将西兰花残留成spring-sowing-cotton土壤抗黄萎病的发生和根际微生物群落结构和功能gydF4y2Ba
李伟菘赵gydF4y2Ba,gydF4y2Ba
沛沛王gydF4y2Ba
音)董gydF4y2Ba,gydF4y2Ba
Shezeng李gydF4y2Ba,gydF4y2BaXiuyun,gydF4y2Ba小云,gydF4y2Ba
Zhenhe苏gydF4y2Ba,gydF4y2Ba
轻钢郭gydF4y2Ba*和gydF4y2Ba
平马gydF4y2Ba*gydF4y2Ba- 综合病虫害管理创新中心,河北省重点实验室IPM在华北北部地区的农作物,植物保护研究所、河北农业和林业科学院、农业部和农村事务部,保定,中国gydF4y2Ba
棉花黄萎病(飞行联队)代表一个典型植物土传病害,在棉花生产导致了广泛的经济损失。然而,西兰花残留的影响(BR)黄萎病spring-sowing-cotton还不清楚。我们调查的影响,BR联队,在根际微生物群落结构和功能两个棉花品种与不同的飞行联队电阻使用扩增子测序方法。结果表明,控制BR对飞行联队的易感品种的影响(简历。EJ-1)和抗性品种(简历。J863)分别为58.49%和85.96%,和数量gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba分别下降了14.31%和34.19%。BR处理细菌多样性指数显著增加,而真菌多样性指数明显下降。微生物群落的组成、能力招募细菌和真菌在BR增强治疗,包括gydF4y2BaRB41gydF4y2Ba,gydF4y2BaGemmatimonasgydF4y2Ba,gydF4y2BaPontibactergydF4y2Ba,gydF4y2Ba链霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaBlastococcusgydF4y2Ba,gydF4y2BaMassiliagydF4y2Ba,gydF4y2Ba芽孢杆菌gydF4y2Ba,gydF4y2Ba赤霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaPlectosphaerellagydF4y2Ba,gydF4y2BaNeocosmosporagydF4y2Ba,gydF4y2Ba曲霉属真菌gydF4y2Ba和gydF4y2BaPreussiagydF4y2Ba。然而,的相对丰度gydF4y2BaSphingomonasgydF4y2Ba,gydF4y2BaNocardioidesgydF4y2Ba,gydF4y2BaHaliangiumgydF4y2Ba,gydF4y2BaLysobactergydF4y2Ba,gydF4y2Ba青霉菌gydF4y2Ba,gydF4y2BaMortierellagydF4y2Ba和gydF4y2BaChaetomidiumgydF4y2Ba在BR处理品种之间相反的趋势。根据PICRUSt分析,预测显示,功能配置代谢功能发生重大变化影响KEGG通路BR处理相关的代谢和生物合成。FUNGuild分析表明,BR处理改变了真菌营养模式的相对丰度。这项研究的结果表明,BR处理的数量减少gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba在土壤,增加细菌多样性,减少真菌多样性,改变了微生物群落结构和功能,并增加有益微生物的丰度。gydF4y2Ba
介绍gydF4y2Ba
棉(gydF4y2Ba陆地棉LgydF4y2Ba)是世界最重要的天然纺织纤维来源和重要的油料作物(Y.L.gydF4y2BaZhang et al ., 2016gydF4y2Ba)。在中国,棉花种植模式分为spring-sowing-cotton和summer-sowing-cotton。西北内陆地区棉花,棉花种植区主要包括黄河流域棉花区域和长江流域棉花区域。西北内陆地区和黄河流域棉花棉区域,spring-sowing-cotton是主要的种植模式,虽然summer-sowing-cotton是长江流域的主要种植模式棉花的地区。作为一个季节作物,spring-sowing-cotton一般晚熟品种的长期增长。Summer-sowing-cotton早熟品种,生长周期短。Summer-sowing-cotton播种在5月底6月初。的主要种植模式summer-sowing-cotton wheat-cotton双重培养,油籽rape-cotton双重培养,cabbage-cotton双重培养等等。西兰花是河北省种植和一个重要的经济作物。西兰花通常有两种种植模式在这方面,一个是在早春种植(3月),和其他在夏季和秋季(8月初)。 We have previously evaluated the impact of BR on verticillium wilt of summer-sowing-cotton (W.S.赵et al ., 2019gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
棉花黄萎病(飞行联队),造成的gydF4y2Ba黄萎病dahliaegydF4y2Ba是典型的土传病害,导致大量的经济损失。在中国,大约有250 - 310美元的损失已报告每年由于棉花gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba(hgydF4y2Ba李et al ., 2015gydF4y2Ba;L;gydF4y2Ba拉赫曼et al ., 2018gydF4y2Ba)。飞行联队尤其难以控制由于长寿休眠microsclerotia产生的病原体,这可能可行的土壤中停留的时间超过2年(E.F.gydF4y2BaFradinand Thomma 2006gydF4y2Ba;年代;gydF4y2BaAlstrom 2001gydF4y2Ba),以及杀菌剂无法接触的菌丝gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba在木质部(中华民国后传播gydF4y2BaKlosterman et al ., 2009gydF4y2Ba)。当务之急是开发新颖的控制策略来控制这种毁灭性的疾病。先前的研究表明,土传病害管理主要依赖于熏蒸(Z.K.gydF4y2BaAtallah et al ., 2012gydF4y2Ba;地方检察官;gydF4y2Ba约翰逊和粪便,2010gydF4y2Ba;R.J;gydF4y2Ba泰勒et al ., 2005gydF4y2Ba)。然而,土壤化学熏蒸剂的应用可能对环境不友好(A.K.gydF4y2BaUppal et al ., 2008gydF4y2Ba)。因此,越来越多的兴趣,寻找疾病控制替代熏蒸剂。许多报告表明,有机土壤改良剂的使用可能是一个潜在的战略控制害虫,病原体,线虫和杂草(J.C.gydF4y2BaDiaz-Perez et al ., 2012gydF4y2Ba;J.A;gydF4y2BaLopez-Perez et al ., 2005gydF4y2Ba;J;gydF4y2BaPoveda et al ., 2021gydF4y2Ba),因为他们可能会增加有机质和养分和改变土壤微生物群落的结构(Z.Z.gydF4y2Ba沈et al ., 2013gydF4y2Ba;年代;gydF4y2BaAkao 2017gydF4y2Ba;D.L;gydF4y2Ba陈et al ., 2022gydF4y2Ba)。土壤微生物群落结构的变化引起的有机土壤改良剂对土壤健康提供有用的信息和质量(P.H.B.gydF4y2Ba保尔森et al ., 2013gydF4y2Ba;N;gydF4y2BaRodriguez-Berbel et al ., 2022gydF4y2Ba)。特别是,土壤细菌社区有机土壤改良剂的反应尤为重要和被认为是疾病的主要因素之一,抑制(P。gydF4y2BaGarbeva et al ., 2004gydF4y2Ba;A.O;gydF4y2BaAkanmu et al ., 2021gydF4y2Ba)。西兰花残留物(BR)据报道,成功地减少茄子黄萎病发病率,马铃薯、草莓、向日葵和summer-sowing-cotton通过减少microsclerotia或DNA复制的数量gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba在土壤(P。gydF4y2BaInderbitzin et al ., 2018gydF4y2Ba;w;gydF4y2Ba赵et al ., 2019gydF4y2Ba;gydF4y2Ba2021年gydF4y2Ba)。控制机制部分归因于分解土壤中硫配糖体的BR生产挥发性化合物(异硫氰酸酯),真菌的属性(国民生产总值gydF4y2Ba弯曲和林肯,1999年gydF4y2Ba;K.V;gydF4y2Ba苏巴拉奥et al ., 1999gydF4y2Ba)。然而,更深入的研究应该进行进一步探索这种潜在的机制,特别是从根际土壤microbiomics的角度。Microbiome-based研究打开了一个崭新的领域,将极大地扩展我们的知识的植物疾病发病率和微生物群之间的关系,并提供新的发展机遇生物电控制的新方法。据我们所知,这详细比较相关的土壤微生物群落与不同品种耐联队是第一个在BR进行治疗。gydF4y2Ba
河北是中国第二大棉花种植的省份,种植面积约150公顷,以spring-sowing-cotton为主要种植模式。在我们之前的研究中,这是表明,BR能够减少summer-sowing-cotton黄萎病的发生和提高土壤细菌群落结构下broccoli-cotton双种植栽培模式(至此gydF4y2Ba赵et al ., 2019gydF4y2Ba)。然而,BR对黄萎病的发生的影响spring-sowing-cotton和土壤细菌和真菌的社区仍不清楚。gydF4y2Ba
最近的证据表明,可变性在植物基因型或品种对根际土壤微生物产生重大影响,尤其是细菌(igydF4y2BaStringlis et al ., 2018gydF4y2Ba;J.Y;gydF4y2BaZhang et al ., 2019gydF4y2Ba)。然而,信息在根际土壤微生物群落的变化,影响棉花品种,不同耐联队后仍然缺乏BR的应用。目前尚不清楚,如果是这样,如何品种抵抗gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba根际微生物有关。本研究的总体目标是所以我)来确定BR的效果的抗黄萎病发病率spring-sowing-cotton不同飞行联队阻力水平,2)研究土壤微生物多样性指数的差异,和微生物群落结构在BR处理、iii)来分析BR对土壤微生物的影响函数。gydF4y2Ba
材料和方法gydF4y2Ba
现场试验的网站gydF4y2Ba
实验地点是位于衢州县(115°01′E, 36°47′N),河北省。相同领域有一个历史悠久的棉花种植和飞行联队。字段与平坦的地形,相对统一的生育和连续的棉花种植了10多年。土壤养分特征描述如下:土壤有机质0.66%,硝酸盐氮21.3毫克/公斤,铵氮12.5毫克/公斤,可用钾0.25毫克/公斤,磷0.68毫克/公斤,pH值8.35。gydF4y2Ba
实验装置和设计gydF4y2Ba
实验进行了从2018年到2019年。该领域被分为两个情节。第一个情节被任命为BR,花椰菜(品种《)是2018年8月,种植可食用部分收获后,BR进入土壤的结合进行了根据先前的方法研究(至此gydF4y2Ba赵et al ., 2020gydF4y2Ba),然后在棉花种植之后(2019年)。第二个情节被任命为CK,棉花种植连续两年(2018年和2019年)。棉花品种ej 1 (EJ-1,易感联队)和品种冀863(飞行联队J863,耐药)与不同的飞行联队阻力水平种植4月25日。实验设计包括四种治疗方法:1)易感品种EJ-1种植没有BR (EJ-1-CK);2)易感品种EJ-1种植BR (EJ-1-BR);3)抗品种J863种植BR (J863-BR);4)种植抗性品种J863没有BR (J863-CK)。实验组成的36个40米长的行字段,间隔75厘米在每一行,每一个情节,三行代表一个复制,每个复制区域是60平方米。实验三个复制。gydF4y2Ba
土样的采集、DNA提取和qPCR分析gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba
收集土壤样本来自不同治疗方法的开花和boll-forming阶段棉花。在每个采样情节,三种植物被随机选择和使用铲小心翼翼地从土壤中删除。三种植物的根系从每个情节首先大力动摇了去除松散坚持土壤颗粒,然后剩下的根系相结合作为根际土壤样品。土壤样本立即保存在4°C不到48 h。删除植物材料,渗过的样本在−2.0 mm筛和存储为后续80°C DNA提取。DNA样本提取后的说明书FastDNA™旋转工具土壤(MP生物医学,梭伦,哦,美国)按照制造商的协议。DNA的浓度和质量是决定使用分光光度计(NanoDrop 2000;热费希尔科学Inc .,沃尔瑟姆,妈,美国)。提取的DNA是储存在−20°C之前进行进一步的分析。DNA复制的数量gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba在不同的土壤样本通过qPCR根据我们之前的研究中描述的方法(至此gydF4y2Ba赵et al ., 2019gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
PCR扩增,Illumina公司MiSeq测序和数据处理gydF4y2Ba
PCR扩增的细菌16 S rRNA针对V3和V4地区是由使用引物338 F (5′-ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3′)和806 R (5′-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3′),和真菌与引物1地区ITS1F (5′-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3′)和ITS2R (5′-GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3′)(至此gydF4y2Ba赵et al ., 2021gydF4y2Ba)。PCR协议被用来放大16 S rRNA基因及其基因(至此gydF4y2Ba赵et al ., 2021gydF4y2Ba;R;gydF4y2Ba陆et al ., 2018gydF4y2Ba)。最后,等量的PCR产物从每个样本被放置在个别管子和分析Illumina公司MiSeq平台。Illumina公司执行MiSeq测序在Majorbio Biopharm科技有限公司有限公司(上海,中国)。原始序列数据都需要在国家生物技术信息中心(NCBI)加入数字PRJNA734729和PRJNA894483。处理原始序列进行使用QIIME 1.9软件。Paired-end读取被分配到样品基于他们的独特的条形码和合并使用FLASH 1.2软件。读(平均质量分数< 20),不当引物和模棱两可的基地集群(周益春之前被丢弃gydF4y2Ba冯et al ., 2019gydF4y2Ba)。有效的序列被聚集到操作分类单元(辣子鸡)在97%相似性使用UPARSE 7.0软件。土壤细菌和真菌多样性指数计算的基础上重新取样OTU丰度矩阵在MOTHUR 1.30软件。gydF4y2Ba
BR对棉花生长的影响评估促销和飞行联队发病率gydF4y2Ba
BR在棉花的影响与生长有关的特征。联队的清规戒律,所有单个植物被记录在0 - 4的规模。每个情节的疾病指数联队计算基于一个五级分类联队根据植物叶片的百分比与萎黄病等症状,坏死或落叶(至此gydF4y2Ba赵et al ., 2019gydF4y2Ba)。详细陈述如下:0 =健康的植物或没有症状,1 =病植物叶症状25%以下,2 = 26% - -50%患病的植物叶症状和叶缘卷起,枯萎的症状,3 = 51% - -75%患病的植物叶症状和叶缘卷起枯萎症状,4 = 76%以上的植物与叶症状或死亡。该病发病率、疾病指数和控制效果是使用以下公式计算:gydF4y2Ba
统计分析gydF4y2Ba
统计上显著差异(gydF4y2BapgydF4y2Ba在疾病指数< 0.05),DNA复制的数量gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba,土壤细菌和真菌群落组成的变化之间的CK和BR治疗评估学生的学习任务或单向方差分析(方差分析)使用SPSS 17.0。主成分分析(PCA)进行探索土壤细菌和真菌群落结构的差异。分析相似之处(ANOSIM)进行识别显著差异在细菌和真菌群落结构和功能的治疗方法。系统未被注意的国家调查社区的重建(PICRUSt)软件包是用来预测不同样本中细菌群落的功能成分扩增子测序结果。功能基因和基因组的基因识别从京都百科全书(KEGG数据库)。FUNGuild数据库用于分析、分类和解释的真菌社区根据真菌功能。FUNGuild软件注释分类OTU表中的数据与相应的在线数据库,数据注释包括工会、营养模式和增长形态;只有信心得分的“可能”和“非常可能”。图生成与起源8.6软件。gydF4y2Ba
结果gydF4y2Ba
BR对飞行联队的影响不同的品种和数量gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba根际土壤中gydF4y2Ba
BR治疗疾病指数联队(产生重大影响gydF4y2BapgydF4y2Ba< 0.05)。对于易感品种(EJ-1),疾病指数分别为34.69和14.40在CK和BR治疗,分别。抗性品种(J863),疾病指数分别为7.62和1.07在CK和BR治疗,分别。敏感的疾病指数品种(EJ-1)和抗性品种(J863)分别下降了58.49%和85.96%,分别为(gydF4y2Ba图1gydF4y2Ba)。与CK相比,DNA复制的数量gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba在根际易感品种和抗病品种BR处理显著降低了14.31% (gydF4y2BapgydF4y2Ba= 0.015)和34.19% (gydF4y2BapgydF4y2Ba分别为= 0.007)(gydF4y2Ba图2gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
图1gydF4y2Ba。比较不同棉花品种的抗黄萎病发病率。CK代表空白治疗控制,BR代表治疗西兰花残留。EJ-1代表易感品种联队,J863代表联队抗性品种。值三个复制的方法。意味着同样的字母相同的品种并不显著不同的根据学生的学习任务gydF4y2BapgydF4y2Ba< 0.05。gydF4y2Ba
图2gydF4y2Ba。量化的gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba在qPCR土壤。CK代表空白治疗控制,BR代表治疗西兰花残留。EJ-1代表易感品种联队,J863代表联队抗性品种。酒吧有不同的字母是邓肯的多个测试范围明显不同gydF4y2BapgydF4y2Ba< 0.05。gydF4y2Ba
BR对棉花生长的影响gydF4y2Ba
棉花生长性状分别记录在不同的治疗方法,(gydF4y2Ba表1gydF4y2Ba)。品种EJ-1,与CK处理相比,增长特征(如株高、地径,鲜重,干重,和数量的分支)显著增加。J863品种,除了株高特点,地面直径没有明显差异,鲜重,干重和棉花数量的分支。此外,收益率的敏感和抗性品种kgha 3532.55 BR处理gydF4y2Ba−1gydF4y2Ba和5791.98 kghagydF4y2Ba−1gydF4y2Ba,收益率提高率分别为8.4%和3.7%,分别为(gydF4y2Ba表1gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
表1gydF4y2Ba。BR对棉花生长的影响。gydF4y2Ba
α多样性的土壤细菌和真菌的社区gydF4y2Ba
αACE表达的土壤微生物群落的多样性和曹国伟指数在我们的研究(gydF4y2Ba图3gydF4y2Ba)。对细菌、ACE和曹国伟指数在不同品种在BR处理高于CK治疗(gydF4y2Ba图3 a, BgydF4y2Ba)。然而,对于真菌,ACE和曹国伟指数在不同品种在BR处理是低于CK处理(gydF4y2Ba图3 c, DgydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
图3gydF4y2Ba。BR处理对土壤细菌和真菌α多样性指数的社区。gydF4y2Ba(A, B)gydF4y2Ba细菌,gydF4y2Ba(C, D)gydF4y2Ba真菌。CK代表空白治疗控制,BR代表治疗西兰花残留。EJ-1代表易感品种联队,J863代表联队抗性品种。酒吧有不同的字母是邓肯的多个测试范围明显不同gydF4y2BapgydF4y2Ba< 0.05。gydF4y2Ba
β多样性的土壤细菌和真菌群落结构gydF4y2Ba
主成分分析基于OTU水平被用来研究BR的影响对土壤细菌和真菌群落结构与不同棉花品种(gydF4y2Ba图4gydF4y2Ba)。结果表明,细菌群落结构与不同品种在同一象限在BR处理,而不同品种的空白控制位于不同的象限。这是表明,细菌群落结构变化和聚合在一起,BR处理(gydF4y2Ba图4一gydF4y2Ba)。然而,不同品种之间的真菌群落结构位于不同的象限BR处理,而不同品种的空白控制位于同一象限,这也表明,BR处理真菌群落结构改变(gydF4y2Ba图4 bgydF4y2Ba)。此外,第一主成分(PC1)和第二主成分(PC2) OTU水平根际土壤被发现解释34.07%和16.36%的细菌群落结构,所有的变量和36.34%和24.23%的所有变量在真菌群落结构,分别。的两个主成分的累积方差贡献率达到50.43%和60.57%,分别。此外,ANOSIM表明,BR处理极大地推动了CK的分离处理(gydF4y2BaRgydF4y2Ba= 0.9815,gydF4y2BapgydF4y2Ba= 0.001,细菌)和(gydF4y2BaRgydF4y2Ba= 0.8827,gydF4y2BapgydF4y2Ba= 0.001,真菌)。gydF4y2Ba
图4gydF4y2Ba。主成分分析(PCA)的微生物群落在OTU级别在不同的治疗方法。gydF4y2Ba(一)gydF4y2Ba细菌,gydF4y2Ba(B)gydF4y2Ba真菌。CK代表空白治疗控制,BR代表治疗西兰花残留。EJ-1代表易感品种联队,J863代表联队抗性品种。gydF4y2Ba
比较细菌群落组成gydF4y2Ba
在所有序列,未知序列被归类为“他人”。占主导地位的变形菌门细菌类群,放线菌,Acidobacteria, Gemmatimonadetes, Chloroflexi,拟杆菌门,Planctomycetes, Rokubacteria, Nitrospirae, Verrucomicrobia, Latescibacteria,厚壁菌门和Patescibacteria,这些类群占总数的95%以上在每个样本序列。的褶皱变化占主导地位的细菌类群的相对丰度与不同棉花品种相比,BR处理在门级(gydF4y2Ba图5一个gydF4y2Ba)。放线菌的相对丰度,Gemmatimonadetes、Rokubacteria Nitrospirae, Verrucomicrobia和品种EJ-1厚壁菌门,易感品种,增加在BR处理。而对于品种J863,抗性品种,Gemmatimonadetes的相对丰度,Chloroflexi, Planctomycetes, Rokubacteria Verrucomicrobia, Latescibacteria和壁厚菌门增加(gydF4y2Ba图5一个gydF4y2Ba)。此外,方差分析显示,变形菌门的平均比例的差异,拟杆菌门,Rokubacteria, Latescibacteria,厚壁菌门和Patescibacteria (gydF4y2Ba图5 bgydF4y2Ba)。Gemmatimonadetes的相对丰度、Rokubacteria Verrucomicrobia和壁厚菌门增加敏感和抗性品种,分别。厚壁菌门是最易感品种EJ-1褶皱变化(5.66),而对于Verrucomicrobia在抗性品种J863 (1.59)。gydF4y2Ba
图5gydF4y2Ba。占主导地位的细菌类群的相对多度门水平在不同的治疗方法。gydF4y2Ba(一)gydF4y2BaBR / CK褶皱对数变化,gydF4y2Ba(B)gydF4y2Ba的显著差异,分析平均比例占主导地位的细菌。日志gydF4y2Ba2gydF4y2Ba褶皱变化< 0代表类群的相对多度下降,日志gydF4y2Ba2gydF4y2Ba褶皱变化> 0代表类群的相对多度增加。CK代表空白治疗控制,BR代表治疗西兰花残留。EJ-1代表易感品种联队,J863代表联队抗性品种。星号代表了邓肯的多个测试范围明显不同gydF4y2BaPgydF4y2Ba< 0.05。gydF4y2Ba
此外,前23个主要细菌属(培养和至少一组两组平均相对丰度> 0.5%)gydF4y2BaSphingomonasgydF4y2Ba,gydF4y2BaRB41gydF4y2Ba,gydF4y2BaMND1gydF4y2Ba,gydF4y2BaHaliangiumgydF4y2Ba,gydF4y2Ba硝化螺菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaLysobactergydF4y2Ba,gydF4y2BaBryobactergydF4y2Ba,gydF4y2BaGemmatimonasgydF4y2Ba,gydF4y2BaGaiellagydF4y2Ba,gydF4y2BaIamiagydF4y2Ba,gydF4y2BaPontibactergydF4y2Ba,gydF4y2Ba链霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaSteroidobactergydF4y2Ba,gydF4y2BaIlumatobactergydF4y2Ba,gydF4y2BaBlastococcusgydF4y2Ba,gydF4y2BaDongiagydF4y2Ba,gydF4y2BaLuedemannellagydF4y2Ba,gydF4y2BaRubrobactergydF4y2Ba,gydF4y2BaNocardioidesgydF4y2Ba,gydF4y2BaGemmatirosagydF4y2Ba,gydF4y2BaMassiliagydF4y2Ba,gydF4y2Ba芽孢杆菌gydF4y2Ba和gydF4y2BaSphingobacteriumgydF4y2Ba(gydF4y2Ba图6gydF4y2Ba)。此外,方差分析表明,不同的平均比例gydF4y2BaSphingomonasgydF4y2Ba,gydF4y2BaRB41gydF4y2Ba,gydF4y2BaMND1gydF4y2Ba,gydF4y2BaHaliangiumgydF4y2Ba,gydF4y2BaLysobactergydF4y2Ba,gydF4y2BaGemmatimonasgydF4y2Ba,gydF4y2BaGaiellagydF4y2Ba,gydF4y2BaIamiagydF4y2Ba,gydF4y2BaPontibactergydF4y2Ba,gydF4y2BaIlumatobactergydF4y2Ba,gydF4y2BaBlastococcusgydF4y2Ba,gydF4y2BaDongiagydF4y2Ba,gydF4y2BaNocardioidesgydF4y2Ba,gydF4y2BaGemmatirosagydF4y2Ba,gydF4y2BaMassiliagydF4y2Ba,gydF4y2Ba芽孢杆菌gydF4y2Ba和gydF4y2BaSphingobacteriumgydF4y2Ba(gydF4y2Ba图6 bgydF4y2Ba)。易感品种EJ-1而言,的相对丰度gydF4y2BaSphingomonasgydF4y2Ba,gydF4y2BaRB41gydF4y2Ba,gydF4y2BaGemmatimonasgydF4y2Ba,gydF4y2BaPontibactergydF4y2Ba,gydF4y2Ba链霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaBlastococcusgydF4y2Ba,gydF4y2BaNocardioidesgydF4y2Ba,gydF4y2BaGemmatirosagydF4y2Ba,gydF4y2BaMassiliagydF4y2Ba,gydF4y2Ba芽孢杆菌gydF4y2Ba和gydF4y2BaSphingobacteriumgydF4y2BaBR处理增加了29.46%,50.95%,39.23%,49.67%,75.91%,44.95%,28.41%,151.74%,338.52%,分别为486.83%和710.03%。抗性品种J863的相对丰度gydF4y2BaRB41gydF4y2Ba,gydF4y2BaHaliangiumgydF4y2Ba,gydF4y2BaLysobactergydF4y2Ba,gydF4y2BaGemmatimonasgydF4y2Ba,gydF4y2BaPontibactergydF4y2Ba,gydF4y2Ba链霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaBlastococcusgydF4y2Ba,gydF4y2BaMassiliagydF4y2Ba和gydF4y2Ba芽孢杆菌gydF4y2BaBR处理增加了16.60%,11.08%,14.30%,16.05%,29.68%,75.69%,49.73%,分别为82.26%和106.84%。其中,的相对丰度gydF4y2BaRB41gydF4y2Ba,gydF4y2BaGemmatimonasgydF4y2Ba,gydF4y2BaPontibactergydF4y2Ba,gydF4y2Ba链霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaBlastococcusgydF4y2Ba,gydF4y2BaMassiliagydF4y2Ba和gydF4y2Ba芽孢杆菌gydF4y2Ba增加了BR治疗敏感和抗性品种。gydF4y2Ba
图6gydF4y2Ba。变化的相对丰度在属级细菌类群在不同治疗方法。gydF4y2Ba(一)gydF4y2Ba相对丰富的细菌gydF4y2Ba(B)gydF4y2Ba显著差异的分析意味着细菌的比例。CK代表空白治疗控制,BR代表治疗西兰花残留。EJ-1代表易感品种联队,J863代表联队抗性品种。gydF4y2Ba
比较真菌群落组成gydF4y2Ba
子囊菌类,担子菌类和Mortierellomycota主要真菌类群在不同的治疗方法。没有显著的差异敏感和抗性品种在BR处理(gydF4y2Ba补充图S1gydF4y2Ba)。在属级,23个主要真菌属gydF4y2Ba毛壳菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaCorynesporagydF4y2Ba,gydF4y2BaGibellulopsisgydF4y2Ba,gydF4y2Ba枝顶孢属gydF4y2Ba,gydF4y2Ba赤霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaPlectosphaerellagydF4y2Ba,gydF4y2BaSchizotheciumgydF4y2Ba,gydF4y2BaMortierellagydF4y2Ba,gydF4y2Ba柄孢壳菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaNeocosmosporagydF4y2Ba,gydF4y2BaCephalotrichumgydF4y2Ba,gydF4y2Ba青霉菌gydF4y2Ba,gydF4y2BaPseudombrophilagydF4y2Ba,gydF4y2BaChaetomidiumgydF4y2Ba,gydF4y2Ba尾孢属gydF4y2Ba,gydF4y2Ba链格孢属gydF4y2Ba,gydF4y2BaPoaceascomagydF4y2Ba,gydF4y2Ba曲霉属真菌gydF4y2Ba,gydF4y2BaCoprinellusgydF4y2Ba,gydF4y2BaPreussiagydF4y2Ba,gydF4y2BaBadarisamagydF4y2Ba,gydF4y2BaPodosordariagydF4y2Ba和gydF4y2BaCephaliophoragydF4y2Ba(gydF4y2Ba图7gydF4y2Ba)。此外,方差分析表明,不同的平均比例gydF4y2BaCorynesporagydF4y2Ba,gydF4y2BaGibellulopsisgydF4y2Ba,gydF4y2Ba枝顶孢属gydF4y2Ba,gydF4y2Ba赤霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaPlectosphaerellagydF4y2Ba,gydF4y2BaSchizotheciumgydF4y2Ba,gydF4y2BaMortierellagydF4y2Ba,gydF4y2Ba柄孢壳菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaCephalotrichumgydF4y2Ba,gydF4y2BaPseudombrophilagydF4y2Ba,gydF4y2Ba尾孢属gydF4y2Ba,gydF4y2Ba链格孢属gydF4y2Ba和gydF4y2BaPreussiagydF4y2Ba(gydF4y2Ba图7 bgydF4y2Ba)。易感品种EJ-1而言,的相对丰度gydF4y2BaCorynesporagydF4y2Ba,gydF4y2BaGibellulopsisgydF4y2Ba,gydF4y2Ba枝顶孢属gydF4y2Ba,gydF4y2Ba赤霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaPlectosphaerellagydF4y2Ba,gydF4y2Ba尾孢属gydF4y2Ba,gydF4y2Ba链格孢属gydF4y2Ba和gydF4y2BaPreussiagydF4y2BaBR处理增加,而其他人则降低了。抗性品种J863的相对丰度gydF4y2Ba赤霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaPlectosphaerellagydF4y2Ba,gydF4y2BaMortierellagydF4y2Ba,gydF4y2BaPseudombrophilagydF4y2Ba和gydF4y2BaPreussiagydF4y2Ba是增加了。其中,的相对丰度gydF4y2Ba赤霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaPlectosphaerellagydF4y2Ba,gydF4y2Ba链格孢属gydF4y2Ba和gydF4y2BaPreussiagydF4y2Ba增加在BR处理敏感和抗性品种之间的相对丰度gydF4y2BaSchizotheciumgydF4y2Ba,gydF4y2Ba柄孢壳菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaCephalotrichumgydF4y2Ba分别减少了。gydF4y2Ba
图7gydF4y2Ba。真菌类群的相对丰度的变化在属水平在不同的治疗方法。gydF4y2Ba(一)gydF4y2Ba相对丰富的真菌gydF4y2Ba(B)gydF4y2Ba显著差异的分析意味着比例的真菌。CK代表空白治疗控制,BR代表治疗西兰花残留。EJ-1代表易感品种联队,J863代表联队抗性品种。gydF4y2Ba
BR对根际微生物群落功能的影响gydF4y2Ba
研究BR对土壤细菌的影响函数,我们使用PICRUSt执行细菌功能预测分析。通过与KEGG数据库,比较6种一级的生物代谢途径获得,包括代谢、遗传信息处理、环境信息处理、细胞过程,器官系统和人类疾病(gydF4y2Ba表2gydF4y2Ba)。在这些途径、代谢、遗传信息处理,信息处理和环境是主要成分,占51.50% - -51.77%,分别为16.25% -13.06%,-16.32%和12.85%。环境信息处理的途径在不同品种表达下调与CK相比,BR处理。代谢通路的易感品种EJ-1浓缩在BR处理,而在抗性品种J863获得相反的趋势。此外,分析预测基因的功能途径2级显示,它由41子功能。品种EJ-1, 17通路,包括氨基酸代谢(如酪氨酸代谢),碳水化合物代谢(如戊糖和葡萄糖醛酸酯互变现象,果糖,甘露糖、淀粉和蔗糖代谢),多糖的生物合成和代谢(如N-glycan生物合成)、脂质代谢(如鞘脂类,亚油酸,类固醇生物合成)被浓缩在BR处理与CK相比,而对于品种J863, 23途径丰富与CK相比,BR处理(gydF4y2Ba图8gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
表2gydF4y2Ba。预测功能配置的比例在不同的治疗(通道1级)。gydF4y2Ba
图8gydF4y2Ba。预测的热图KEGG功能配置(KEGG级别2)的细菌微生物群在所有样本。*代表功能通路富集。CK代表空白治疗控制,BR代表治疗西兰花残留。EJ-1代表易感品种联队,J863代表联队抗性品种。gydF4y2Ba
FUNGuild被用来预测真菌群落的营养和功能基团有不同的治疗方法。结果表明,真菌社区分为九个营养模式组。真菌群体筛选到484可识别的物种,其中包括腐生生物(43.80%)、pathotroph-saprotroph-symbiotroph (16.32%)、pathotroph (14.88%)、symbiotroph (8.68%)、pathotroph-saprotroph (6.20%)、saprotroph-symbiotroph (6.20%)、pathogen-saprotroph-symbiotroph (1.45%)、pathotroph-symbiotroph(2.27%)和saprotroph-pathotroph-symbiotroph(0.21%)代表一般营养丰富的每个方法在确定社区(gydF4y2Ba补充图S2gydF4y2Ba)。其中,pathotrophs、腐生生物和symbiotrophs主要组件。pathotrophic模式组主要由植物病原体(不代表一个特定的形式)和动物病原体。植物病原体易感品种的相对丰度EJ-1样本在BR处理高于观察控制,同时,在抗性品种J863样本中观察到明显低于控制。此外,动物病原体品种的相对丰度EJ-1和J863样本在BR处理也明显低于观察控制(gydF4y2Ba图9gydF4y2Ba)。symbiotrophic模式组,除真菌、丛枝菌根的相对丰度和内生植物品种EJ-1 J863样本,BR处理显著低于观察控制(gydF4y2Ba图9 bgydF4y2Ba)。模式组的腐生生物,包括未定义的腐生生物,粪便腐生生物、植物腐生生物和木材腐生生物。的相对丰度粪腐生生物品种EJ-1样本在BR处理为2.21%,低于观察控制(8.90%),而在品种J863样本是4.48%,高于观察控制(3.38%)。然而,植物在品种EJ-1腐生生物样本的相对丰度在BR处理为0.66%,高于观察控制(0.31%),而在品种J863样本是0.07%,低于观察控制(0.14%)(gydF4y2Ba图9 cgydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
图9gydF4y2Ba。的相对丰度为真菌社区主要由FUNGuild公会分配。不同字母表示显著区别治疗被学生t测试(gydF4y2BaPgydF4y2Ba< 0.05)。gydF4y2Ba(一)gydF4y2Bapathotroph营养模式gydF4y2Ba(B)gydF4y2Basymbiotroph营养模式gydF4y2Ba(C)gydF4y2Ba腐生生物营养模式。gydF4y2Ba
讨论gydF4y2Ba
控制效果评价的BR飞行联队gydF4y2Ba
作物残留的使用是一个重要的方法与抑制黄萎病,如西兰花、荞麦、菜籽油、芥末酱、甜玉米(P。gydF4y2BaInderbitzin et al ., 2018gydF4y2Ba;w;gydF4y2Ba赵et al ., 2019gydF4y2Ba;gydF4y2Ba2021年gydF4y2Ba;B.E;gydF4y2Ba•威金斯Kinkel, 2005gydF4y2Ba;D.L;gydF4y2Ba惠勒和约翰逊,2016年gydF4y2Ba)。我们之前的研究表明,BR整合进土壤可以减少summer-sowing-cotton的抗黄萎病发病率,对飞行联队和控制效果达到70.77%下西兰花和棉花种植栽培模式(至此的两倍gydF4y2Ba赵et al ., 2019gydF4y2Ba)。在这项研究中,棉花黄萎病抗性水平不同的品种选择的影响评估BR spring-sowing-cotton抗黄萎病的发生。结果表明,控制效果的BR敏感和抗性品种分别为58.49%和85.96%,分别。与此同时,它可以显著降低的人口gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba在土壤中。我们的研究结果与以前的研究一致在菜花的疾病,茄子,土豆在BR处理(至此gydF4y2Ba赵et al ., 2019gydF4y2Ba;K.V;gydF4y2Ba苏巴拉奥et al ., 1999gydF4y2Ba;K;gydF4y2BaIkeda et al ., 2015gydF4y2Ba;j; rgydF4y2Ba戴维斯et al ., 2010gydF4y2Ba)。因此,BR的应用提供了一种新的方法和理念可持续防治联队在不同种植模式。gydF4y2Ba
BR对根际土壤微生物群落结构的影响不同的品种对飞行联队gydF4y2Ba
开发有效的策略应用的植物残留严重依赖于我们对几种土壤微生物及其相互作用的理解(X.F.gydF4y2Ba元et al ., 2021gydF4y2Ba;出口的;gydF4y2BaZhang et al ., 2021gydF4y2Ba)。有不同意见之间的关系(L.R.微生物群落多样性和发病率gydF4y2BaBulluck et al ., 2002gydF4y2Ba;Z.Z;gydF4y2Ba沈et al ., 2014gydF4y2Ba)。许多研究表明,土壤微生物群落的多样性和组成与土传病害的发生(至此gydF4y2Ba赵et al ., 2021gydF4y2Ba;L.R;gydF4y2BaBulluck et al ., 2002gydF4y2Ba;一个;gydF4y2BaGamliel et al ., 2000gydF4y2Ba)。先前的研究表明,土壤中细菌多样性促进抗植物病害(L。gydF4y2Ba施et al ., 2017gydF4y2Ba)。然而,一些学者报道,细菌群落多样性之间没有明显的相关性和香蕉枯萎病生物有机肥料的应用(Z.Z.gydF4y2Ba沈et al ., 2014gydF4y2Ba)。在目前的研究中,细菌多样性指数显著增加BR的应用后,然而,真菌多样性指数明显下降。同时,β-diversity的结果表明,品种间的根际细菌群落结构明显不同,和细菌群落结构改变,位于同一象限在BR处理,表明细菌群落结构趋于一致,朝着健康的方向发展土壤在BR处理。这个结果与之前的研究一致在根际土壤细菌群落结构的变化的茄子(P。gydF4y2BaInderbitzin et al ., 2018gydF4y2Ba)。真菌群落结构而言,没有明显的差异之间的根际品种本身,然而,它在BR改变治疗与CK相比。因此,建议BR治疗发挥了重要作用在棉花根际微生物群落结构的管理。此外,根际微生物群的构成的事实被品种的影响,土壤类型、健康状况和发展阶段的植物(至此gydF4y2Ba赵et al ., 2020gydF4y2Ba;X.M;gydF4y2Ba徐et al ., 2010gydF4y2Ba;Z.Q;gydF4y2Ba黄et al ., 2021gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
BR对棉花根际土壤微生物群落的关键微生物群gydF4y2Ba
变形菌门、放线菌、拟杆菌、厚壁菌门和Acidobacteria茄子根际的五个主要类群(P。gydF4y2BaInderbitzin et al ., 2018gydF4y2Ba)。放线菌被认为是植物生长促进细菌和可能产生不同的生物活性化合物(T。gydF4y2Ba曾,et al ., 2020gydF4y2Ba)。一些细菌,属于变形菌门,等gydF4y2BaSphingomonasgydF4y2Basp,可以防止番茄灰霉病(J。gydF4y2Ba恩雅et al ., 2007gydF4y2Ba(结核)和水稻幼苗疾病gydF4y2BaAdhikari et al ., 2001gydF4y2Ba),降低硝酸盐,提高总氮去除生物脱氮过程(W。gydF4y2Ba邢et al ., 2019gydF4y2Ba)。Acidobacteria可能潜在的细菌性枯萎病生物防治剂,能促进植物生长(比较温度gydF4y2Ba阴et al ., 2013gydF4y2Ba;,12;gydF4y2Ba肖et al ., 2018gydF4y2Ba)。门的一些成员Gemmatimonadetes土壤健康的可能是一个潜在的指标或嗜盐的(硕士gydF4y2BaHahm et al ., 2016gydF4y2Ba)。Acidobacteria和Gemmatimonadetes也可能参与碳、氮、硫的根际土壤的生物地球化学循环。gydF4y2BaKalam et al ., 2020gydF4y2Ba;C.L.M;gydF4y2BaKhodadad et al ., 2011gydF4y2Ba)。厚壁菌门发挥了重要作用在植物病害的生物防治和植物生长促进(周益春gydF4y2Ba冯et al ., 2019gydF4y2Ba;司仪;gydF4y2BaAzabou et al ., 2020gydF4y2Ba;S.Z;gydF4y2Ba李et al ., 2005gydF4y2Ba)。与空白控制相比,放线菌的招聘能力,Gemmatimonadetes,厚壁菌门和Rokubacteria易感品种EJ-1增加BR处理应用程序之后,而Gemmatimonadetes的招聘能力、厚壁菌门和Verrucomicrobia在抗性品种J863增加。在属级,gydF4y2BaRB41gydF4y2Ba可能导致N同化(硕士吗gydF4y2BaMeier et al ., 2021gydF4y2Ba)。gydF4y2BaGemmatimonasgydF4y2Ba有关氮的代谢和转化(Z。gydF4y2Ba刘et al ., 2021gydF4y2Ba)。gydF4y2BaBlastococcusgydF4y2Ba与碳的同化和参与代谢残渣分解的中间产品(F.L.吗gydF4y2Ba风扇et al ., 2014gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba链霉菌属gydF4y2Ba和gydF4y2Ba芽孢杆菌gydF4y2Ba被用作生物控制剂对植物病原体(P。gydF4y2BaInderbitzin et al ., 2018gydF4y2Ba;Z.Q;gydF4y2Ba黄et al ., 2021gydF4y2Ba)。在我们的研究中,的相对丰度gydF4y2BaSphingomonasgydF4y2Ba,gydF4y2BaNocardioidesgydF4y2Ba,gydF4y2BaGemmatirosagydF4y2Ba和gydF4y2BaSphingobacteriumgydF4y2BaBR处理敏感品种EJ-1增加,而为gydF4y2BaHaliangiumgydF4y2Ba,gydF4y2BaLysobactergydF4y2Ba,gydF4y2BaGaiellagydF4y2Ba,gydF4y2BaLuedemannellagydF4y2Ba和gydF4y2BaRubrobactergydF4y2Ba分别减少了。然而,这些相对丰度以上的微生物群在抗性品种J863显示相反的结果相比,BR处理与易感品种EJ-1 (gydF4y2Ba补充表S1gydF4y2Ba)。此外,的相对丰度gydF4y2BaRB41gydF4y2Ba,gydF4y2BaGemmatimonasgydF4y2Ba,gydF4y2BaPontibactergydF4y2Ba,gydF4y2Ba链霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaBlastococcusgydF4y2Ba,gydF4y2BaMassiliagydF4y2Ba和gydF4y2Ba芽孢杆菌gydF4y2Ba增加对不同品种在BR处理,而对吗gydF4y2BaMND1gydF4y2Ba,gydF4y2Ba硝化螺菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaBryobactergydF4y2Ba,gydF4y2BaIamiagydF4y2Ba,gydF4y2BaSteroidobactergydF4y2Ba,gydF4y2BaIlumatobactergydF4y2Ba和gydF4y2BaDongiagydF4y2Ba分别下降(gydF4y2Ba补充表S1gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
的真菌,子囊菌类,担子菌类和Mortierellomycota优势类群,土壤真菌群落的相对丰度在门水平没有显著影响BR治疗。在属级,gydF4y2Ba青霉菌gydF4y2Ba对桃叶枯病表现出良好的抑制增长促进(G.N.gydF4y2BaBelofsky et al ., 1998gydF4y2Ba;公元;gydF4y2Ba卡尔等人。,1990年gydF4y2Ba;答;gydF4y2Ba侯赛因et al ., 2007gydF4y2Ba)。在我们的研究中,的相对丰度gydF4y2BaCorynesporagydF4y2Ba,gydF4y2BaGibellulopsisgydF4y2Ba,gydF4y2Ba枝顶孢属gydF4y2Ba,gydF4y2Ba青霉菌gydF4y2Ba,gydF4y2Ba尾孢属gydF4y2Ba,gydF4y2Ba链格孢属gydF4y2Ba和gydF4y2BaBadarisamagydF4y2Ba在BR易感品种EJ-1增加治疗,而为gydF4y2Ba毛壳菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaMortierellagydF4y2Ba,gydF4y2BaPseudombrophilagydF4y2Ba,gydF4y2BaChaetomidiumgydF4y2Ba,gydF4y2BaPoaceascomagydF4y2Ba和gydF4y2BaCephaliophoragydF4y2Ba分别减少了。与易感品种EJ-1相比,这些微生物群的相对丰度高于抗病品种J863显示相反的结果在BR处理(gydF4y2Ba补充表S2gydF4y2Ba)。此外,的相对丰度gydF4y2Ba赤霉菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaPlectosphaerellagydF4y2Ba,gydF4y2BaNeocosmosporagydF4y2Ba,gydF4y2Ba曲霉属真菌gydF4y2Ba,gydF4y2BaPreussiagydF4y2Ba增加对不同品种在BR处理,而对吗gydF4y2Ba毛壳菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaSchizotheciumgydF4y2Ba,gydF4y2Ba柄孢壳菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaCephalotrichumgydF4y2Ba,gydF4y2BaCoprinellusgydF4y2Ba和gydF4y2BaPodosordariagydF4y2Ba分别下降(gydF4y2Ba补充表S2gydF4y2Ba)。这些结果大致符合基本事实,BR处理促进了土壤有益微生物的比例和抑制病原体的比例增加植物防御。类似的结果在最近的研究表明,微生物生物防治剂治疗促进有益微生物在土壤和抑制病原体(qgydF4y2Ba黄et al ., 2021gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba
微生物功能代谢基因的变化后BR的应用gydF4y2Ba
PICRUSt分析已经被用于研究细菌的功能,可以预测功能基因的存在与否及其丰度(L。gydF4y2Ba江et al ., 2016gydF4y2Ba;J;gydF4y2Ba罗et al ., 2017gydF4y2Ba)。一些研究表明,能量代谢可以提高抗香蕉枯萎病(N.V.D.gydF4y2BaBerg et al ., 2007gydF4y2Ba)。其他次生代谢产物的生物合成的函数可以对抗几个土传病原(L。gydF4y2Ba汉et al ., 2019gydF4y2Ba)。在我们的研究中,有一个显著提高能量代谢和生物合成的次生代谢物在BR的应用。PICRUSt也被用来预测关键基因的相对丰度C, N和gydF4y2BapgydF4y2Ba周期(H。gydF4y2Ba里贝罗et al ., 2018gydF4y2Ba;Y;gydF4y2Ba陈et al ., 2020gydF4y2Ba)。然而,由于使用的局限性16 S rRNA数据集和分类赋值方法,分类群注释和其功能不足,因此,进一步验证应该执行使用宏基因组,以更好地了解根际细菌群落的功能后BR在未来的应用研究。gydF4y2Ba
真菌官能团的组成变化推断FUNGuild表明,BR处理可能会影响营养模式(gydF4y2Ba图9gydF4y2Ba)。例如,pathotroph的营养模式由植物病原体和动物病原体,植物病原体易感品种的相对丰度EJ-1 BR处理高于CK处理,而相反的趋势是抗性品种J863观察。在目前的研究中,人口的gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba被qPCR减少BR处理分析。真菌群落的组成分析表明,BR处理能够同时增加的比例gydF4y2BaGibellulopsisgydF4y2Ba,gydF4y2BaPlectosphaerellagydF4y2Ba,gydF4y2Ba赤霉菌属gydF4y2Ba(gydF4y2BaFigure7BgydF4y2Ba)。gydF4y2BaPlectosphaerellagydF4y2Basp.是众所周知的几种植物的病原体引起果实,根和环腐病,(一个崩溃。gydF4y2Ba卡卢奇et al ., 2012gydF4y2Ba)。的属gydF4y2Ba赤霉菌属gydF4y2Ba可能会导致不同的植物病害在世界的热带和亚热带地区(C.S.吗gydF4y2Ba利马et al ., 2009gydF4y2Ba;W.G.DgydF4y2Ba费尔南多et al ., 1997gydF4y2Ba)。例如,芒果畸形病主要是由病原体引起的gydF4y2Ba藤仓赤霉gydF4y2Ba在巴西(C.S.物种复杂gydF4y2Ba利马et al ., 2009gydF4y2Ba)。symbiotroph营养模式,丛枝菌根真菌(AMF)可以形成共生关系,超过80%的陆生植物,提高根系的吸收能力,为植物生长提供营养(a。gydF4y2BaBerruti et al ., 2016gydF4y2Ba)。然而,在我们的研究中,AMF的相对丰度和体内寄生菌真菌显著低于CK处理,表明symbiotroph不是BR主要营养模式的治疗。的腐生生物营养模式,一些研究表明,腐生真菌扮演重要角色在分解有机质和养分循环和死亡或衰老的主要的分解者植物在土壤(Y。gydF4y2Ba陈et al ., 2020gydF4y2Ba;洛杉矶;gydF4y2Ba菲利普斯et al ., 2014gydF4y2Ba)。在这项研究中,未定义的腐生生物的相对丰度(39.72%)和植物腐生生物(0.66%)在品种EJ-1 BR处理是高于CK处理(13.44%,0.31%),而在品种J863观察到相反的倾向。真菌群落的组成分析表明,BR处理可以同时丰富gydF4y2BaSchizotheciumgydF4y2Ba,gydF4y2BaPreussiagydF4y2Ba在不同品种(gydF4y2BaFigure7BgydF4y2Ba)。由于FUNGuild分析基于现有文献和数据,分析真菌的功能有一定的局限性。因此,额外的深入研究对土壤真菌官能团也需要进一步研究根际真菌的功能社区在BR处理。gydF4y2Ba
根系分泌物可以作为信号分子,调节根际微生物的群落结构和功能(J。gydF4y2BaPanichikkal Krishnankutty, 2021gydF4y2Ba)。因此,可能的原因是,除了不同的品种的根系分泌物,BR改变了根系分泌物的比例,这可能导致不同的微生物群落被招募。因此,微生物群落在BR改变然后进入一个新的平衡治疗,这种变化的结果是BR处理和土著微生物之间的相互作用(qgydF4y2Ba黄et al ., 2021gydF4y2Ba;J;gydF4y2Ba辑et al ., 2013gydF4y2Ba)。此外,BR处理土著根际土壤微生物和植物之间的交互是复杂的,因为它可能会增加有益或抑制有害微生物。在我们的研究中,BR处理可以抑制植物病害和促进植物健康,而不应简单地归因于单个细菌分类单元,但很可能受到微生物协会,这是类似的结果中观察到的最近的研究(L。gydF4y2Ba施et al ., 2017gydF4y2Ba;硕士;gydF4y2BaCucu et al ., 2020gydF4y2Ba)。一些研究人员报道,直接应用潜在的有益微生物常常导致贫穷疾病抑制由于其较低的土壤中生存和殖民(T。gydF4y2Ba萨拉瓦南et al ., 2003gydF4y2Ba;B;gydF4y2BaLugtenberg Kamilova, 2009gydF4y2Ba)。因此,未来的研究将集中在收购的有益微生物,合成社区的建设和评价这些有益微生物的影响飞行联队的发病率。gydF4y2Ba
总之,飞行联队和人群的发病率gydF4y2Ba诉dahliaegydF4y2Ba不同棉花根际的抗性品种减少BR治疗。与此同时,部分植物生物量和棉花产量增加。细菌多样性在BR处理显著增加,但相反的倾向于真菌在不同抗性品种多样性。有显著差异的能力招募有益微生物在BR处理敏感和抗性品种之间。关键微生物的相对丰度变化,影响飞行联队在BR治疗。这些结果提供了重要的信息需要更好的理解在根际土壤微生物群落结构和功能BR治疗。未来潜在的有益的合成社区需要进一步探索控制飞行联队。gydF4y2Ba
数据可用性声明gydF4y2Ba
公开的数据集进行分析。原始序列数据都需要在国家生物技术信息中心(NCBI)加入数字PRJNA734729和PRJNA894483。gydF4y2Ba
作者的贡献gydF4y2Ba
点,路上为本研究提供了思路和实验设计;WZ、PW和LD进行和完成研究XZ的协助下,z, XL, SL,所有作者参与本文的终结和允许提交文章。gydF4y2Ba
资金gydF4y2Ba
这项研究受到了河北的关键研究和发展项目(22326509 d),中国农业研究系统的财政部和马拉(CARS-15-19),中国国家重点研发项目(2017 yfd0200601)和专项基金公共利益(201503109)的研究热点之一。gydF4y2Ba
的利益冲突gydF4y2Ba
作者声明,这项研究是在没有进行任何商业或财务关系可能被视为一个潜在的利益冲突。gydF4y2Ba
出版商的注意gydF4y2Ba
本文表达的所有索赔仅代表作者,不一定代表的附属组织,或出版商、编辑和审稿人。任何产品,可以评估在这篇文章中,或声称,可能是由其制造商,不保证或认可的出版商。gydF4y2Ba
补充材料gydF4y2Ba
本文的补充材料在网上可以找到:gydF4y2Bahttps://www.雷竞技rebatfrontiersin.org/articles/10.3389/fbioe.2023.1115656/full补充材料gydF4y2Ba
引用gydF4y2Ba
Adhikari, t . B。,约瑟夫,c . M。杨,G。,Phillips, D. A., and Nelson, L. M. (2001). Evaluation of bacteria isolated from rice for plant growth promotion and biological control of seedling disease of rice.可以。j . Microbiol。gydF4y2Ba47 (10),916 - 924。doi: 10.1139 / w01 - 097gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Akanmu, a . O。,B一个b一个lol一个,O. O., Venturi, V., Ayilara, M. S., Adeleke, B. S., Amoo, A. E., et al. (2021). Plant disease management: Leveraging on the plant-microbe-soil interface in the biorational use of organic amendments.前面。植物科学。gydF4y2Ba12日,700507年。doi: 10.3389 / fpls.2021.700507gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Akao,美国(2017年)。氮,磷,和抗氧化剂含量作物残留物为潜在的梯级利用。gydF4y2Ba废弃物生物质ValorigydF4y2Ba9 (9),1535 - 1542。doi: 10.1007 / s12649 - 017 - 9929 - 6gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Alstrom、美国(2001)。特征的细菌从油菜的生物电控制活动的关系gydF4y2Ba黄萎病dahliaegydF4y2Ba。gydF4y2Baj . Phytopathol。gydF4y2Ba149 (2),57 - 64。doi: 10.1046 / j.1439-0434.2001.00585.xgydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Atallah z K。,Maruthachalam, K., and Subbarao, K. V. (2012). Sources of黄萎病dahliaegydF4y2Ba影响生菜。gydF4y2Ba植物病理学gydF4y2Ba102 (11),1071 - 1078。doi: 10.1094 /发朵- 04 - 12 - 0067 - rgydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Azabou, m . C。Gharbi, Y。,Medhioub, I., Ennouri, K., Triki, M. A., Tounsi, S., et al. (2020). The endophytic strain芽孢杆菌velezensisgydF4y2Baoee1:一个有效的生物防治剂抗黄萎病的橄榄油和一个潜在的植物生长促进细菌。gydF4y2Ba医学杂志。控制gydF4y2Ba142年,104168年。doi: 10.1016 / j.biocontrol.2019.104168gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Belofsky g . N。,戴手套,k B。戴手套,j·B。,Wicklow, D. T., and Dowd, P. F. (1998). New p-terphenyl and olyketide metabolites from the sclerotia of青霉菌raistrickiigydF4y2Ba。gydF4y2Baj . Nat,刺激。gydF4y2Ba61 (9),1115 - 1119。doi: 10.1021 / np980188ogydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
弯曲,g D。,Lincoln, S. D. (1999). Characterisation of volatile sulphur-containing compounds produced during decomposition of芸苔属植物junceagydF4y2Ba组织在土壤中。gydF4y2Ba土壤生物。物化学。gydF4y2Ba31 (5),695 - 703。doi: 10.1016 / s0038 - 0717 (98) 00163 - 1gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
伯格:v D。,Berger,D。K。嗯,我。, Birch, P. R. J., Wingfield, M. J., and Viljoen, A. (2007). Tolerance in banana to Fusarium wilt is associated with early up-regulation of cell wall-strengthening genes in the roots.摩尔。植物病理学研究。gydF4y2Ba8 (3),333 - 341。doi: 10.1111 / j.1364-3703.2007.00389.xgydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Berruti,。,Lumini, E., Balestrini, R., and Bianciotto, V. (2016). Arbuscular mycorrhizal fungi as natural biofertilizers: let’s benefit from past successes.前面。Microbiol。gydF4y2Ba6、1559。doi: 10.3389 / fmicb.2015.01559gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Bulluck, l·R。Brosius, M。,Evanylo, G. K., and Ristaino, J. B. (2002). Organic and synthetic fertility amendments influence soil microbial, physical and chemical properties on organic and conventional farms.达成。土壤生态。gydF4y2Ba19 (2),147 - 160。doi: 10.1016 / s0929 - 1393 (01) 00187 - 1gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
卡尔,a D。,Sagasta, E. M., and Melgarejo, P. (1990). Biological control of peach twig blight (MonilinialaxagydF4y2Ba),gydF4y2Ba青霉菌frequentansgydF4y2Ba。gydF4y2Ba植物病理学研究。gydF4y2Ba39 (4),612 - 618。doi: 10.1111 / j.1365-3059.1990.tb02542.xgydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
卡卢奇、。,R一个我米ondo,M. L., Santos, J., and Phillips, A. J. L. (2012).PlectosphaerellagydF4y2Ba物种与根和衣领腐烂的园艺作物在意大利南部。gydF4y2BaPersooniagydF4y2Ba28 (1),34-48。doi: 10.3767 / 003158512 x638251gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
陈,d . L。,Wang, X. X., Carrión, V. J., Yin, S., Yue, Z. F., Liao, Y. W. K., et al. (2022). Acidic amelioration of soil amendments improves soil health by impacting rhizosphere microbial assemblies.土壤生物。物化学。gydF4y2Ba167年,108599年。doi: 10.1016 / j.soilbio.2022.108599gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
陈,Y。,Tian, W., Shao, Y., Li, Y. J., Lin, L. A., Zhang, Y. J., et al. (2020). Miscanthus cultivation shapes rhizosphere microbial community structure and function as assessed by Illumina MiSeq sequencing combined with PICRUSt and FUNGUIld analyses.拱门。Microbiol。gydF4y2Ba202 (5),1157 - 1171。doi: 10.1007 / s00203 - 020 - 01830 - 1gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Cucu, m·A。,Gilardi, G., Pugliese, M., Ferrocino, I., and Gullino, M. L. (2020). Effects of biocontrol agents and compost against the疫霉capsicigydF4y2Ba西葫芦和对根际微生物群的影响。gydF4y2Ba达成。土壤生态。gydF4y2Ba154年,103659年。doi: 10.1016 / j.apsoil.2020.103659gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
戴维斯,j . R。,Huisman, O. C., Everson, D. O., Nolte, P., Sorenson, L. H., and Schneider, A. T. (2010). The suppression of verticillium wilt of potato using corn as a green manure crop.点。j .锅,Res。gydF4y2Ba87 (2),195 - 208。doi: 10.1007 / s12230 - 010 - 9126 - 7gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Diaz-Perez, j . C。Phatak, s . C。Ruberson, J。,Morse, R. (2012). Mulches increase yield and improve weed control in no-till organic broccoli (芸苔属植物oleraceagydF4y2Bavar。gydF4y2Ba葡萄孢属gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba学报。Hortic。gydF4y2Ba933年,337 - 342。doi: 10.17660 / ActaHortic.2012.933.43gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
曾,T。,Jacquiod, S., Nour, E., Sørensen, S., and Smalla, K. (2020). Biocontrol of bacterial wilt disease through complex interaction between tomato plant, antagonists, the indigenous rhizosphere microbiota, andRalstonia solanacearumgydF4y2Ba。gydF4y2Ba前面。Microbiol。gydF4y2Ba10日,2835年。doi: 10.3389 / fmicb.2019.02835gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
恩雅,J。,Shinohara, H., Yoshida, S., Tsukiboshi, T., Negishi, H., Suyama, K., et al. (2007). Culturable leaf-associated bacteria on tomato plants and their potential as biological control agents.活细胞。生态。gydF4y2Ba53 (4),524 - 536。doi: 10.1007 / s00248 - 006 - 9085 - 1gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
风扇,f . L。阴,C。,Tang, Y. J., Li, Z. J., Song, A. L., Wakelin, S. A., et al. (2014). Probing potential microbial coupling of carbon and nitrogen cycling during decomposition of maize residue by13gydF4y2BaC-DNA-SIP。gydF4y2Ba土壤生物。物化学。gydF4y2Ba70年,12-21。doi: 10.1016 / j.soilbio.2013.12.002gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
冯,y . X。,胡锦涛,Y Y。吴,j·S。,Chen, J. H., Yrjälä, K., and Yu, W. W. (2019). Change in microbial communities, soil enzyme and metabolic activity in a香榧gydF4y2Ba种植园烂根病疾病的反应。gydF4y2Ba对。生态。等内容。gydF4y2Ba432年,932 - 941。doi: 10.1016 / j.foreco.2018.10.028gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
费尔南多,w·g·D。Paulitz, t . C。水手,w . L。Dutilleul, P。,Miller, J. D. (1997). Head blight gradients caused by赤霉菌属菌gydF4y2Ba地区来源的培养液麦田的情节。gydF4y2Ba植物病理学gydF4y2Ba87 (4),414 - 421。doi: 10.1094 / phyto.1997.87.4.414gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
弗拉,e . F。,Thomma, B. P. H. J. (2006). Physiology and molecular aspects of verticillium wilt diseases caused by诉dahliaegydF4y2Ba和gydF4y2Ba诉alboatrumgydF4y2Ba。gydF4y2Ba摩尔。植物病理学研究。gydF4y2Ba7,71 - 86。doi: 10.1111 / j.1364-3703.2006.00323.xgydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Gamliel,。,Austerweil, M., and Kritzman, G. (2000). Non-chemical approach to soilborne pest management – organic amendments.作物保护。gydF4y2Ba19日(8 - 10),847 - 853。doi: 10.1016 / s0261 - 2194 (00) 00112 - 5gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Garbeva, P。,Van Veen, J. A., and Van Elsas, J. D. (2004). Microbial diversity in soil: Selection of microbial populations by plant and soil type and implications for disease suppressiveness.为基础。启Phytopathol。gydF4y2Ba42 (1),243 - 270。doi: 10.1146 / annurev.phyto.42.012604.135455gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Hahm, m . S。,Son, J. S., Kim, B. S., and Ghim, S. Y. (2016). Comparative study of rhizobacterial communities in pepper greenhouses and examination of the effects of salt accumulation under different cropping systems.拱门。Microbiol。gydF4y2Ba199 (2),303 - 315。doi: 10.1007 / s00203 - 016 - 1304 - 7gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
汉族,L。,Wang, Z., Li, N., Wang, Y., Feng, J., and Zhang, X. (2019).芽孢杆菌amyloliquefaciensgydF4y2BaB1408抑制黄瓜枯萎病的调控根际微生物群落。gydF4y2Ba达成。土壤生态。gydF4y2Ba136年,55 - 66。doi: 10.1016 / j.apsoil.2018.12.011gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
侯赛因,M . M。Sultana F。日本久保田公司,M。小山,H。,Hyakumachi, M. (2007). The plant growth-promoting fungus青霉菌simplicissimumgydF4y2BaGP17-2诱导阻力gydF4y2Ba拟南芥gydF4y2Ba通过激活多个防御信号。gydF4y2Ba植物细胞。杂志gydF4y2Ba48 (12),1724 - 1736。doi: 10.1093 /卡式肺囊虫肺炎/ pcm144gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
黄,z Q。刘,b . W。阴,Y。,Liang, F., Xie, D. S., Han, T. T., et al. (2021). Impact of biocontrol microbes on soil microbial diversity in ginger (生姜gydF4y2Ba罗斯科)。gydF4y2Ba害虫等。科学。gydF4y2Ba77年,5537 - 5546。doi: 10.1002 / ps.6595gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
池田K。,B一个nno,S., Furusawa, A., Shibata, S., Nakaho, K., and Fujimura, M. (2015). Crop rotation with broccoli suppresses Verticillium wilt of eggplant.j .将军植物病理学研究。gydF4y2Ba81 (1),77 - 82。doi: 10.1007 / s10327 - 014 - 0559 - 6gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Inderbitzin, P。病房,J。,B一个rbell一个,A., Solares, N., Izyumin, D., Burman, P., et al. (2018). Soil microbiomes associated with Verticillium wilt-suppressive broccoli and chitin amendments are enriched with potential biocontrol agents.植物病理学gydF4y2Ba108 (1),31-43。doi: 10.1094 /发朵- 07 - 17 - 0242 rgydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
江,L。,Song, M., Yang, L., Zhang, D., Sun, Y., Shen, Z., et al. (2016). Exploring the influence of environmental factors on bacterial communities within the rhizosphere of the Cu-tolerant plant, elsholtzia splendens.香Splendens。科学。代表。gydF4y2Ba6 (1),36302。doi: 10.1038 / srep36302gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
约翰逊,d。,Dung,J. K. S. (2010). Verticillium wilt of potato-the pathogen, disease and management.可以。j .植物病理学研究。gydF4y2Ba32 (1),58 - 67。doi: 10.1080 / 07060661003621134gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
印度。,B一个年代u,A., Ahmad, I., Sayyed, R. Z., El-Enshasy, H. A., Dailin, D. J., et al. (2020). Recent understanding of soil acidobacteria and their ecological significance: A critical review.前面。Microbiol。gydF4y2Ba11日,580024年。doi: 10.3389 / fmicb.2020.580024gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Khodadad, c·l·M。齐默尔曼,a。R。、绿色、美国J。、Uthandi年代。,Foster, J. S. (2011). Taxa-specific changes in soil microbial community composition induced by pyrogenic carbon amendments.土壤生物。物化学。gydF4y2Ba43 (2),385 - 392。doi: 10.1016 / j.soilbio.2010.11.005gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Klosterman, s . J。Atallah z, K。Vallad, g . E。,苏巴拉奥,k V。(2009). Diversity, pathogenicity, and management of verticillium species.为基础。启Phytopathol。gydF4y2Ba47 (1),39 - 62。doi: 10.1146 / annurev -发朵- 080508 - 081748gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
李,c . H。,Feng, Z. L., Li, Z. F., Zhang, Z. G., Shi, Y. Q., Zhao, L. H., et al. (2015).在体外gydF4y2Ba的敏感性gydF4y2Ba黄萎病dahliaegydF4y2BaKleb菌株对一些有效的杀菌剂。gydF4y2Ba中国棉花gydF4y2Ba42 (8),16 - 17。doi: 10.11963 / issn.1000 - 632 x.201508006gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
李,美国Z。,妈,P。,Gao, S. G., Liu, X. Z., and Liu, G. (2005). Evaluation of biocontrol potential of a bacterial strain NCD-2 against cotton verticillium wilt in field trials.Acta Phytopathol。罪。gydF4y2Ba35 (5),451 - 455。gydF4y2Ba
利马,c . S。,Pfenn我ng,L. H., Costa, S. S., Campos, M. A., and Leslie, J. F. (2009). A new Fusarium lineage within the藤仓赤霉gydF4y2Ba种复杂的主要因果代理在巴西芒果畸形病。gydF4y2Ba植物病理学研究。gydF4y2Ba33-42 58 (1)。doi: 10.1111 / j.1365-3059.2008.01946.xgydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
刘,Z。,Tang, J., Ren, X., and Schaeffer, S. M. (2021). Effects of phosphorus modified nzvi-biochar composite on emission of greenhouse gases and changes of microbial community in soil.环绕。Pollut。gydF4y2Ba274年,116483年。doi: 10.1016 / j.envpol.2021.116483gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Lopez-Perez, j . A。Roubtsova, T。,Ploeg,A. (2005). Effect of three plant residues and chicken manure used as biofumigants at three temperatures on有隐姓埋名的女人gydF4y2Ba侵扰的番茄温室实验。gydF4y2Baj . Nematol。gydF4y2Ba37 (4),489 - 494。gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
陆,R。,Li, Y. P., Li, W. X., Xie, Z. S., Fan, C. L., Liu, P. X., et al. (2018). Bacterial community structure in atmospheric particulate matters of different sizes during the haze days in xi'an, China.科学。总环境。gydF4y2Ba637 - 638,244 - 252。doi: 10.1016 / j.scitotenv.2018.05.006gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Lugtenberg B。,K一个米我lova, F. (2009). Plant-growth-promoting rhizobacteria.为基础。启Microbiol。gydF4y2Ba63年,541 - 556。doi: 10.1146 / annurev.micro.62.081307.162918gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
罗,J。,Tao, Q., Wu, K., Li, J., Qian, J., Liang, Y., et al. (2017). Structural and functional variability in root-associated bacterial microbiomes of Cd/Zn hyperaccumulator景天属植物alfrediigydF4y2Ba。gydF4y2Ba达成。Microbiol。Biotechnol。gydF4y2Ba101 (21)7961 - 7976。doi: 10.1007 / s00253 - 017 - 8469 - 0gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
迈耶,m·A。,Lopez-Guerrero, M. G., Guo, M., Schmer, M. R., Herr, J. R., Schnable, J. C., et al. (2021). Rhizosphere microbiomes in a historical maize/soybean rotation system respond to host species and nitrogen fertilization at genus and sub-genus levels.达成。环绕。活细胞。gydF4y2Ba87年,031322 - e3220。doi: 10.1101 / 2020.08.10.244384gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Panichikkal, J。,Kr我年代hnankutty, R. E. (2021). Root exudate components induced formation of plant beneficial metabolites by rhizospheric假单胞菌gydF4y2Baspp。gydF4y2Ba根际gydF4y2Ba19日,100366年。doi: 10.1016 / j.rhisph.2021.100366gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
菲利普斯·l·A。病房,V。,Jones, M. D. (2014). Ectomycorrhizal fungi contribute to soil organic matter cycling in sub-boreal forests.ISME J。gydF4y2Ba8 (3),699 - 713。doi: 10.1038 / ismej.2013.195gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
保尔森,p . h . B。Al-Soud, w。Bergmark, L。马吉德,J。,Hansen, L. H., and Sørensen, S. J. (2013). Effects of fertilization with urban and agricultural organic wastes in a field trial Prokaryotic diversity investigated by pyrosequencing.土壤生物。物化学。gydF4y2Ba57岁,784 - 793。doi: 10.1016 / j.soilbio.2011.12.023gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Poveda, J。,Gómez, N. M., Fenoll, C., and Escobar, C. (2021). The use of biochar for plant-pathogen control.植物病理学gydF4y2Ba111 (9),1490 - 1499。doi: 10.1094 /发朵- 06 - 20 - 0248 rvwgydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
拉赫曼,L。,Su, X. F., Li, X. K., Qi, X. L., Guo, H. M., and Cheng, H. M. (2018).FreBgydF4y2Ba参与的铁代谢和多个pathogenicity-related特质gydF4y2Ba黄萎病dahliaegydF4y2Ba。gydF4y2Ba咕咕叫。麝猫。gydF4y2Ba64年,645 - 659。doi: 10.1007 / s00294 - 017 - 0780 - xgydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
里贝罗,H。,DeSousa, T., Santos, J. P., Sousa, A. G. G., Teixeira, C., Monteiro, M. R., et al. (2018). Potential of dissimilatory nitrate reduction pathways in polycyclic aromatic hydrocarbon degradation.光化层gydF4y2Ba199年,54 - 67。doi: 10.1016 / j.chemosphere.2018.01.171gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Rodriguez-Berbel, N。索里亚时,R。,Ortega, R., Lucas-Borja, M. E., and Miralles, I. (2022). Benefits of applying organic amendments from recycled wastes for fungal community growth in restored soils of a limestone quarry in a semiarid environment.科学。总环境。gydF4y2Ba806年,151226年。doi: 10.1016 / j.scitotenv.2021.151226gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
萨拉瓦南,T。,Muthusamy, M., and Marimuthu, T. (2003). Development of integrated approach to manage the fusarial wilt of banana.作物保护。gydF4y2Ba22 (9),1117 - 1123。doi: 10.1016 / s0261 - 2194 (03) 00146 - 7gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
沈,Z Z。,Wang, D. S., Ruan, Y. Z., Xue, C., Zhang, J., Li, R., et al. (2014). Deep 16S rRNA pyrosequencing reveals a bacterial community associated with banana Fusarium wilt disease suppression induced by bio-organic fertilizer application.《公共科学图书馆•综合》gydF4y2Ba9 (5),e98420。doi: 10.1371 / journal.pone.0098420gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
沈,Z Z。,Zhong, S. T., Wang, Y. G., Wang, B. B., Mei, X. L., Li, R., et al. (2013). Induced soil microbial suppression of banana fusarium wilt disease using compost and biofertilizers to improve yield and quality.欧元。j .土壤生物。gydF4y2Ba57岁,1 - 8。doi: 10.1016 / j.ejsobi.2013.03.006gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
施,L。,Du,N。蜀,S。,太阳,J。李,S。,Guo, S. (2017).Paenibacillus polymyxagydF4y2BaNSY50抑制黄瓜枯萎病的调控根际的微生物群落。gydF4y2Ba科学。代表。gydF4y2Ba7 (1),41234。doi: 10.1038 / srep41234gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Stringlis, i。Yu, K。,Feussner, K., de Jonge, R., Van Bentum, S., Van Verk, M. C., et al. (2018). MYB72-dependent coumarin exudation shapes root microbiome assembly to promote plant health.Proc。国家的。学会科学。gydF4y2Ba115 (22),E5213-E5222。doi: 10.1073 / pnas.1722335115gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
苏巴拉奥,k V。,Hubbard, J. C., and Koike, S. T. (1999). Evaluation of broccoli residue incorporation into field soil for verticillium wilt control in cauliflower.工厂说。gydF4y2Ba83 (2),124 - 129。doi: 10.1094 / pdis.1999.83.2.124gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
辑,J。,Alsanius, B. W., Krüger, E., Reineke, A., Strohmeier, S., and Wohanka, W. (2013). Leaf microbiota of strawberries as affected by biological control agents.植物病理学gydF4y2Ba103 (10)1001 - 1011。doi: 10.1094 /发朵- 01 - 13 - 0014 - rgydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
泰勒,r . J。,P一个年代che, J. S., and Gudmestad, N. C. (2005). Influence of tillage and method of metam sodium application on distribution and survival of黄萎病dahliaegydF4y2Ba在土壤和黄萎病的马铃薯的发展。gydF4y2Ba点。j .锅,Res。gydF4y2Ba82年,451 - 461。doi: 10.1007 / bf02872223gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
Uppal, a K。,El Hadrami, A., Adam, L. R., Tenuta, M., and Daayf, F. (2008). Biological control of potato verticillium wilt under controlled and field conditions using selected bacterial antagonists and plant extracts.医学杂志。控制gydF4y2Ba44 (1),90 - 100。doi: 10.1016 / j.biocontrol.2007.10.020gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
惠勒,d . L。,约翰逊,d。(2016).黄萎病dahliaegydF4y2Ba感染,改变植物生物量,并产生旋转作物接种体。gydF4y2Ba植物病理学gydF4y2Ba106 (6),602 - 613。doi: 10.1094 /发朵- 07 - 15 - 0174 rgydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
韦根,b E。,K我nkel, L. L. (2005). Green manures and crop sequences influence potato diseases and pathogen inhibitory activity of indigenous Streptomycetes.植物病理学gydF4y2Ba95 (2),178 - 185。doi: 10.1094 /发朵- 95 - 0178gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
肖,y . H。,Liu, X. D., Meng, D. L., Tao, J. M., Gu, Y. B., Yin, H. Q., et al. (2018). The role of soil bacterial community during winter fallow period in the incidence of tobacco bacterial wilt disease.达成。Microbiol。Biotechnol。gydF4y2Ba102年,2399 - 2412。doi: 10.1007 / s00253 - 018 - 8757 - 3gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
兴,W。,Wang, Y., Hao, T. Y., He, Z. L., Jia, F. X., and Yao, H. (2019). pH control and microbial community analysis with HCl or CO2gydF4y2Ba除了在HgydF4y2Ba2gydF4y2Ba的自养脱氮。gydF4y2Ba水Res。gydF4y2Ba168年,115200年。doi: 10.1016 / j.watres.2019.115200gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
徐,x M。,Salama, N., Jeffries, P., and Jeger, M. J. (2010). Numerical studies of biocontrol efficacies of foliar plant pathogens in relation to the characteristics of a biocontrol agent.植物病理学gydF4y2Ba100 (8),814 - 821。doi: 10.1094 /发朵- 100 - 8 - 0814gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
阴,c . T。,Hulbert, S. H., SchroederMavrodi, K. L. O., Mavrodi, D., and Dhingra, A. (2013). Role of bacterial communities in the natural suppression of rhizoctonia solani bare patch disease of wheat (小麦gydF4y2Bal .)。gydF4y2Ba达成。环绕。活细胞。gydF4y2Ba79 (23),7428 - 7438。doi: 10.1128 / AEM.01610-13gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
元,x F。、香港年代。,Xiong, W., Raza, W., Shen, Z. Z., Wang, B. B., et al. (2021). Development of fungal-mediated soil suppressiveness against Fusarium wilt disease via plant residue manipulation.微生物组gydF4y2Ba9 (1),200。doi: 10.1186 / s40168 - 021 - 01133 - 7gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
张,c F。林,z L。,X, y。Fallah, N。塔亚布,M。李,s Y。,et一个l。(2021). Straw retention efficiently improves fungal communities and functions in the fallow ecosystem.BMC Microbiol。gydF4y2Ba21日,52岁。doi: 10.1186 / s12866 - 021 - 02115 - 3gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
张,j . Y。刘,y . X。张,N。,胡锦涛,B。,Jin, T., Xu, H. R., et al. (2019). NRT1.1B is associated with root microbiota composition and nitrogen use in field-grown rice.生物科技Nat。》。gydF4y2Ba37 (6),676 - 684。doi: 10.1038 / s41587 - 019 - 0104 - 4gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
张,y L。李,z . F。,Feng, Z. L., Feng, H. J., Shi, Y. Q., Zhao, L. H., et al. (2016). Functional analysis of the pathogenicity-related gene VdPR1 in the vascular wilt fungus黄萎病dahliaegydF4y2Ba。gydF4y2Ba《公共科学图书馆•综合》gydF4y2Ba11 (11),e0166000。doi: 10.1371 / journal.pone.0166000gydF4y2Ba
《公共医学图书馆摘要》gydF4y2Ba|gydF4y2BaCrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
赵,w·S。,Guo, Q. G., Li, S. Z., Wang, P. P., Dong, L. H., Su, Z. H., et al. (2021). Effects of枯草芽孢杆菌gydF4y2BaNCD-2土豆和西兰花残留回报黄萎病和土壤真菌群落结构。gydF4y2Ba医学杂志。控制gydF4y2Ba159年,104628年。doi: 10.1016 / j.biocontrol.2021.104628gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
赵,w·S。,Guo, Q. G., Li, S. Z., Wang, P. P., Lu, X. Y., Su, Z. H., et al. (2020). Effect of wilt-resistant and wilt-susceptible cotton on soil bacterial community structure at flowering and boll stage.科学。阿格利司。罪。gydF4y2Ba53 (5),942 - 954。doi: 10.3864 / j.issn.0578-1752.2020.05.007gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
赵,w·S。,Guo, Q. G., Li, S. Z., Wang, Y. J., Lu, X. Y., Wang, P. P., et al. (2019). Control efficacy of broccoli residues on cotton verticillium wilt and its effect on soil bacterial community at different growth stages.科学。阿格利司。罪。gydF4y2Ba52 (24),4505 - 4517。doi: 10.3864 / j.issn.0578-1752.2019.24.006gydF4y2Ba
CrossRef全文gydF4y2Ba|gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba
关键词:gydF4y2Baspring-sowing-cotton,黄萎病,西兰花残留,微生物群落结构、功能,根际gydF4y2Ba
引用:gydF4y2Ba李董王赵W, P, L,年代,陆X, X, Z,郭马Q和P(2023)的影响将西兰花残留在土壤发生黄萎病spring-sowing-cotton以及根际微生物群落结构和功能。gydF4y2Ba前面。Bioeng。Biotechnol。gydF4y2Ba11:1115656。doi: 10.3389 / fbioe.2023.1115656gydF4y2Ba
收到:gydF4y2Ba2022年12月04;gydF4y2Ba接受:gydF4y2Ba2023年1月12日;gydF4y2Ba
发表:gydF4y2Ba2023年1月24日。gydF4y2Ba
编辑:gydF4y2Ba
Mengcen王gydF4y2Ba浙江大学,中国gydF4y2Ba审核:gydF4y2Ba
现任苏gydF4y2Ba中国生物技术研究所(CAAS)gydF4y2BaZunji史gydF4y2Ba兰州大学,中国gydF4y2Ba
张非政府组织gydF4y2Ba、棉花研究所(CAAS),中国gydF4y2Ba
版权gydF4y2Ba©2023赵、王董、李,张苏,郭和马。这是一个开放分布式根据文章gydF4y2Ba知识共享归属许可(CC)。gydF4y2Ba使用、分发或复制在其他论坛是允许的,提供了原始作者(年代)和著作权人(s)认为,最初发表在这个期刊引用,按照公认的学术实践。没有使用、分发或复制是不符合这些条件的允许。gydF4y2Ba
*通信:gydF4y2Ba轻钢郭、gydF4y2Bagqg77@163.comgydF4y2Ba;萍,gydF4y2Bapingma88@126.comgydF4y2Ba