是最常见的两性位置,指示类胡萝卜素沉积在小腿的皮肤(gydF4y2Ba生,2009gydF4y2Ba)。灰色/蓝柄是第二个最频繁的表型;然而,母鸡更有可能grey-to-black小腿相比旋塞。白柄表型排名第三在两性的发生。这些发现与是一致的gydF4y2BaSsewannyana et al。(2008)gydF4y2Ba关于主导柄颜色的顺序在本土鸡在乌干达。黄色跗骨鸡的主导地位已经报道其他地方(gydF4y2Ba比伊·德斯塔et al ., 2013gydF4y2Ba;gydF4y2BaNegassa et al ., 2014gydF4y2Ba;gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba)。相反,白色跗骨主要在阿尔及利亚鸡人口(gydF4y2BaDahloum et al ., 2016gydF4y2Ba)。粉红色和green-shank表型更频繁地在目前的研究中观察到公鸡母鸡。gydF4y2Ba
鸡身体的皮肤颜色的变化和柄受到性别的影响,基因型、生理状态和在蛋鸡(尤其突出gydF4y2Ba埃里克森et al ., 2008gydF4y2Ba)。(黑暗)皮Dark-pigmented或呆滞中观察到贫穷层;此外,在铺设期间,黄色颜料从身体转向的蛋鸡蛋黄(gydF4y2Ba辛格2022年gydF4y2Ba)。因此,这些因素的综合效应和本研究中使用的主观色彩的决心可以解释黄色柄母鸡的频率越高,否则通常表现出沉闷的皮肤。gydF4y2Ba
主要的眼睛颜色是橙色,紧随其后的是黄色和棕色的。深绿色,粉红色,深红色的,蓝色和青色/变异的眼睛颜色很少观察到。这些发现证实了早先的报告orange-eyed鸡在乌干达的优势(gydF4y2BaSsewannyana et al ., 2008gydF4y2Ba)。类似的发现报道在阿尔及利亚土著鸡(gydF4y2BaDahloum et al ., 2016gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
关于耳垂的色彩,我们的研究结果是相反的gydF4y2BaSsewannyana et al。(2008)gydF4y2Ba谁没有特别报道,色彩在乌干达发生在母鸡的耳垂。母鸡在目前研究显示突出的耳垂颜色的巨大差异。我们的观察红色或粉红色的耳垂损伤与白色,黄色,蓝色或青色/符合观测在埃塞俄比亚(gydF4y2Ba比伊·德斯塔et al ., 2013gydF4y2Ba)。红色(光明与黑暗变体)占主导地位的耳垂颜色变体在这项研究是一致的报告在埃塞俄比亚村鸡的数量(gydF4y2BaDana et al ., 2010gydF4y2Ba;gydF4y2Ba比伊·德斯塔et al ., 2013gydF4y2Ba)。观察到白色耳垂的比例远低于先前的报道在乌干达(gydF4y2BaSsewannyana et al ., 2008gydF4y2Ba)、阿尔及利亚(gydF4y2BaDahloum et al ., 2016gydF4y2Ba),和卢旺达(gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba)。据说耳垂颜色特征是伴性的和多基因(gydF4y2BaWragg et al ., 2012gydF4y2Ba)。顺便说一句,粉色,绿色,青色,灰色的耳垂颜色没有以前在乌干达的特征。因此,这项研究强调了大耳垂颜色的变化在本土乌干达鸡。母鸡更有可能比其他公鸡有耳垂的颜色比光红色。gydF4y2Ba
同样,鸡的喙的颜色差异很大。母鸡主要显示黄色(21.5%)、棕色(21.5%)、灰色(19.5%),和紫色/褐紫色的喙,而公鸡主要显示灰色(31.6%)、黄(18.4%),和棕色(18.8%)的喙。一般来说,灰色的嘴更频繁地发生在聚合,紧随其后的是棕色和黄色按相同比例(分别为25.4%、20.1%和20.0%)。绿色喙的颜色的比例高于在卢旺达鸡(gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba)而不是报道在埃塞俄比亚人口。黄色到褐色喙可能是由于类胡萝卜素色素从饲料而灰色的叶黄素黑喙发生由于黑色素浓度高。gydF4y2Ba
在乌干达土著鸡的头部特征gydF4y2Ba
协会的所有描述性乌干达土著鸡的头部特征(gydF4y2Ba补充图S15gydF4y2Ba和gydF4y2Ba表6gydF4y2Ba)性的性别特征的类别可能确证的证据的本质耳垂形状和大小,梳子类型以及金合欢和波峰的存在。母鸡一般典型的小圆,耳垂,单一类型梳小金合欢。公鸡另一方面通常呈现椭圆形的大耳垂与单一类型梳子以及大型软盘金合欢。gydF4y2Ba
尽管发病率低,母鸡在地区更有可能比公鸡簇绒波峰。这是与报告一致gydF4y2Ba比伊·德斯塔et al。(2013)gydF4y2Ba但相反的报告比母鸡的簇绒波峰旋塞gydF4y2Ba王et al。(2012)gydF4y2Ba。丛波峰non-sex-linked引起的鸡的显性基因,它是比公鸡母鸡更明显。因此,有更多的簇绒波峰比公鸡母鸡可能是由于早扑杀公鸡的农民育种实践跨区域从他们的羊群。gydF4y2Ba
梳子类型是由两个主要基因,gydF4y2BaRgydF4y2Ba和gydF4y2BaPgydF4y2Ba分别为玫瑰和豌豆梳子。没有这些显性基因导致single-comb类型(gydF4y2Ba雅各,2022gydF4y2Ba)。因此,玫瑰梳特征发生在低比例表明低频率的基因,与其它报道一致(gydF4y2Ba比伊·德斯塔et al ., 2013gydF4y2Ba;gydF4y2BaNegassa et al ., 2014gydF4y2Ba;gydF4y2BaDahloum et al ., 2016gydF4y2Ba;gydF4y2Ba布朗et al ., 2017gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
钩状的喙的发生在卢旺达支持的一般惯例弯曲的喙土著鸡(gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba)。嘴的形状中扮演着至关重要的角色在家园寻找饲料资源。在野外,鸟类的喙构象影响适应行为,如整理,探索为食物,喂食,杀死小猎物/害虫,操纵对象,喂养后代(gydF4y2Ba雅各,2022gydF4y2Ba)。然而,没有研究详细的进化和国内鸡喙的地貌形态示量(gydF4y2Ba伊克巴尔和苔藓,2021年gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
低比例的豌豆梳在这项研究可能与无关紧要的热带气候较冷的地区,因为它是一种自适应特征(gydF4y2Ba李,2009gydF4y2Ba)。然而,梳子和金合欢重大功能降低体温。这是符合几乎普遍发生的金合欢(98.0%的母鸡和公鸡的100%,gydF4y2Bap
鸡骨架方差在乌干达土著人口gydF4y2Ba
一个重要的(gydF4y2Bap
等位基因和表型频率的主要特征在乌干达土著人口鸡gydF4y2Ba
尽管相当低的分布主要鸡鸡菌株在乌干达土著人口,簇绒波峰的等位基因频率(0.29),ptilopody(0.20),和玫瑰梳(0.17)菌株符合预期孟德尔的比例0.25;来显示他们的偏好由农民让他们选择。这一发现是相反的等位基因频率低于预期簇波峰,ptilopody,阿尔及利亚和玫瑰梳(gydF4y2BaDahloum et al ., 2016gydF4y2Ba)、加纳(gydF4y2Ba蒙沙,2016年gydF4y2Ba;gydF4y2Ba布朗et al ., 2017gydF4y2Ba)和尼日利亚本土鸡的数量(gydF4y2BaIkeobi et al ., 2001gydF4y2Ba)。同时,卷曲的低频和polydactyl等位基因,尽管他们与热应力适应和更高的体重,分别是暗示他们的危害,部分原因是选择对他们的人口和忽视在乌干达的育种项目。gydF4y2Ba
在乌干达土著鸡菌株的形态学特征gydF4y2Ba
鸡菌株没有明显不同体重和线性测量性类别内,除了高梳高度naked-neck公鸡比玫瑰梳旋塞。略naked-neck最长的板条长度母鸡和公鸡与正常相比,卷曲,polydactyl,梳子,簇绒波峰菌株可以在板条naked-neck基因的影响作为散热特征长度。naked-neck基因与环境的相互作用,从而影响菌株的生产性能在高温(gydF4y2Ba陈et al ., 2008gydF4y2Ba)。此外,柄其中最大的玫瑰梳母鸡和公鸡与其他菌株相比,与报告一致gydF4y2BaAdekoya et al。(2013)gydF4y2Ba。这表明当地生理适应现行生产系统在乌干达像其他非洲国家;然而,机制还不清楚因为玫瑰梳基因被认为是欧洲血统(gydF4y2BaIkeobi et al ., 2001gydF4y2Ba)。在母鸡,feathered-shank (ptilopody)应变略重,大胸围,再梳长度与正常相比,naked-neck,卷曲,polydactyl,玫瑰梳菌株。然而,大腿长度的上限卷曲鸡与其他菌株相比。与此同时,在公鸡naked-neck应变显示略重的体重与其他菌株相比,虽然胸围和大腿长度的上限簇绒波峰和羽毛柄菌株。鸡品种的影响的估计体重和线性测量记录在本研究在之前的报告(相媲美gydF4y2Ba蒙沙,2016年gydF4y2Ba;gydF4y2Ba布朗et al ., 2017gydF4y2Ba;gydF4y2Ba砍刀et al ., 2017gydF4y2Ba)。相比之下,高体重一直在报道naked-neck鸡鸡相比其他菌株(gydF4y2BaNjenga 2005gydF4y2Ba;gydF4y2BaBirteeb et al ., 2016gydF4y2Ba)。鸡的有利边际估计菌株流行的低投入条件下可以进一步探索潜在的改善保持条件下。gydF4y2Ba
一般强大的表型相关系数对所有成对的地貌形态示量变量(gydF4y2Ba补充表S7gydF4y2Ba)鸡菌株在这项研究中,除了CH和SC, CH和SL, CL和SL,西城的TL母鸡证实大多数研究报告(gydF4y2BaEgena et al ., 2011gydF4y2Ba;gydF4y2BaDahloum et al ., 2016gydF4y2Ba;gydF4y2BaHirwa et al ., 2019gydF4y2Ba;gydF4y2BaOtecko et al ., 2019gydF4y2Ba)。此外,所有对的形态学特征的相关系数在公鸡比母鸡更强,只有LW TC和CH和TC对可比,此前在其他各种选择性力量和两性异形的进化在鸡(gydF4y2BaKarubian襁褓,2001gydF4y2Ba)。这提供了一个良好的代理估计鸡活体重的其他的形态学值的基础上,特别是那些表明内在身体的大小。gydF4y2Ba
结论gydF4y2Ba
这项研究的结果显示一个伟大的生产和表型的遗传资源多样性乌干达土著鸡通常饲养在广泛的清除,混合农畜产品系统支持家庭生计;即使在小农场的超过20只鸡。土著鸡的至关重要的角色在乌干达被进一步强调在一个社会只有20.8%的女户主家庭中,40.6%的女性负责保持本土鸡。这形成一个平衡的系统的一部分主要集中在销售创收和家庭食物来源。生产性能的产蛋母鸡的约40.3±0.6鸡蛋/年,而成熟的鸡的重量在销售平均为1.535公斤和2.256公斤,分别为母鸡和公鸡。鸡蛋生产在大多数indigenous-chicken-keeping事业通常都消耗在家庭或孵化舱口替代股票。尽管他们生产性能低,部分是由于饲养实践实施的挑战,本土鸡在乌干达是哈代和良好的身体条件提供多用途功能,包括作为资本收购其他牲畜的羊群,主要是山羊。因此,改善管理实践和医疗和补充喂养,除了选择在本地鸡增加生产力和保护盛行的环境下,可以帮助提高他们的生产率。gydF4y2Ba
广泛的表型变异在所有特征研究以及一般两两之间强烈的表型相关的形态学测量变量,尤其是对于那些旋塞。然而,只有略微高估计鸡菌株的形态学特征的检测,没有清楚地推断出更高的性能,尽管在正常的概念更好的生产性能。等位基因频率高那些描述主要的鸡品种包括簇绒波峰,玫瑰梳,ptilopody。这展示了当地的接受和前景在乌干达可持续利用和保护价值。相比之下,基因频率较低的卷发和polydactyl基因尽管与适应性低投入的管理系统和热带环境,表明他们的偏好和风险低的迷失在乌干达鸡遗传资源。这种情况要求科学驱动,确保这样的特征自适应的本质是维护,以确保其可持续发展、利用、管理和保护。分子遗传学技术的使用将有助于确定表型多样性。gydF4y2Ba
数据可用性声明gydF4y2Ba
最初的贡献提出了研究中都包含在这篇文章/gydF4y2Ba补充材料gydF4y2Ba。进一步询问可以针对相应的作者。gydF4y2Ba
道德声明gydF4y2Ba
动物研究回顾和批准的乌干达国家科学技术理事会(理事会起草(间隙。A154ES)和古卢大学研究伦理委员会(许可gurec - 2020 - 18)。书面知情同意参与并不是来自业主因为口头同意强制获取家庭电子同意书AnGR-CIM工具中的数据用于描述研究,参与者把他们的口头同意从地方兽医办公室书面同意后参与我们的社区入口协议。gydF4y2Ba
作者的贡献gydF4y2Ba
IY、DK、钼,PA, RC, FD概念化和设计工作;IY DK收集数据;IY DK分析和解释数据;IY DK起草了这份手稿;DK、PA和RC批判性修订后的手稿;DK,厘米和FD监督研究;FD、DK、钼、PA和RC获得资金;DK, FD和莫提供项目管理;所有作者读批准了最终版本的手稿出版。gydF4y2Ba
资金gydF4y2Ba
本研究选择分子标记辅助育种的一部分本地鸡在莫桑比克和乌干达项目由非洲联盟委员会资助(批准号AURG ii - 2 - 115 - 2018)。gydF4y2Ba
确认gydF4y2Ba
我们感激我们的研究伙伴Edwardo Mondlane大学,莫桑比克;乌干达Makerere大学;乌干达古卢大学;乌干达的女性网络(WOUGNET);国际农村家禽中心、Kyeema基金会和小鸡大师有限的团队合作的方法,提供了一个环境,使得本研究。我们巨大的由于AU-IBAR,肯尼亚的贡献相对于数据收集和管理工具的供应;即。,the AnGR-CIM tool on Galaxy Tab A6 (Android) devices and the AAGRIS (database) as well as offering the technical training on the tools for the field breed survey. We gratefully acknowledge the contribution of Prof. Morris Agaba (NM-AIST) and Prof. Charles Masembe (CoNAS, MAK) as well as the field survey team. Finally, we are forever indebted to the reviewers for their valuable suggestions to improve this work and the participating local chicken farmers for their willingness to contribute to the study. The funders had no role in the study design, data collection and analysis, or preparation of this manuscript.
的利益冲突gydF4y2Ba
作者声明,这项研究是在没有进行任何商业或财务关系可能被视为一个潜在的利益冲突。gydF4y2Ba
出版商的注意gydF4y2Ba
本文表达的所有索赔仅代表作者,不一定代表的附属组织,或那些出版商编辑和评论员。任何产品,可以评估在这篇文章中,或声称,可能是由其制造商,不保证或认可的出版商。gydF4y2Ba
补充材料gydF4y2Ba
本文的补充材料在网上可以找到:gydF4y2Bahttps://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2022.1033031/full补充材料gydF4y2Ba
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关键词:gydF4y2Ba土著鸡、定性特征,背带gallu,描述性的表型性状,清除管理系统,表型影响形态特征,遗传多样性,鸡肉菌株gydF4y2Ba
引用:gydF4y2Ba所我博士Kugonza Okot MW, Amuge阿宝,科斯塔R和Dos Anjos F(2023)乌干达鸡遗传资源:一、表型和生产特点。gydF4y2Ba前面。麝猫。gydF4y2Ba13:1033031。doi: 10.3389 / fgene.2022.1033031gydF4y2Ba
收到:gydF4y2Ba2022年8月31日;gydF4y2Ba接受:gydF4y2Ba2022年12月29日;gydF4y2Ba
发表:gydF4y2Ba2023年1月24日。gydF4y2Ba
编辑:gydF4y2Ba
Oladeji BamidelegydF4y2Ba国际家畜研究所(尼日利亚),尼日利亚gydF4y2Ba审核:gydF4y2Ba
Pradeepa席尔瓦gydF4y2Ba斯里兰卡Peradeniya大学gydF4y2BaTakele意甲比伊·德斯塔gydF4y2BaKotebe城市大学(KMU),埃塞俄比亚gydF4y2Ba
朱利叶斯·哈根gydF4y2Ba海岸角大学加纳gydF4y2Ba
版权gydF4y2Ba©2023所,Kugonza、Okot Amuge,科斯塔和Dos Anjos。这是一个开放分布式根据文章gydF4y2Ba知识共享归属许可(CC)。gydF4y2Ba使用、分发或复制在其他论坛是允许的,提供了原始作者(年代)和著作权人(s)认为,最初发表在这个期刊引用,按照公认的学术实践。没有使用、分发或复制是不符合这些条件的允许。gydF4y2Ba
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