DNA甲基化的差异同卵双胞胎Van der Woude综合症

艾琳·l·蝶呤 ^{1 *},Erliang曾 ¹,玛丽•a•托马斯², 达尼洛Moretti-Ferreira ³,Mary l . Marazita ⁴,西安j .谢¹, 杰夫·c·穆雷 ⁵和莉娜·m·Moreno-Uribe¹

• ¹牙科学院和牙科诊所,美国爱荷华大学
• ²医学遗传学、Cumming医学院的加拿大的卡尔加里大学
• ³化学和生物科学、生物科学研究所的巴西圣保罗州立大学
• ⁴颅面和牙科中心遗传学、牙科医学学院,美国匹兹堡大学
• ⁵卡佛医学院,美国爱荷华大学

Van der Woude综合征(大众)是一种常染色体显性疾病负责2%的综合征orofacial结晶(离岸金融中心)IRF6是主要的因果基因(70%)。情况下可能会出现嘴唇的坑,要么唇裂、唇裂和腭裂,或腭裂,明显表型不一致甚至个体携带相同的突变。这表明,遗传或表观遗传修饰符可能扮演其他角色综合征的病因和变化的表达式。我们报告2的第一个DNA甲基化分析与大众对同卵双胞胎。我们的目标是探索表观遗传贡献大众病因和可变表型表达能力通过比较DNAm概要文件在这两个双胞胎。而突变导致大众在这些双胞胎是已知的,额外的风险机制在表型和变化表达尚不清楚。我们生成的全基因组DNAm双胞胎的数据。不同甲基化头寸(纯数字)选择基于:(1)DNAm水平的变异系数影响个体< 20%,(2)intra-twin一对DNAm水平绝对差> 5%(δβ> | 0.05 |)。然后我们把纯分为两个子组每一对双胞胎进行进一步分析:(1)较高的甲基化水平在双(双>双胞胎B);和(2)甲基化水平较高的双胞胎B基因本体论(双胞胎B >双胞胎)。分析发现一个丰富的基因列表显示重要的微分DNAm,包括clef-associated基因。 Among the cleft-associated genes, TP63 was the most significant hit (p=7.82E-12). Both twin pairs presented differential DNAm levels in CpG sites in/near TP63 (Twin 1A > Twin 1B and Twin 2A < Twin 2B). The genes TP63 and IRF6 function in a biological regulatory loop to coordinate epithelial proliferation and differentiation in a process that is critical for palatal fusion. The effects of the causal mutations in IRF6 can be further impacted by epigenetic dysregulation of IRF6 itself, or genes in its pathway. Our data shows evidence that changes in DNAm is a plausible mechanism that can lead to markedly distinct phenotypes, even among individuals carrying the same mutation.