政策与出版伦理
雷竞技rebat前沿的政策
开放获取和版权
从201雷竞技rebat2年7月起的所有前沿文章都在创作共用协议下开放获取CC-BY许可证(当前版本为CC-BY,版本4.0)。这意味着作者保留版权,但内容可以免费下载、分发和改编用于商业或非商业目的,只要适当地归属于原始文章。
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作者的贡献
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AB、CZD和EF为研究的概念和设计做出了贡献。AB组织数据库。CYD进行统计分析。EF撰写了初稿。GH, IJ, AB和EF撰写了手稿的部分内容。所有作者都参与了手稿修改、阅读并批准了提交的版本。”
相应的作者
通讯作者在投稿过程中、同行评议期间和发表期间,主要负责与期刊和编辑部的沟通。通讯作者还负责确保投稿符合所有期刊要求,包括但不限于作者身份细节、研究伦理和伦理批准、临床试验注册文件和利益冲突声明。通讯作者也应该在出版后可以回应任何质疑或批评。
投稿后如需修改作者名单,请使用作者变更表格.
研究完整性:如何重用文本
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原创内容和复制出版物
雷竞技rebatFrontiers只发布原创内容。作者确认提交的原创内容条款和条件在提交。提交给《前沿》的手稿必须全部或部分以前没有在其他地雷竞技rebat方发表过或正在考虑在其他地方发表。如果一篇文章之前已经提交到其他地方发表,只有当文章在提交给Frontiers时被其他出版商明确拒绝时,Frontiers才会考虑发表。雷竞技rebat
捏造和伪造
雷竞技rebatFrontiers既反对伪造数据或图像(即伪造或编造数据),也反对伪造数据或图像(即故意虚假陈述或欺骗性操纵数据)。
冗余的出版
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剽窃
当作者试图将以前发表的作品作为原创内容呈现时,就会发生抄袭。提交给《前沿》的每一篇稿件都由iThenticate提供支持雷竞技rebat的CrossCheck软件筛选文本重叠。被发现含有文本重叠的手稿不被《前沿》杂志考虑发表。雷竞技rebat有关抄袭的更多细节,请参阅下面的“抄袭和复制”。
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抄袭和复制
雷竞技rebat《前沿》会检查所有提交的稿件是否存在抄袭和复制,只发表原创内容。那些被证明存在抄袭或复制的手稿将不会被考虑在《前沿》期刊上发表。雷竞技rebat所有提交的内容必须包含以前没有发表过的内容。按照应对指南在美国,我们希望“直接从其他研究人员的出版物中提取的原始措辞应该出现在引号中,并附有适当的引用。”这种情况也适用于作者自己的作品。
论文与论文
雷竞技rebat《前沿》允许收录作者论文中首次出现的内容,只要这是作者论文中唯一出现的形式,符合作者所在大学的政策,并且可以在线访问。如果论文没有在线存档,则被视为原始的未发表数据,并受某些文章类型的未发表数据限制。包括论文或学位论文的材料应在手稿的致谢部分注明而且在参考书目中相应引用。有关一些例子,请检查我们的“参考资料”部分作者指导方针.
会议、论文集和摘要
第一次以会议论文形式出现的手稿如果要被认为是原创作品,就必须加以扩充。作者需要以新的原始材料(实验、数据)或对旧数据集的新处理的形式添加大量的原始内容,从而导致原始的讨论和/或结论,提供显著超过原始会议版本的价值。根据经验,至少30%的内容必须是原创的。提交此类作品的作者必须:
如已发表的会议论文并非作者的版权,请寻求作者的许可
在致谢部分引用会议,如果适用,也可以在参考文献部分引用。
雷竞技公司博客
虽然允许,但之前出现在非学术媒体(如博客)上的扩展稿件内容应在投稿时在稿件的致谢部分声明。雷竞技公司
预印本
我们的支持性预印本政策鼓励在研究论文的所有阶段完全开放获取,以共享和生成研究人员支持其工作所需的知识。在《前沿》期刊上发表文章的作者可以在提交给同雷竞技rebat行评雷竞技电竞体育竞猜平台议期刊之前,以及在《前沿》的评审过程中,在存储库或预印本服务器(如arXiv、PeerJ Preprints、OSF等)上分享他们的作品,前提是服务器对作者的完全版权和重复使用权不施加限制。另外请注意,在评审过程中,投稿给《前沿》期刊后共享的任何手稿文件都不能包含《前沿》的标志或品牌。雷竞技rebat雷竞技电竞体育竞猜平台
在提交稿件时,必须在存储库或预印本服务器中正确地注明原始来源,如果在审查过程中进行沉积,则必须在重新提交稿件时添加。我们要求预印本既列在确认部分,也包括在参考文献列表中的完整引用。
如果文章已经发表,强烈鼓励作者从预印本服务器链接到Frontiers出版物,以便读者找到、访问和引用最终的同行评审版本。雷竞技rebat请注意,我们不能考虑在科学期刊、书籍或类似实体中已经出版或正在审查的内容。
翻译
我们接受手稿提交,是准确翻译以前发表的工作。这一点在投稿时应在稿件中明确说明。需要寻求原始出版商和作者的许可,并在手稿中说明。相关文件应作为补充材料,供编辑和编辑部核实。翻译稿件的原文应注明出处。
例如:“这是[原文标题]的[语言]语言翻译/重印,最初发表在[出版物名称]。[姓名]在[资助来源(如有)的支持下编写了本翻译。[NAME]同意了。”
请注意,如果对重叠或可能的冗余有任雷竞技rebat何担忧,Frontiers可能会要求相关出版物的副本。
名称更改策略
名字和代词的变化有很多原因,包括但不限于婚姻状况、宗教信仰和性别认同。如需更改名称或代名词,请填写名称更改申请表格然后发邮件到research.integrity@雷竞技rebatfrontiersin.org.请确保您的请求包括以下信息:
更改名称的原因
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你作为作者、编辑和/或审稿人的角色
你的前沿出版物清单,和/或前沿雷竞技rebat编辑/审稿任务
偏好此更新是沉默的,还是通过一个勘误表(参见下面的更多信息)。
一旦您的表格收到并确认更改,您以前的出版物和/或编辑和审查任务将被更新,以反映您的新名称/代词。
根据您的喜好,我们将“无声地”更新您的姓名/代词,即不要求发表新文章或更正,或通过更正的方式。如果你选择这样做,你可以自由地通知你的合著者;雷竞技rebat边疆将只通知通讯作者任何无声的名称或代词更新。
无声和非无声更新也将通知PMC、PubMed和CrossRef,但前线不负责第三方数据库的更新,第三方数据库可能有自己的政策。雷竞技rebat提出请求的作者承担与期刊和编辑部沟通的主要责任。这是作者的责任,以确保他们的循环配置文件更新。
修正
雷竞技rebat《前沿》杂志承认我们有责任纠正以前发表的文章中与科学相关的错误。如有下列情况,可提交更正:
一份可靠的出版物的一小部分被证明是误导性的或
图中有一个错误,但不会改变结论或
统计数据中有错误,但不改变结论或
有标签错误的数字或
提供了错误的显微镜玻片OR
作者/贡献者列表是不正确的,当一个值得的作者被省略或某人不符合作者标准被包括在内。
更正必须通过我们的提交系统(检查我们的帮助中心有关如何提交更正的详细说明),建议使用这些Word和LaTeX模板.对实地陈述的贡献应用于清楚地说明更正的原因,提交的标题应采用以下格式:“勘误表:[原文标题]。”
如果错误是在出版过程中出现的,应联系Frontiers生产办公室。雷竞技rebat
撤稿
出版道德委员会委员(应对),在雷竞技rebat可能撤回的情况下,Frontiers会遵守他们的指导方针和建议。
雷竞技rebat《前沿》还遵循COPE建议的其他两个关键原则:
撤回论文不是为了惩罚作者
撤回声明应该是公开的,并与原撤回文章链接。
所有潜在的撤稿将根据其本身的价值进行判断,并将进行内部调查,或者在令人满意的情况下,由作者的机构调查提出建议。雷竞技rebat《前沿》杂志认为以下原因是引起关注和可能撤回的原因:
明确的证据表明发现是不可靠的,无论是由于不当行为(如数据伪造)还是诚实的错误(如错误计算或实验错误)
研究结果之前在其他地方发表,没有适当的归属、许可或理由(即重复发表的情况)
主要的剽窃
报道不道德的研究,发表一篇没有得到伦理委员会批准的文章
与文章内容有关的法律问题,如诽谤内容
主要作者身份问题,如已证实或强烈怀疑的代笔或出售(“礼物”)作者身份
有政治动机的文章,其中客观性是一个严重的问题
攻击:挑出个人或组织进行攻击
信仰问题(如智能设计论)
在没有科学或统计证据的情况下,发表了非凡主张的文章(如伪科学)。
如果读者希望引起编辑对可能需要撤回的已发表作品的注意,请联系文章的作者并写信给期刊,确保包括与作者的所有通信副本。
请参阅我们的评论和投诉政策的详情在这里.
伦理问题
如有任何道德问题,请联络我们research.integrity@雷竞技rebatfrontiersin.org.
领土描述、地图和附属关系
雷竞技rebat边疆媒体SA对出版的领土描述、地图和作者关系保持中立。所有领土主张仅代表作者,并不代表他们的附属机构、出版商、编辑或审稿人。
编辑政策
利益冲突
利益冲突可以是任何可能干扰或可能被视为干扰全面客观的同行评审、决策或提交给Frontiers的文章的发表。雷竞技rebat个人的、财务的和职业的从属关系或关系可以被视为利益冲突。
所有作者和《前沿》编委会成员在投稿或接受编辑或审查任务雷竞技rebat时,都必须披露任何实际和潜在的利益冲突。
前沿审稿雷竞技rebat系统旨在保证最透明和客观的编辑和审稿过程,由于处理编辑和审稿人的姓名在文章发表时被公开,利益冲突将广泛显现。
没有申报竞争利益可能导致稿件被拒。如果在出版后发现未披露的竞争利益,Frontiers将根据内部政策和出版伦理委员会的指导方针采取行动。雷竞技rebat
任何可能被视为潜在利益冲突的内容都应该在提交报表部分中披露。利益冲突声明将自动生成,包含在生成的PDF文件中以供同行评审,并包含在文章的最终出版版本中。
我应该透露什么?
作为作者,应在提交过程中披露任何潜在的利益冲突。考虑以下问题,确保你给出了积极的答案。
您或您的机构是否在任何时候因提交的工作的任何方面而收到第三方的付款或服务? |
你是否与可以被认为影响或表面上可能影响你在提交的作品中所写内容的实体有财务关系? |
您是否拥有任何与研究相关的专利和版权,无论是未决的、已发布的、许可的和/或收取的版税? |
你是否有其他关系或活动让读者觉得影响了你提交的作品,或者看起来有潜在的影响? |
如果您在投稿过程中未能披露潜在的利益冲突,或有任何疑问,请联系前沿编辑部雷竞技rebateditorial.office@雷竞技rebatfrontiersin.org尽快与潜在冲突的细节进行沟通。
对于商业关系,所有作者都必须说明。我们建议使用以下模板:
[作者姓名]曾受雇于[公司]。其余作者声明,这项研究是在没有任何商业或财务关系的情况下进行的,这些关系可能被解释为潜在的利益冲突。
对于商业融资,必须声明出资人的角色。我们建议以下声明:
作者声明,本研究获得了[资助者姓名]的资助。资助者参与了以下研究:[参与描述]
作者声明,本研究获得了来自[资助者姓名]的 资助 。资助者没有参与研究设计、数据收集、分析、解释,也没有参与这篇文章的写作或发表的决定。
编辑和审稿人呢?
在接受任何编辑或评审任务之前,处理编辑和审稿人将被要求考虑以下潜在的利益冲突。
家庭
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作者中是否有配偶或重要的人,同一家庭的成员,或非常亲密的私人朋友?
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评论编辑也不应该是处理编辑同一家族的成员。 |
合作
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在过去两年内,您是否正在主持或曾经与任何作者共同主持前沿研究课题?雷竞技rebat
-
在过去的两年内,您是否正在与作者合作或在研究项目或出版物上合作过?
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在过去的5年里,您是否以顾问或其他直接监督的身份与任何作者合作过?
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在过去的5年里,你作为学生或以其他直接下属的身份与任何作者合作过吗?
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注意:如果审稿编辑与处理审稿的编辑有密切的专业关系,他们就不应该接受任务,他们认为这会影响审稿的客观性。 |
联系
|
你和其他作者隶属于同一家机构吗?如果是,这是否导致了与作者的互动、合作或共同利益,从而影响了您在进行审查时的公正性?
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您现在是某个委员会或部门的成员吗?该委员会或部门是否与作者有关联? |
金融
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你是否与任何作者有商业或专业合作关系?
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您是否与参与本研究或稿件准备的任何组织有经济利益或业务关系?
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您是否在稿件内容中有任何经济利益或竞争性利益,可能会影响您进行客观评审的能力? |
资金信息披露
所有资助来源的详细信息必须在手稿的资助部分提供,包括资助编号,如果适用的话。所有前沿雷竞技rebat文章均在CC-BY创作共用署名许可下以开放获取方式发布。发表在《前沿》杂志上的文章自动达到或超过许多机构雷竞技rebat和资助机构规定的开放获取要求,包括美国国立卫生研究院、医学研究理事会、英国研究理事会和威康信托基金会。雷竞技rebatFrontiers向Open Funder Registry提交资助数据,Open Funder Registry是CrossRef提供的资助人识别服务,由学术出版商和资助机构合作产生。
免责声明
任何必须包含在发表文章中的必要的免责声明都应在手稿中明确注明。
研究伦理
所有提交给《前沿》考虑的研究必须按照《前沿》研究伦理雷竞技rebat准则进行。按照应对《前沿》杂志保留拒绝任何雷竞技rebat编辑认为不符合高伦理标准的稿件的权利,即使作者已经获得伦理批准或不需要伦理批准。雷竞技rebat前沿鼓励作者遵循到达指南用于科学研究的设计、分析和报告。
副编辑和评论编辑可参考我们的研究伦理审查:编辑和审稿人指南有关如何评估审稿中关于生物伦理学的更多信息。
涉及动物的研究
所有涉及受管制动物(即所有活脊椎动物和高级无脊椎动物)的研究必须在开始研究之前经过伦理委员会的审查和批准,并按照相关机构和国家准则和法规进行。雷竞技rebat《前沿》是根据国际兽医编辑协会(兽医)发表研究(包括动物研究)的指引。根据美国兽医协会的规定,涉及动物和常规护理之外干预措施的临床研究需要伦理委员会的监督。作者必须在提交系统中提供伦理批准信息,这将生成一份伦理声明,并包含在提交中。生成的伦理声明将包含在审稿人文件中,格式如下:
“这项动物研究得到了[伦理委员会的全名和隶属关系]的审查和批准。”
如果研究被免除伦理批准,作者需要在生成的声明中说明免除的原因。涉及客户拥有的动物(如宠物或家畜等非商业动物)的研究应证明最佳的兽医护理实践,并确认所有者或所有者的法定代表已授予书面知情同意。下面是一个涉及客户拥有的动物的研究生成的语句示例:
“这项动物研究由[伦理委员会的全称和隶属关系]审查和批准。我们获得了主人的书面知情同意,让他们的动物参与这项研究。”
涉及动物的研究应根据国际公认的标准进行,并应遵守3r原则(Replace, Reduce, Refine)。雷竞技rebat《前沿》认可到达指南(动物研究:活体实验报告)用于报告涉及活体动物的实验。鼓励作者使用arrival检查表,并将此检查表与涉及动物研究的手稿一起提交;雷竞技rebat《前沿》编辑保留索取这份清单的权利。
如果一项研究中描述的实验细节偏离了动物研究的常见做法,编辑可以要求额外的文件,包括批准表格和/或文献中的相关引用。编辑还保留拒绝稿件的权利,如果研究涉及的协议与普遍接受的动物福利规范不一致,独立于伦理委员会的批准或以前发表的使用此类协议的文章。
建议作者参考美国兽医协会(AVMA)的《动物安乐死指南》(2020),以获得关于动物麻醉和安乐死的兽医最佳实践的指导。涉及水合氯醛、乙醚和氯仿过量的安乐死方案的研究是强烈不鼓励的。鼓励作者提供在研究中进行的任何麻醉、手术或安乐死手术的完整描述。
人道的端点
所有描述以死亡为终点的研究的手稿都将受到额外的伦理考虑。雷竞技rebat《前沿》保留拒绝有正当理由的稿件的权利。
涉及人类受试者的研究
涉及人体的研究本应按照世界医学协会的规定进行赫尔辛基宣言.涉及人类参与者的研究必须按照相关机构和国家准则进行,并得到相关机构伦理委员会的事先批准和所有参与研究的人类受试者的知情书面同意,包括结果的发表。在向Frontiers投稿时,需要确认这一批准;雷竞技rebat作者必须在提交系统中提供伦理委员会信息,该信息将生成一份伦理声明,并包含在提交的文件中。应在提交系统中提供有关受试者(或在适当情况下,父母或监护人)同意参与的信息。雷竞技rebat《前沿》(Frontiers)要求参与同意书必须是知情的和书面的,除非被道德委员会放弃或当地法律不要求。提交系统将生成以下格式的伦理声明(该声明也将包含在最终手稿版本中以供出版):
“涉及人类参与者的研究由[伦理委员会的全称和隶属关系]审查和批准。患者/参与者提供了参与本研究的书面知情同意书。”
如果研究不受伦理批准或同意程序的限制,作者需要在生成的声明中清楚地说明原因。雷竞技rebat如果委员会已经放弃了全面的审查和批准,Frontiers可能会要求作者提供一封来自伦理委员会的信件。
为了保护受试者的匿名性,除非这些信息对于科学目的是绝对必要的,并且已经得到受试者的明确批准,否则不应该在手稿中包含识别信息。
包含可识别的人类数据
雷竞技rebat《前沿》遵循ICMJE建议关于研究参与者的保护,其中规定患者有隐私权,未经知情同意不得侵犯。我们要求在所有稿件中删除非必要的身份识别细节,如果对能否保持匿名有任何疑问,则需要书面知情同意。
研究人员和作者有责任确保这些原则得到遵守,包括在发表任何可能可识别的数据或图像时获得书面知情同意。
书面知情同意可以记录在机构或道德委员会提供的表格上,并且必须清楚地说明如何使用可识别数据。雷竞技rebat前沿的同意书可用于此目的,但如果符合ICMJE的另一种同意形式,则不需要建议,使用。我们认为,在填写同意书之前,作者有责任鼓励需要同意发表的参与者或患者阅读和理解ICMJE指南,以获取他们的信息。还应鼓励参与者提出任何问题,并确保他们在签署同意书之前感到舒服。
填写完整的同意书应由作者或其所属机构按照机构政策保存。填写完整的表格不应包含在您的Frontiers提交中。雷竞技rebat但是,在评审过程中或出版后,应应编辑或编辑部的要求提供同意书。
我们的编辑和编辑部员工有权决定哪些是可识别数据,如果无法提供所需的同意文件,稿件可能会被拒绝。请注意,所有病例报告文章中患者或受试者的身份已被识别或可识别,均需书面知情同意方可发表。应在提交系统中提供关于参与者/患者是否同意发表可识别数据的信息。这将产生一份伦理声明,将直接包括在手稿中。
临床试验
世界卫生组织(卫生组织)国际临床试验注册平台(ICTRP)将临床试验定义为“任何前瞻性地将人类参与者或人类群体分配到一种或多种与健康有关的干预措施,以评估对健康结果的影响的研究。”根据国际医学期刊编辑委员会的临床试验注册声明(ICMJE),所有临床试验均须于参加者报名时或之前在公开试验注册处登记。为了满足ICMJE和Frontiers的要求,临床试验可以在中国的任何一级注册中心进雷竞技rebat行注册世卫组织注册网络或者ICMJE批准注册.
临床试验报告应符合临床试验报告综合标准(配偶),包括一个流程图,展示了注册、干预分配、随访和数据分析,以及每个受试者的数量,并考虑到CONSORT检查表中报告随机临床试验时要包括的项目。
论文摘要中必须包含临床试验注册信息(Unique Identifier和URL)。
材料和数据政策
雷竞技rebat前沿科技致力于开放科学和开放数据;我们要求作者提供与稿件结论相关的所有数据。生成的数据应公开,并按照我们下面的“数据引用指南”进行引用。我们的目标是在数据可用性方面达到最佳的社区标准,确保我们发表的文章的透明度和可重复性提高。
我们关于数据可用性的政策是根据社区驱动的标准制定的,这些标准是Frontiers认可的,例如透明度和公开性(TOP)。雷竞技rebat的指导方针以及联合声明所产生的数据引用原则FORCE11.
材料的可获得性
作者必须将用于进行研究的所有材料提供给其他研究人员。重现实验所必需的研究材料应在材料和方法部分明确注明。相关材料,如协议、分析方法和研究材料,最好上传到提供全局持久链接/标识符的在线存储库。如果这是不可能的,强烈鼓励作者在要求时将此材料提供给感兴趣的研究人员,这应该在手稿中说明。
资源识别计划
希望参加FORCE11的作者资源识别计划请在当前稿件中使用相应的目录号和研究资源标识符(RRID)引用抗体、转基因生物、软件工具、数据、数据库和服务。关于该项目的更多信息以及如何搜索RRID,可以在这里找到在这里.
数据的可用性
雷竞技rebat《前沿》要求作者为任何合格的研究人员提供所描述的发现背后的“最小数据集”,并用于得出手稿的结论。数据应该是公平的——可查找、可访问、可互操作和可重用——以便其他研究人员可以定位和使用数据。但是,如果数据因法律或道德原因不能公开,则允许例外。
为了遵守其研究领域的最佳实践,作者必须在发表时将特定类型的数据提供给读者,这些数据位于特定的、稳定的、由社区支持的存储库中,例如下面列出的存储库。鼓励作者联系我们的数据可用办公室datapolicy@雷竞技rebatfrontiersin.org在提交任何有关数据报告的查询之前。
我们强烈鼓励共享最大数量的数据;但是,如果存在道德、法律或隐私问题,则不应共享数据。在部分或全部数据因法律、道德或隐私限制而不能共享的情况下,作者应在提交时在数据可用性声明中明确说明这些限制。
公开数据的可能限制包括患者保密和参与者隐私。作者应确保共享的数据符合参与者就使用机密/可识别人类数据所提供的道德同意。我们要求作者证明,这些数据的发布不会损害参与者的匿名性或违反当地的数据保护法律。
在为保护机密或专有信息而限制访问的情况下,作者必须解释对数据集的限制,并应第三方的许可要求提供数据。数据可用性声明应包括请求访问数据集的所有必要联系信息。
数据引用指南
数据引用指南鼓励作者引用本研究中生成或分析的所有数据集。在引用数据集的地方,它们应该包括在参考文献列表中,以最大限度地提高未来的可用性。
应使用以下格式:
[数据集]作者名称。(年)数据名称。库名称。的版本。持续的标识符
数据可用性声明
数据可用性声明在Frontiers上发表的所有文章都需要数据可用性声明。雷竞技rebat在提交过程中,作者将被要求详细说明手稿中得出的结论所依据的原始数据的位置,以及在发表后是否会向其他研究人员提供。作者还将被要求提供手稿中已分析的任何现有数据集的详细信息。这些数据集应按照我们的数据引用指南引用。
使用提交表格中提供的信息,将自动生成一份声明;但是,包含不完整或不正确陈述的稿件将被阻止进入审查过程。
可接受语句的例子
原始数据集可在一个公共可访问的存储库中获得:
该研究中提出的原始贡献是公开的。这些数据可以在这里找到:[链接/登录号]。现有数据集可在一个公共可访问的存储库中使用:
本研究分析了公共数据集。这些数据可以在这里找到:[链接/登录号]。现有公开可访问数据集的信息包含在文章中(例如使用超过10个登录号的研究):
本研究中提供的数据集可以在在线存储库中找到。存储库/存储库的名称和存取号可在条款/补充材料中找到。所有相关数据都包含在文章中:
本研究中提出的原始贡献已包含在文章/补充材料中,进一步查询可向通讯作者咨询。限制适用于数据集:
本文中提供的数据集不是现成的,因为[有效原因]。访问数据集的请求应定向到[文本输入]。已从第三方获取数据:
本研究中分析的数据来自[SOURCE],适用于以下许可/限制[restrictions]。访问这些数据集的请求应直接发送到[NAME, EMAIL]。数据集可按要求提供:
支持本文结论的原始数据将由作者提供,毫无保留地提供。
必须的数据和推荐的存储库
在发表相关的Frontiers手稿之前,作者必须将以下强制性数据类型存入公共的、社区支持的存储库中,例如下面列出的那些。雷竞技rebat
数据类型 | 所需的存储库 | 元数据标准 |
---|---|---|
遗传和基因组序列(DNA/RNA)* |
基因库
日本DNA数据库(DDBJ)
欧洲核苷酸档案(ENA) |
拌 |
宏基因组序列 |
EBI宏基因组 |
拌 |
DNA和RNA追踪或短读测序数据 |
NCBI Trace Archive NCBI序列
读取存档 |
拌 |
遗传多态性数据,包括SNP和CNV数据 |
dbSNP
dbVar
欧洲变异档案
DGVa |
拌 |
基因表达数据;染色质免疫沉淀数据(深度测序或微阵列) |
ArrayExpress
基因表达综合(GEO) |
Miame / minseqe |
将基因型与表型联系起来的数据 |
dbGaP |
|
蛋白质序列数据 |
UniProt |
|
蛋白质组分析数据 |
骄傲
PeptideAtlas
ProteomeXchange |
MIAPE |
小分子、蛋白质、蛋白质复合物数据结构数据 |
晶体学开放数据库
剑桥结构数据库
蛋白质数据库
电子显微镜数据库 |
CIF |
分类数据 |
Zoobank |
*基因序列变异应根据遗传遗传研究所制定的指南加以注释人类多样性项目.
鼓励作者考虑将下面列出的数据类型存储在公共的、由社区支持的存储库中。
数据类型 | 推荐的存储库 | 元数据标准 |
---|---|---|
蛋白质-蛋白质相互作用数据 |
相互作用蛋白质数据库(DIP) |
MIMIx |
代谢物和代谢组分析数据 |
MetaboLights
人体代谢组数据库 |
MSI |
小分子筛选数据;化合物数据 |
PubChem |
CIF |
流式细胞术数据 |
流库 |
|
脑成像数据;神经影像数据 |
OpenNeuro
英蒂
NITRC
神经vault[统计地图] |
投标 |
特征数据 |
试数据库 |
|
物候学数据 |
全国物候网络 |
|
任何数据 |
Figshare
森林数字存储库 |
没有一个 |
酶学和生物催化数据 |
STRENDA数据库 |
RNAseq数据的包含
使用RNASeq进行比较转录组分析的研究必须包含至少三个生物学重复(除非另有理由)。每个生物复制应该在一个独立的库中表示,如果库是多路复用的,则每个库都具有唯一的条形码。也强烈建议对研究中强调的一些关键转录本进行验证。
这些实验的完整数据必须在提交时以免费资源的形式提供给审稿人,例如Sequence Read Archive (SRA)或欧洲核苷酸档案(ENA).根据手稿中处理的问题,转录组的从头组装也可能需要多个复制,并且组装的序列和序列注释必须免费提供,例如在figshare或德律阿得斯.
包含蛋白质组学数据
作者应提供有关如何进行肽/蛋白匹配的相关信息,包括用于处理和分析数据的方法,大规模研究的错误发现率(FDR),以及肽和蛋白匹配的阈值或截止率。进一步的信息应包括所使用的软件、质谱仪类型、序列数据库和版本、数据库中的序列数量、处理方法、用于匹配的质量公差、可变/固定修改、允许遗漏的解理等。
作者应提供用于鉴定蛋白质和/或多肽的信息作为补充材料。这应该包括加入数、观察到的质量(m/z)、电荷、δ质量、匹配质量、肽/蛋白得分、肽修饰、缺切、肽序列、匹配等级、匹配物种(用于跨物种匹配)、肽匹配数量等信息。应指出模棱两可的蛋白质/肽匹配。
对于定量蛋白质组学分析,作者应提供证明统计学显著性的信息,包括生物学重复、统计方法、不确定性估计和计算误差所使用的方法。
对于与生物学相关的翻译后修饰(PTMs)的肽匹配,以及使用单一质谱进行的任何蛋白质匹配,作者应将此信息作为原始数据或注释光谱,或将数据提交到在线存储库(推荐选项;见下表)。
原始或匹配的数据和2-DE图像应提交给公共蛋白质组库,如参与ProteomeXchange的数据库。投稿代码和/或数据链接应在稿件中提供。
包括酶学和生物催化数据
我们鼓励作者在报告和发布酶动力学数据时参考酶学数据报告标准(STRENDA)指南。STRENDA指南旨在支持作者全面报告酶活性研究的动力学和平衡数据。以下是科学出版物中需要提供的参数的散文描述。
所有的动力学和结合数据报告必须包括催化实体或结合实体(酶、蛋白质、核酸或其他分子)的特性描述。这些信息应包括分子的起源或来源、纯度、组成和其他特征,如翻译后修饰、突变以及为促进表达或纯化而进行的任何修饰。如果是一种新的测定方法,或作为以前发表的工作的参考,必须充分描述测定方法和准确的实验条件,无论是否经过修改。
测定的温度、pH值和压力(如果不是大气压)必须包括在内,即使之前已经发表过。在无法检测到催化活性或结合的情况下,应根据灵敏度和误差分析提供检测限度的估计。应该避免使用模棱两可的术语,如“不可检测到”。应包括用于数据分析的软件描述以及所有参数的计算误差。
一阶和二阶速率常数应分别以s-1和M-1•s-1为单位报告。平衡结合常数通常应以浓度为单位(M, mM,µM, nM)的解离常数报告。稳态酶动力学的值kcat、kcat/Km和Km应分别以s-1、M-1•s-1和浓度(mM、µM、nM)为单位报告。酶的稳态比活性通常用kcat表示。如果催化剂的摩尔浓度有很大的不确定性,比活性应报告为单位时间内每一定量蛋白质所形成的产物的Vmax (nmol,µmol)(例如µmol•mg-1•s-1)。
正确描述分析条件所需的最低信息可以在列表1A中找到,酶活性数据可以在列表1B中找到。
代码
雷竞技rebat前沿科技致力于开放科学和开放数据;我们要求作者将所有用于进行研究的代码提供给其他研究人员。重现实验所需的代码应在材料和方法部分中明确指出,并且在可能的情况下,代码应上传到在线存储库(如github.com或Code ocean),提供一个全局持久链接/标识符。
我们关于代码可用性的政策是由社区驱动的标准告知的,这些标准是Frontiers认可的,例如透明度和开放性(TOP)。雷竞技rebat的指导方针以及联合声明所产生的数据引用原则FORCE11.
我们强烈鼓励在可能的情况下共享原始代码。在自定义代码是专有的情况下,将允许例外,前提是复制研究结果所需的所有相关软件都可供研究人员在商业上购买。所使用的专有软件的细节应在材料和方法部分列出。
提交时,作者应在利益冲突声明中声明与代码和自己有关的任何知识产权。
统计数据
雷竞技rebat《前沿》要求所有关于数量差异的陈述都应基于定量数据和统计检验。例如,如果基于western blot对某种蛋白质的丰度做出了定量陈述,我们要求扫描该blot,并使用正确的分析软件(如ImageJ)和统计学对丰度进行定量评估,以支持该陈述。
独立实验应该/必须应用统计学。独立样本的数量和偏差参数(如均值的标准误差、标准差、置信区间)应在方法或方法中明确规定
图的传说。一般来说,单个实验中的技术重复不被认为是独立的样本。如果采用多重比较(如微阵列数据或全基因组关联研究),任何分析都应纠正假阳性结果。统计程序的说明应包括所使用的软件和分析,而且必须足够详细,以便再现。
实验
作者需要在他们的图例中具体说明实验进行了多少次(通常我们要求n=3作为最小值),以及进行了哪些具体的统计分析。
图像处理
雷竞技rebat《前沿》杂志严肃对待图像处理问题。我们不接受修改图像中的个别特征(包括增强、模糊、移动、回收、删除或添加)。图像处理方法(如亮度、对比度或颜色平衡的变化)必须应用于图像中的每个像素,并且这些变化不应改变图中所示的信息。裁剪图像应避免在可能的凝胶和污渍。如果以图形显示裁剪图像,则必须将整个原始凝胶的完整扫描作为补充材料的一部分提交。如果为了说明目的而重用控件图像,则必须在图图例中明确声明。如果数据解释合法地需要任何形式的图像处理,则必须在文稿的方法部分声明软件和增强技术。图片分组拼接必须在稿件和图文中明确说明。
我们的人工智能审查助理(AIRA)经过训练,可以检测特定类型的回收、修改和操作。任何对未经声明的图像修改提出的担忧将被调查,作者将被要求提供原始图像和数据。作者未能充分解决这些问题将导致稿件被拒绝,这个问题可能会向作者所在的机构提出。
支持
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